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Mejora de los estudios de correlación diagnóstica y fenotipo-genotipo en pacientes con miopatía con sospecha de titinopatía (DIAMYOTIT)

23 de febrero de 2024 actualizado por: University Hospital, Montpellier
Debido al uso generalizado de NGS, TTN está emergiendo como un gen causal importante en los trastornos neuromusculares, con una gran heterogeneidad clínica. Los mecanismos subyacentes a la variabilidad fenotípica y el modo de herencia (recesivo o dominante) de las titinopatías son poco conocidos. Implican las funciones estructurales primordiales de la titina en la formación y estabilidad del sarcómero, así como sus interacciones con otras proteínas. Identificamos por NGS, en pacientes con miopatía esquelética (con o sin miocardiopatía), varias variantes de TTN potencialmente causantes de enfermedad. Los objetivos específicos del presente proyecto son implementar estudios funcionales (transcritos, análisis de proteínas, estudios de interacción proteína-proteína in vitro) para evaluar el efecto de las variantes de TTN en los transcritos y la proteína para realizar estudios de correlación fenotipo-genotipo. Participamos de la "red titina" nacional y de esfuerzos internacionales para la comprensión de las bases moleculares de las titinopatías. La caracterización genómica abre el camino para desarrollar modelos celulares de titinopatía, derivados de biopsias de pacientes. Este es también un primer paso obligatorio para el diseño de nuevos enfoques terapéuticos.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

Las titinopatías son miopatías esqueléticas y cardíacas hereditarias debidas a la alteración de la titina, una proteína elástica gigante del sarcómero. Debido al uso generalizado de la secuenciación de próxima generación (NGS), el gen de la titina (TTN) está emergiendo como un gen causal importante en los trastornos neuromusculares (ENM), con una alta heterogeneidad clínica y alélica. Los mecanismos subyacentes a la variabilidad fenotípica y el modo de herencia recesivo o dominante de las titinopatías son poco conocidos. Implican las funciones estructurales primordiales de la titina sobre la formación y estabilidad del sarcómero, así como sus interacciones con otras proteínas. Los efectos de las variantes en TTN son variables, silenciosos, recesivos o dominantes, y las herramientas bioinformáticas no son realmente eficientes para interpretar su impacto funcional, lo que las hace extremadamente difíciles de interpretar. Además, las variantes de TTN son muy frecuentes en la población general. Debido al gran tamaño (3700 kD) y la complejidad de la titina, los análisis de las consecuencias de las variantes de TTN en las transcripciones y las proteínas no se realizan con frecuencia. Hay pocos equipos en la comunidad internacional, pero ningún equipo en Francia, que proponga análisis de Western-blot (WB) sobre la titina como prueba de diagnóstico. Además, esta prueba permite confirmar el diagnóstico solo para titinopatías recesivas debidas a mutaciones truncantes, que son situaciones raras (

Este proyecto proviene de los resultados de nuestro diagnóstico NGS y será la continuación de un proyecto en curso financiado por AFM (solicitud 19958). Hemos identificado por NGS, en pacientes con miopatía esquelética (con o sin miocardiopatía), varias variantes de TTN potencialmente causantes de enfermedades. Gracias al proyecto financiado por AFM, hemos analizado las consecuencias de algunas variantes de TTN en el empalme y actualmente estamos implementando condiciones experimentales para realizar titin WB. Además, hemos observado que la mayoría de las variantes no truncadas en TTN sospechosas de ser patógenas se encuentran en dominios de titina que interactúan con la cadena pesada de miosina (MHC). Ante la hipótesis de que pudieran tener efectos deletéreos en la estabilidad de las interacciones entre titina y MHC en el sarcómero, planeamos implementar pruebas funcionales para evaluar sus consecuencias en las interacciones titina-miosina.

Los objetivos específicos del presente proyecto serán implementar estudios funcionales para evaluar el efecto de las variantes de TTN en las transcripciones y proteínas para mejorar el enfoque diagnóstico y realizar estudios de correlación con los modos de herencia y los fenotipos. El aspecto innovador del proyecto es la combinación de varios enfoques moleculares y bioquímicos sobre el ARN (evaluación de los efectos sobre la transcripción y/o el empalme de los transcritos de titina en el músculo esquelético de los pacientes), proteína (evaluación de los efectos de todas las variantes de TTN sobre la cantidad de titina y tamaño, mediante análisis de WB en biopsias musculares) e interacciones proteína-proteína (evaluación del impacto patogénico de variantes de TTN ubicadas en dominios de interacción titina-MHC en interacciones con MHC), que implementaremos sobre la base de tecnologías reportadas en proyectos de investigación académica . La fuerza de nuestro proyecto se basa también en nuestra robusta red con neurólogos, neuropediatras, patólogos y otros expertos biológicos, dentro de la organización en un centro de referencia interregional de ENM y en una red nacional de titinopatías, y la implicación en el proyecto de un neurólogo (Dr. Morales) a través de su tesis doctoral, para realizar estudios de correlaciones fenotipo-genotipo.

Los estudios funcionales de las variantes identificadas en el gen TTN deben tener un fuerte impacto en el diagnóstico de los pacientes, lo que es importante para su manejo y consejo genético familiar. Las pruebas implementadas estarán a disposición de la red francesa de titinopatías. Esto debería resolver el diagnóstico de un gran número de pacientes sin un diagnóstico claro, y precisar la frecuencia de afectación de las titinopatías en las miopatías. La mejora del diagnóstico de las titinopatías tendrá un alto impacto socioeconómico porque reducirá el costo debido a las pruebas de diagnóstico iterativas.

Los estudios de correlación fenotipo-genotipo permitirán expandir la mutación y el espectro clínico de las titinopatías y participar en el esfuerzo internacional para comprender las bases moleculares de las titinopatías, que es un primer paso obligatorio para diseñar enfoques terapéuticos. Además, la confirmación genética abre el camino para desarrollar modelos celulares de titinopatía, derivados de los tejidos de los pacientes. Estos modelos serán la base para estudios proteómicos y funcionales para descifrar los mecanismos de las titinopatías y señalar vías metabólicas que podrían ser el objetivo de la terapéutica farmacológica.

Por estas razones, la presente aplicación constituirá un importante, original e innovador desarrollo para contribuir al diagnóstico y al conocimiento de las bases moleculares de las titinopatías.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

50

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Copia de seguridad de contactos de estudio

Ubicaciones de estudio

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Niño
  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

pacientes con sospecha de titinopatía

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Paciente seguido por un neurólogo o un neurólogo pediátrico.
  • Niño o adulto con miopatía congénita o progresiva, proximal o distal
  • Identificación por análisis NGS de variante(s) en el(los) gen(es) TTN potencialmente patógeno(s)
  • Biopsia muscular realizada previamente
  • Recolección de la no oposición del paciente (o uno de sus representantes legales si es menor de edad) para participar en el presente estudio y para la recolección del material biológico necesario (músculo)
  • Paciente afiliado o beneficiario de un régimen de seguridad social

Criterio de exclusión:

  • Ausencia de muestreo muscular

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Solo caso
  • Perspectivas temporales: Futuro

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Pacientes con miopatía con sospecha de titinopatía
Pacientes con miopatía en los que se han identificado previamente una o más variantes de TTN potencialmente patógenas (casos índice y casos relacionados afectados). Biopsia muscular realizada previamente
Análisis de transferencia Western de una proteína gigante, con anticuerpos específicos dirigidos contra C-ter y N-Ter de la proteína
Análisis de varias proteínas que interactúan mediante pruebas específicas de Western-blot e in vitro.
Las muestras utilizadas previamente para la transferencia Western se someterán a análisis de espectrometría de masas.
analizar la expresión de genes musculares en pacientes con titinopatías en nuestra cohorte mediante RNAseq

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Medición de la cantidad relativa de proteína titina
Periodo de tiempo: inscripción
Evaluado por Western blot: normal o no, caracterización de anomalías si las hubiere
inscripción
Medición del tamaño relativo de la proteína titina
Periodo de tiempo: inscripción
Evaluado por Western blot: normal o no, caracterización de anomalías si las hubiere
inscripción

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Medición de las consecuencias sobre las proteínas que interactúan
Periodo de tiempo: durante 2 años
Evaluación por Western blot: normal o no
durante 2 años
Medición de las consecuencias de las variantes de TTN en las transcripciones de titina
Periodo de tiempo: 2 años
Evaluación mediante estudios de RT-PCR a partir de biopsias musculares
2 años
Estudios de correlación fenotipo-genotipo
Periodo de tiempo: 2,5 años
Correlación de datos clinicobiológicos
2,5 años
Análisis de bases moleculares de los diferentes modos de herencia de la enfermedad
Periodo de tiempo: 2,5 años
Análisis integrado de los datos biológicos completos y correlación con los datos familiares
2,5 años
Medición del nivel de interacciones por estudios in vitro
Periodo de tiempo: durante 2 años
Evaluación por Western blot: normal o no
durante 2 años
Evaluar los efectos de las variantes de TTN sobre la cantidad y composición de los péptidos de titina en el músculo esquelético del paciente.
Periodo de tiempo: durante 2 años
Por espectrometría de masas
durante 2 años
Evaluar el impacto de las variantes de TTN en la expresión de titina y el empalme en el músculo esquelético del paciente
Periodo de tiempo: durante 2 años
utilizando el protocolo de selección de cola poli-A para ARNm
durante 2 años
Evaluar el impacto de las variantes de TTN en los niveles de expresión de genes musculares mediante el análisis de expresión de datos de RNAseq
Periodo de tiempo: durante 2 años
El análisis de expresión se puede realizar utilizando el software R y el software DESeq2.
durante 2 años
Evaluar los efectos de las variantes de TTN en las proteínas musculares asociadas.
Periodo de tiempo: durante 2 años
El análisis proteómico cuantitativo, espectrometría de masas, nos permitirá evaluar la cantidad de proteínas musculares y el perfil proteico general en el músculo de los pacientes.
durante 2 años

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

5 de diciembre de 2019

Finalización primaria (Estimado)

5 de diciembre de 2024

Finalización del estudio (Estimado)

5 de mayo de 2025

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

20 de junio de 2019

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

24 de junio de 2019

Publicado por primera vez (Actual)

26 de junio de 2019

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Estimado)

28 de febrero de 2024

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

23 de febrero de 2024

Última verificación

1 de febrero de 2024

Más información

Términos relacionados con este estudio

Palabras clave

Otros números de identificación del estudio

  • RECHMPL18_0077
  • 2018-A02287-48 (Otro identificador: ANSM)

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

NO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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