Impacto da Variabilidade SARS-CoV-2 do COVID-19 em Pacientes Hospitalizados em UTI com Doença Grave (SEVARVIR)

Antecedentes: O impacto do surgimento de variantes do SARS-CoV-2 na gravidade e nos resultados clínicos do COVID-19 é controverso. Estudos preliminares estimaram que a probabilidade de morte associada à variante preocupante (VOC) B.1.1.7, a variante do Reino Unido, é 55% superior à associada às variantes pré-existentes. No entanto, nenhuma diferença foi encontrada em outro estudo. No Brasil, sugere-se que a infecção por VOC P1 esteja associada a um aumento na taxa de letalidade em adultos jovens. O efeito de outras "variantes de interesse" (Beta, B.1.351; Delta, B.1.617.2, ou as variantes Omicron mais recentes) ou "variantes de interesse" (A27, B.1.525, etc.) sobre a gravidade da doença e o prognóstico de formas graves é desconhecido. De forma mais geral, não se sabe se as características virológicas, incluindo os padrões mutacionais das diferentes proteínas virais (por exemplo, Spike, proteínas NSP, ORF6), podem estar associadas a uma resposta imune diferente e a gravidade subsequente da doença. Nos próximos meses, novas variantes com os mesmos ou novos padrões mutacionais continuarão a surgir em diferentes áreas geográficas, como resultado da pressão imunológica coletiva induzida pela infecção natural e pela vacinação. Monitorar sua dinâmica ao longo do tempo e seu impacto na gravidade da doença é necessário para refinar as políticas nacionais e internacionais de controle de doenças.

Neste projeto, será realizada uma grande coorte observacional multicêntrica prospectiva promovida pela Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), para entender o efeito da variabilidade genética SARS-CoV-2 no resultado da doença COVID-19 em pacientes com doença grave. O estudo incluirá pacientes gravemente enfermos hospitalizados por insuficiência respiratória aguda/síndrome do desconforto respiratório agudo (SDRA) associada ao COVID-19. O objetivo do trabalho será caracterizar as variantes do SARS-CoV-2 encontradas nesta população ao longo do tempo, e identificar e caracterizar fenotipicamente mutações/padrões mutacionais específicos associados aos diferentes desfechos clínicos (endpoint clínico primário definido como mortalidade no dia- 28). O impacto das mutações na infecciosidade viral, sensibilidade a anticorpos neutralizantes e capacidade de induzir produção de citocinas serão avaliados in vitro e ex-vivo respectivamente, em modelos apropriados disponíveis em laboratório. Além do sequenciamento completo do genoma viral, nosso método interno de metagenômica shotgun será usado para caracterizar o efeito das variações do SARS-CoV-2 nos perfis de expressão transcriptômica respiratória e a relação com os perfis evolutivos clínicos.

Desenho do estudo Estudo de coorte observacional multicêntrico prospectivo

Objetivo principal: Desvendar as relações entre mutações virais/padrões mutacionais específicos e os resultados clínicos da COVID-19 em pacientes internados em unidades de terapia intensiva (UTIs) por insuficiência respiratória aguda após infecção grave por SARS-CoV-2.

Cronograma do estudo: Período de inclusão: 24 meses; Período de participação: 28 dias; Duração total: 24 meses + 28 dias;