Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Diagnosztikai és fenotípus-genotípus korrelációs vizsgálatok javítása TITinopathiára gyanús myopathiában szenvedő betegeknél (DIAMYOTIT)

2024. február 23. frissítette: University Hospital, Montpellier
Az NGS széles körben elterjedt alkalmazása miatt a TTN a neuromuszkuláris rendellenességek fő okozói génjévé válik, nagy klinikai heterogenitással. A titinopátiák fenotípusos variabilitásának és öröklődési módjának (recesszív vagy domináns) hátterében álló mechanizmusok kevéssé ismertek. Ezek magukban foglalják a titin elsődleges szerkezeti funkcióit a szarkomer kialakulásában és stabilitásában, valamint más fehérjékkel való kölcsönhatásait. NGS segítségével csontváz myopathiában (kardiomiopátiával vagy anélkül) szenvedő betegekben számos potenciálisan betegséget okozó TTN variánst azonosítottunk. Jelen projekt specifikus céljai közé tartozik funkcionális vizsgálatok (transzkriptumok, fehérjeanalízisek, in vitro fehérje-fehérje interakciós vizsgálatok) megvalósítása a TTN variánsok transzkriptumokra és fehérjére gyakorolt ​​hatásának értékelésére, fenotípus-genotípus korrelációs vizsgálatok elvégzése érdekében. Részt veszünk a nemzeti "titin hálózatban" és a titinopátiák molekuláris alapjainak megértésére irányuló nemzetközi erőfeszítésekben. A genomikai jellemzés megnyitja az utat a titinopátia sejtmodelljei kifejlesztéséhez, amelyek a páciens biopsziáiból származnak. Ez egyben kötelező első lépés az új terápiás megközelítések megtervezéséhez.

A tanulmány áttekintése

Részletes leírás

A titinopátiák örökletes csontváz- és szívmiopátiák, amelyek a titin, a szarkomer óriás rugalmas fehérje megváltozása következtében alakulnak ki. A következő generációs szekvenálás (NGS) széles körben elterjedt alkalmazása miatt a titin gén (TTN) a neuromuszkuláris rendellenességek (NMD) fő okozói génjévé válik, nagy klinikai és allél heterogenitással. A titinopátiák fenotípusos variabilitásának és recesszív vagy domináns öröklődési módjának hátterében álló mechanizmusok kevéssé ismertek. Ezek magukban foglalják a titin primordiális szerkezeti funkcióit a szarkomer kialakulásában és stabilitásában, valamint más fehérjékkel való kölcsönhatásait. A variánsok hatásai a TTN-ben változóak, csendesek, recesszívek vagy dominánsak, a bioinformatikai eszközök pedig nem igazán hatékonyak funkcionális hatásuk értelmezésére, így rendkívül nehezen értelmezhetőek. Ezenkívül a TTN-változatok nagyon gyakoriak az általános populációban. A titin hatalmas mérete (3700 kD) és összetettsége miatt a TTN-variánsok transzkriptumokra és fehérjékre gyakorolt ​​következményeit nem gyakran vizsgálják. A nemzetközi közösségben kevés olyan csapat van, Franciaországban viszont nincs olyan csapat, amely a titin Western-blot (WB) elemzését javasolná diagnosztikai tesztként. Ezen túlmenően ez a teszt csak a csonkoló mutációk miatt kialakuló recesszív titinopátiák diagnózisának megerősítését teszi lehetővé, amelyek ritka helyzetek (

Ez a projekt az NGS diagnosztikai eredményeinkből származik, és egy folyamatban lévő AFM által finanszírozott projekt folytatása lesz (19958-as pályázat). Az NGS segítségével csontváz myopathiában szenvedő betegekben (kardiomiopátiával vagy anélkül) számos potenciálisan betegséget okozó TTN változatot azonosítottunk. Az AFM által finanszírozott projektnek köszönhetően elemeztük egyes TTN-változatok splicingre gyakorolt ​​hatását, és jelenleg kísérleti feltételeket vezetünk be a titin WB elvégzéséhez. Ezenkívül megfigyeltük, hogy a TTN-ben a legtöbb nem csonkoló variáns, amelyről feltételezhető, hogy patogén, a miozin nehéz lánccal (MHC) kölcsönhatásba lépő titin doménekben található. Abban a hipotézisben, hogy káros hatással lehetnek a titin és az MHC közötti kölcsönhatások stabilitására a szarkomerben, funkcionális tesztek végrehajtását tervezzük a titin-miozin kölcsönhatások következményeinek értékelésére.

A jelen projekt konkrét célja a TTN variánsok transzkriptumokra és fehérjékre gyakorolt ​​hatásának értékelésére szolgáló funkcionális vizsgálatok végrehajtása a diagnosztikai megközelítés javítása, valamint az öröklődési módokkal és a fenotípusokkal való korrelációs vizsgálatok elvégzése. A projekt innovatív aspektusa az RNS több molekuláris és biokémiai megközelítésének kombinációja (a betegek vázizomzatában a titin transzkriptumainak transzkripciójára és/vagy splicingre gyakorolt ​​hatásainak értékelése), fehérje (az összes TTN variáns titin mennyiségre gyakorolt ​​hatásának értékelése). és méret, WB elemzésekkel izombiopsziákon) és fehérje-fehérje kölcsönhatások (a titin-MHC kölcsönható doménekben található TTN variánsok patogén hatásának felmérése az MHC-vel való interakciókra), amelyeket az akadémiai kutatási projektekben bemutatott technológiák alapján fogunk megvalósítani. . Projektünk erőssége a neurológusokkal, neuro-gyermekorvosokkal, patológusokkal és más biológiai szakértőkkel kialakított erős hálózatunkon is alapul, a szervezeten belül az NMD-k interregionális referenciaközpontjában és a titinopátiák nemzeti hálózatában, valamint a projektben egy neurológus (Dr. Morales) doktori disszertációja révén fenotípus-genotípus korrelációs vizsgálatok elvégzésére.

A TTN génben azonosított variánsok funkcionális vizsgálatának erős hatást kell gyakorolnia a betegek diagnosztizálására, ami fontos a kezelés és a családi genetikai tanácsadás szempontjából. A végrehajtott tesztek elérhetőek lesznek a francia titinopátiák hálózata számára. Ennek meg kell oldania nagyszámú beteg diagnózisát egyértelmű diagnózis nélkül, és meg kell határoznia a titinopátiák myopathiákban való érintettségének gyakoriságát. A titinopátiák diagnózisának javítása jelentős társadalmi-gazdasági hatással jár, mivel csökkenti az iteratív diagnosztikai tesztek költségeit.

A fenotípus-genotípus korrelációs vizsgálatok lehetővé teszik a titinopátiák mutációs és klinikai spektrumának bővítését, valamint a titinopátiák molekuláris alapjainak megértésére irányuló nemzetközi erőfeszítésben való részvételt, ami a terápiás megközelítések kidolgozásának kötelező első lépése. Ezenkívül a genetikai megerősítés megnyitja az utat a titinopátia sejtmodelljeihez, amelyek a betegek szöveteiből származnak. Ezek a modellek képezik majd a proteomikai és egyéb funkcionális vizsgálatok alapját a titinopátiák mechanizmusának megfejtésére, és olyan metabolikus útvonalakra való rámutatására, amelyek a farmakológiai terápia célpontjai lehetnek.

Ezen okok miatt a jelen bejelentés jelentős, eredeti és innovatív fejlesztést jelent, amely hozzájárul a titinopátiák diagnózisához és molekuláris alapjainak megismeréséhez.

Tanulmány típusa

Megfigyelő

Beiratkozás (Becsült)

50

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi kapcsolat

Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését

Tanulmányi helyek

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

  • Gyermek
  • Felnőtt
  • Idősebb felnőtt

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Mintavételi módszer

Nem valószínűségi minta

Tanulmányi populáció

titinopátia gyanújával rendelkező betegek

Leírás

Bevételi kritériumok:

  • A beteget neurológus vagy gyermekneurológus követi.
  • Veleszületett vagy progresszív, proximális vagy disztális myopathiában szenvedő gyermek vagy felnőtt
  • A potenciálisan patogén TTN-gén(ek)ben lévő variáns(ok) azonosítása NGS-analízissel
  • Korábban végzett izombiopszia
  • A beteg (vagy kiskorú törvényes képviselője) nem tiltakozásának összegyűjtése a jelen vizsgálatban való részvétel és a szükséges biológiai anyag (izom) összegyűjtése érdekében
  • Társadalombiztosítási rendszerhez csatlakozott vagy abból részesülő beteg

Kizárási kritériumok:

  • Izommintavétel hiánya

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

  • Megfigyelési modellek: Csak esetre
  • Időperspektívák: Leendő

Kohorszok és beavatkozások

Csoport / Kohorsz
Beavatkozás / kezelés
Titinopathia gyanúja miatt myopathiában szenvedő betegek
Olyan myopathiában szenvedő betegek, akiknél korábban egy vagy több potenciálisan patogén TTN-változatot azonosítottak (indexes esetek és kapcsolódó esetek érintettek). Korábban végzett izombiopszia
Egy óriási fehérje Western-blot analízise a fehérje C-ter és N-Ter ellen irányuló specifikus antitestekkel
Számos kölcsönható fehérje elemzése specifikus Western-blot és in vitro tesztekkel.
a korábban Western blothoz használt mintákat tömegspektrometriás elemzésnek vetik alá
RNAseq segítségével elemezzük kohorszunkban titinopátiás betegek izomgénexpresszióját

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
A titin fehérje relatív mennyiségének mérése
Időkeret: beiratkozás
Western blot módszerrel értékelve: normális vagy nem, az anomáliák jellemzése, ha vannak
beiratkozás
A titin fehérje relatív méretének mérése
Időkeret: beiratkozás
Western blot módszerrel értékelve: normális vagy nem, az anomáliák jellemzése, ha vannak
beiratkozás

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
A kölcsönható fehérjékre gyakorolt ​​hatások mérése
Időkeret: 2 év alatt
Western blot értékelés: normális vagy nem
2 év alatt
A TTN variánsok titin transzkriptumokra gyakorolt ​​következményeinek mérése
Időkeret: 2 év
Értékelés RT-PCR vizsgálatokkal izombiopsziákból
2 év
Fenotípus-genotípus korrelációs vizsgálatok
Időkeret: 2,5 év
Klinikobiológiai adatok összefüggése
2,5 év
A betegség különböző öröklődési módjának molekuláris alapjainak elemzése
Időkeret: 2,5 év
A teljes biológiai adatok integrált elemzése és korrelációja a családi adatokkal
2,5 év
A kölcsönhatások szintjének mérése in vitro vizsgálatokkal
Időkeret: 2 év alatt
Western blot értékelés: normális vagy nem
2 év alatt
Értékelje a TTN variánsok hatását a titin peptidek mennyiségére és összetételére a páciens vázizomjában
Időkeret: 2 év alatt
Tömegspektrometriával
2 év alatt
Értékelje a TTN-változatok hatását a titin expressziójára és a splicingre a páciens vázizomzatában
Időkeret: 2 év alatt
poli-A farok szelekciós protokollt használva mRNS-ekhez
2 év alatt
Értékelje a TTN-változatok hatását az izomgén-expressziós szintekre az RNAseq adatok expressziós elemzésével
Időkeret: 2 év alatt
Az expresszióanalízis R szoftverrel és DESeq2 szoftverrel végezhető el.
2 év alatt
Értékelje a TTN-változatok hatását az izomfehérje partnerekre.
Időkeret: 2 év alatt
A kvantitatív proteomikai analízis, a tömegspektrometria lehetővé teszi számunkra, hogy felmérjük az izomfehérjék mennyiségét, a teljes fehérjeprofilt a betegek izomzatában
2 év alatt

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Tényleges)

2019. december 5.

Elsődleges befejezés (Becsült)

2024. december 5.

A tanulmány befejezése (Becsült)

2025. május 5.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2019. június 20.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2019. június 24.

Első közzététel (Tényleges)

2019. június 26.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Becsült)

2024. február 28.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2024. február 23.

Utolsó ellenőrzés

2024. február 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Kulcsszavak

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • RECHMPL18_0077
  • 2018-A02287-48 (Egyéb azonosító: ANSM)

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

NEM

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Klinikai vizsgálatok a Genetikai betegség

Klinikai vizsgálatok a Western blot

Iratkozz fel