Влияние вариабельности COVID-19 SARS-CoV-2 на пациентов, госпитализированных в ОИТ с тяжелым заболеванием (SEVARVIR)

Справочная информация. Влияние появления вариантов SARS-CoV-2 на тяжесть и клинические исходы COVID-19 неоднозначно. Предварительные исследования оценили вероятность смерти, связанную с вызывающим беспокойство вариантом (VOC) B.1.1.7, вариант для Великобритании на 55% выше, чем у ранее существовавших вариантов. Однако в другом исследовании различий обнаружено не было. В Бразилии было высказано предположение, что заражение ЛОС P1 связано с повышенным уровнем летальности среди молодых людей. Влияние других «вариантов беспокойства» (Beta, B.1.351; Delta, B.1.617.2 или самые последние варианты Omicron) или «интересующие варианты» (A27, B.1.525, и др.) о тяжести заболевания и прогнозе тяжелых форм неизвестно. В более общем плане неизвестно, могут ли вирусологические характеристики, включая мутационные модели различных вирусных белков (например, Spike, NSP-белков, ORF6), быть связаны с другим иммунным ответом и последующей тяжестью заболевания. В ближайшие месяцы новые варианты, несущие те же самые или новые мутационные паттерны, продолжат появляться в различных географических областях в результате коллективного иммунного давления, вызванного естественной инфекцией и вакцинацией. Мониторинг их динамики во времени и их влияния на тяжесть заболевания необходим для уточнения национальной и международной политики борьбы с болезнями.

В этом проекте будет проведена большая проспективная многоцентровая обсервационная когорта, продвигаемая Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), чтобы понять влияние генетической изменчивости SARS-CoV-2 на исход болезни COVID-19 у пациентов. с тяжелой болезнью. В исследование будут включены пациенты в критическом состоянии, госпитализированные по поводу острой дыхательной недостаточности/острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС), связанного с COVID-19. Цель работы будет заключаться в том, чтобы охарактеризовать варианты SARS-CoV-2, обнаруживаемые в этой популяции с течением времени, а также выявить и фенотипически охарактеризовать конкретные мутации/паттерны мутаций, связанные с различными клиническими исходами (первичная клиническая конечная точка, определяемая как смертность в дневное время). 28). Влияние мутаций на инфекционность вируса, чувствительность к нейтрализующим антителам и способность к индуцированной продукции цитокинов будет оцениваться соответственно in vitro и ex-vivo на соответствующих моделях, доступных в лаборатории. В дополнение к полноразмерному секвенированию вирусного генома наш собственный метод метагеномики дробовика будет использоваться для характеристики влияния вариаций SARS-CoV-2 на профили респираторной транскриптомной экспрессии и связь с клиническими эволюционными профилями.

Дизайн исследования Проспективное многоцентровое обсервационное когортное исследование

Основная цель: выявить взаимосвязь между конкретными вирусными мутациями/паттернами мутаций и клиническими исходами COVID-19 у пациентов, госпитализированных в отделения интенсивной терапии (ОИТ) по поводу острой дыхательной недостаточности после тяжелой инфекции SARS-CoV-2.

График исследования: Период включения: 24 месяца; Срок участия: 28 дней; Общая продолжительность: 24 месяца + 28 дней;