COVID-19 SARS-CoV-2 の変動性が ICU 入院中の重症患者に与える影響 (SEVARVIR)

背景: SARS-CoV-2 バリアントの出現が COVID-19 の重症度と臨床転帰に与える影響については議論の余地があります。 予備研究では、懸念されるバリアント (VOC) B.1.1.7 に関連する死亡確率が推定されました。 英国のバリアントは、既存のバリアントに関連する値よりも 55% 高くなります。 しかし、別の研究では違いは見つかりませんでした。 ブラジルでは、VOC P1 の感染が若年成人の致死率の増加と関連していることが示唆されています。 他の「懸念される変種」の影響 (ベータ、B.1.351; Delta、B.1.617.2、または最新の Omicron バリアント) または「関心のあるバリアント」(A27、B.1.525、 など）疾患の重症度および重症型の予後については不明です。 より一般的には、さまざまなウイルスタンパク質 (Spike、NSP タンパク質、ORF6 など) の変異パターンを含むウイルス学的特徴がさまざまな免疫応答と関連しているかどうか、およびその後の疾患の重症度は不明です。 今後数か月の間に、自然感染とワクチン接種によって引き起こされる集団免疫圧の結果として、同じまたは新しい変異パターンを持つ新しいバリアントがさまざまな地域で出現し続けるでしょう。 長期にわたるそれらのダイナミクスと疾患の重症度への影響を監視することは、国内および国際的な疾病管理政策を改善するために必要です。

このプロジェクトでは、Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP) によって促進された大規模な前向き多施設観察コホートが実施され、患者の COVID-19 疾患の転帰に対する SARS-CoV-2 の遺伝的多様性の影響が理解されます。重病で。 この研究には、COVID-19 に関連する急性呼吸不全/急性呼吸窮迫症候群 (ARDS) で入院している重症患者が含まれます。 この作業の目的は、この集団に見られる SARS-CoV-2 バリアントを経時的に特徴付け、さまざまな臨床転帰に関連する特定の変異/変異パターンを特定し、表現型的に特徴付けることです (主要な臨床エンドポイントは、1 日あたりの死亡率として定義されます28）。 ウイルス感染性、中和抗体に対する感受性、サイトカイン産生誘導能に対する変異の影響は、実験室で利用可能な適切なモデルで、それぞれインビトロおよびエクスビボで評価されます。 完全長のウイルス ゲノム シーケンスに加えて、社内のショットガン メタゲノミクス法を使用して、SARS-CoV-2 変異が呼吸器トランスクリプトーム発現プロファイルに及ぼす影響と、臨床進化プロファイルとの関係を特徴付けます。

研究のデザイン 前向き多施設観察コホート研究

主な目的: 重度の SARS-CoV-2 感染後の急性呼吸不全のために集中治療室 (ICU) に入院した患者における、特定のウイルス変異/変異パターンと COVID-19 の臨床転帰との関係を解明すること。

研究のスケジュール: 包含期間: 24 ヶ月;参加期間：28日間；合計期間 : 24 か月 + 28 日。