Questa pagina è stata tradotta automaticamente e l'accuratezza della traduzione non è garantita. Si prega di fare riferimento al Versione inglese per un testo di partenza.

Miglioramento degli studi diagnostici e di correlazione fenotipo-genotipo in pazienti con miopatia sospettata di TITinopatia (DIAMYOTIT)

23 febbraio 2024 aggiornato da: University Hospital, Montpellier
A causa dell'uso diffuso di NGS, TTN sta emergendo come un importante gene causale nei disturbi neuromuscolari, con elevata eterogeneità clinica. I meccanismi alla base della variabilità fenotipica e della modalità di ereditarietà (recessiva o dominante) delle titinopatie sono poco conosciuti. Coinvolgono le funzioni strutturali primordiali della titina sulla formazione e stabilità del sarcomero, così come le sue interazioni con altre proteine. Abbiamo identificato mediante NGS, in pazienti con miopatia scheletrica (con o senza cardiomiopatia), diverse varianti di TTN che potrebbero causare malattie. Gli obiettivi specifici del presente progetto sono l'implementazione di studi funzionali (trascritti, analisi proteiche, studi di interazione proteina-proteina in vitro) per valutare l'effetto delle varianti TTN sui trascritti e sulle proteine ​​al fine di eseguire studi di correlazione fenotipo-genotipo. Partecipiamo al "titin network" nazionale e agli sforzi internazionali per la comprensione delle basi molecolari delle titinopatie. La caratterizzazione genomica apre la strada allo sviluppo di modelli cellulari di titinopatia, derivati ​​dalle biopsie dei pazienti. Questo è anche un primo passo obbligatorio per la progettazione di nuovi approcci terapeutici.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Le titinopatie sono miopatie scheletriche e cardiache ereditarie dovute all'alterazione della titina, una gigantesca proteina elastica del sarcomero. A causa dell'uso diffuso del sequenziamento di nuova generazione (NGS), il gene della titina (TTN) sta emergendo come un importante gene causale nei disturbi neuromuscolari (NMD), con elevata eterogeneità clinica e allelica. I meccanismi alla base della variabilità fenotipica e della modalità di ereditarietà recessiva o dominante delle titinopatie sono poco conosciuti. Coinvolgono le funzioni strutturali primordiali della titina sulla formazione e stabilità del sarcomero, così come le sue interazioni con altre proteine. Gli effetti delle varianti in TTN sono variabili, silenziosi, recessivi o dominanti e gli strumenti bioinformatici non sono realmente efficienti per l'interpretazione del loro impatto funzionale, rendendoli estremamente difficili da interpretare. Inoltre, le varianti TTN sono molto frequenti nella popolazione generale. A causa delle enormi dimensioni (3700 kD) e della complessità della titina, le analisi delle conseguenze delle varianti TTN sui trascritti e sulle proteine ​​non vengono eseguite comunemente. Ci sono poche squadre nella comunità internazionale, ma nessuna squadra in Francia, che propongono analisi Western blot (WB) sulla titina come test diagnostico. Inoltre, questo test consente di confermare la diagnosi solo per titinopatie recessive dovute a mutazioni troncanti, che sono situazioni rare (

Questo progetto deriva dai nostri risultati diagnostici NGS e sarà la continuazione di un progetto finanziato da AFM in corso (domanda 19958). Abbiamo identificato mediante NGS, in pazienti con miopatia scheletrica (con o senza cardiomiopatia), diverse varianti di TTN potenzialmente patogene. Grazie al progetto finanziato da AFM, abbiamo analizzato le conseguenze di alcune varianti TTN sullo splicing e stiamo attualmente implementando le condizioni sperimentali per eseguire il titin WB. Inoltre, abbiamo osservato che la maggior parte delle varianti non troncanti in TTN sospettate di essere patogene si trovano nei domini della titina che interagiscono con la catena pesante della miosina (MHC). Nell'ipotesi che possano avere effetti deleteri sulla stabilità delle interazioni tra titina e MHC nel sarcomero, intendiamo implementare test funzionali per valutarne le conseguenze nelle interazioni titina-miosina.

Gli obiettivi specifici del presente progetto saranno l'implementazione di studi funzionali per valutare l'effetto delle varianti TTN sui trascritti e sulle proteine ​​al fine di migliorare l'approccio diagnostico ed eseguire studi di correlazione con le modalità di ereditarietà ei fenotipi. Aspetto innovativo del progetto è la combinazione di diversi approcci molecolari e biochimici su RNA (valutazione degli effetti sulla trascrizione e/o splicing sui trascritti di titina nel muscolo scheletrico dei pazienti), proteine ​​(valutazione degli effetti di tutte le varianti TTN sulla quantità di titina e dimensione, mediante analisi WB su biopsie muscolari) e interazioni proteina-proteina (valutazione dell'impatto patogenetico delle varianti TTN localizzate nei domini di interazione titina-MHC sulle interazioni con MHC), che implementeremo sulla base delle tecnologie riportate in progetti di ricerca accademici . La forza del nostro progetto si basa anche sulla nostra solida rete con neurologi, neuropediatri, patologi e altri esperti biologici, all'interno dell'organizzazione in un centro di riferimento interregionale di NMD e in una rete nazionale di titinopatie, e il coinvolgimento nel progetto di un neurologo (Dr Morales) attraverso la sua tesi di dottorato, per effettuare studi di correlazioni fenotipo-genotipo.

Gli studi funzionali delle varianti identificate nel gene TTN dovrebbero avere un forte impatto per la diagnosi dei pazienti, che è importante per la sua gestione e consulenza genetica familiare. I test implementati saranno a disposizione della rete francese delle titinopatie. Questo dovrebbe risolvere la diagnosi di un gran numero di pazienti senza una diagnosi chiara e specificare la frequenza del coinvolgimento delle titinopatie nelle miopatie. Il miglioramento della diagnosi delle titinopatie avrà un elevato impatto socio-economico perché ridurrà il costo dovuto ai test diagnostici iterativi.

Gli studi di correlazione fenotipo-genotipo consentiranno di ampliare lo spettro mutazionale e clinico delle titinopatie e di partecipare allo sforzo internazionale per comprendere le basi molecolari delle titinopatie, che è un primo passo obbligato per ideare approcci terapeutici. Inoltre, la conferma genetica apre la strada allo sviluppo di modelli cellulari di titinopatia, derivati ​​dai tessuti dei pazienti. Questi modelli saranno la base per studi proteomici e altri studi funzionali per decifrare i meccanismi delle titinopafie e per indicare le vie metaboliche che potrebbero essere il bersaglio di terapie farmacologiche.

Per questi motivi, la presente domanda costituirà uno sviluppo importante, originale e innovativo per contribuire alla diagnosi e alla conoscenza delle basi molecolari delle titinopatie.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

50

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

pazienti con sospetta titinopatia

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Paziente seguito da un neurologo o da un neurologo pediatrico.
  • Bambino o adulto con miopatia congenita o progressiva, prossimale o distale
  • Identificazione mediante analisi NGS di varianti nei geni TTN potenzialmente patogeni
  • Biopsia muscolare eseguita in precedenza
  • Raccolta della non opposizione del paziente (o di un suo legale rappresentante se minorenne) alla partecipazione al presente studio e al prelievo del necessario materiale biologico (muscolo)
  • Paziente affiliato o beneficiario di un regime previdenziale

Criteri di esclusione:

  • Assenza di campionamento muscolare

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Solo caso
  • Prospettive temporali: Prospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti con miopatia sospettata di titinopatia
Pazienti con miopatia in cui sono state precedentemente identificate una o più varianti TTN potenzialmente patogene (casi indice e casi correlati interessati). Biopsia muscolare eseguita in precedenza
Analisi Western blot di una proteina gigante, con anticorpi specifici diretti contro C-ter e N-Ter della proteina
Analisi di diverse proteine ​​interagenti mediante specifici test Western-blot e in vitro.
i campioni precedentemente utilizzati per il western blotting verranno sottoposti ad analisi di spettrometria di massa
analizzare l'espressione genica muscolare nei pazienti con titinopatie nella nostra coorte mediante RNAseq

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Misurazione della quantità relativa di proteina titina
Lasso di tempo: iscrizione
Valutato mediante Western blot: normale o no, caratterizzazione delle eventuali anomalie
iscrizione
Misurazione della dimensione relativa della proteina titina
Lasso di tempo: iscrizione
Valutato mediante Western blot: normale o no, caratterizzazione delle eventuali anomalie
iscrizione

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Misura delle conseguenze sulle proteine ​​interagenti
Lasso di tempo: durante 2 anni
Valutazione mediante Western blot: normale o no
durante 2 anni
Misura delle conseguenze delle varianti TTN sui trascritti di titina
Lasso di tempo: 2 anni
Valutazione mediante studi RT-PCR da biopsie muscolari
2 anni
Studi di correlazione fenotipo-genotipo
Lasso di tempo: 2,5 anni
Correlazione dei dati clinicobiologici
2,5 anni
Analisi delle basi molecolari delle diverse modalità di trasmissione della malattia
Lasso di tempo: 2,5 anni
Analisi integrate del dato biologico completo e correlazione con il dato familiare
2,5 anni
Misurazione del livello di interazioni mediante studi in vitro
Lasso di tempo: durante 2 anni
Valutazione mediante Western blot: normale o no
durante 2 anni
Valutare gli effetti delle varianti TTN sulla quantità e sulla composizione dei peptidi di titina nel muscolo scheletrico del paziente
Lasso di tempo: durante 2 anni
Mediante spettrometria di massa
durante 2 anni
Valutare l'impatto delle varianti TTN sull'espressione della titina e sullo splicing nel muscolo scheletrico del paziente
Lasso di tempo: durante 2 anni
utilizzando il protocollo di selezione della coda poli-A per gli mRNA
durante 2 anni
Valutare l'impatto delle varianti TTN sui livelli di espressione genica muscolare mediante analisi dell'espressione dei dati RNAseq
Lasso di tempo: durante 2 anni
L'analisi delle espressioni può essere eseguita utilizzando il software R e il software DESeq2.
durante 2 anni
Valutare gli effetti delle varianti TTN sui partner proteici muscolari.
Lasso di tempo: durante 2 anni
L'analisi proteomica quantitativa, la spettrometria di massa, ci consentirà di valutare la quantità di proteine ​​muscolari, il profilo proteico complessivo, nel muscolo dei pazienti
durante 2 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

5 dicembre 2019

Completamento primario (Stimato)

5 dicembre 2024

Completamento dello studio (Stimato)

5 maggio 2025

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

20 giugno 2019

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

24 giugno 2019

Primo Inserito (Effettivo)

26 giugno 2019

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Stimato)

28 febbraio 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

23 febbraio 2024

Ultimo verificato

1 febbraio 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Altri numeri di identificazione dello studio

  • RECHMPL18_0077
  • 2018-A02287-48 (Altro identificatore: ANSM)

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Macchia occidentale

Sottoscrivi