人工知能神経病理学者
人工知能神経病理学者 - ディープラーニングに基づく自動化された CNS 腫瘍病理診断
調査の概要
詳細な説明
この研究の目的は、深層学習技術に基づく中枢神経系腫瘍の自動病理診断システムを開発することです。 病理診断の精度を向上させるために、CNS腫瘍の病理診断に最適な深層学習モデルを最初に開発するように設計されています。 その後、臨床的に使用され、神経病理学者の作業負荷とストレスを軽減し、CNS 腫瘍患者に利益をもたらします。
髄膜腫、神経膠腫、リンパ腫、およびその他のさまざまな腫瘍を含むさまざまな CNS 腫瘍には、独自の異なる治療原理と計画があります。 たとえば、高悪性度神経膠腫では、手術による切除と手術後の化学放射線療法が必要です。 ただし、手術による切除はリンパ腫患者の予後を改善するのに重要ではなく、生検に基づく特定の診断後に体系的な化学療法が行われます。 したがって、この研究では、自動化されたCNS腫瘍病理診断システムが開発され、これらの腫瘍の異なるタイプを分類します。
現在、中枢神経系腫瘍の病理診断は、病理学者による体系的な分析後の組織病理学的特徴と分子情報に基づいています。 診断の正確さは、病理学者の経験に大きく依存します。 ただし、経験豊富で資格のある病理学者になるには、何年もの訓練が必要です。 病理学者は、同じ患者に対してまったく異なる診断結果を出すことがあります。 したがって、病理学者を支援できるシステムを開発することが不可欠です。
ディープラーニングは、人工知能の最も高度な技術の 1 つです。 特に画像認識の能力は非常に強力です。 したがって、深層学習に基づく病理組織切片画像のモデルを開発することができます。 2016 年の CNS 腫瘍の WHO 分類には、診断の重要な部分として分子マーカーが含まれています。 したがって、システムに追加される分子病理学の追加モデルがあります。
Huashan Hospital には、中国最大の CNS 腫瘍バイオバンクの 1 つがあります。これは、大量のデータを必要とするため、深層学習の重要な部分です。 この研究の症例負荷は、それらのデータの代表的で信頼できるものを示すことができます。
学習には 3 つの段階があります。 ステージ 1 と 2 は教師あり学習プロセスです。 ステージ 1 は、CNS 腫瘍の組織病理学的診断に最適なディープ ラーニング モデルを開発することです。最初のモデルの精度は少なくとも 70% を達成すると予想しています。 トレーニング データ (病理学的セクション) は、華山病院 CNS 腫瘍バイオバンクによって提供されます。 それまでの間、マイクロポジショニング プラットフォームは、画像収集の使用のために調査中です。 ステージ 1 の終わりには、モデル (ソフトウェア) とプラットフォーム (ハードウェア) を病理組織画像の診断システム全体として統合する予定です。 ステージ 2 では、CNS 腫瘍の分子病理学的診断モデルを設計します。 モデルは、これらの病理学的セクションから抽出された多数の関連分子情報によってトレーニングされます。 第 2 段階の終わりには、第 1 段階のシステムと第 2 段階のモデルを最初のプロトタイプとして組み合わせる予定です。 ステージ 3 は、教師なし学習プロセスとして知られています。 前段階の後に開発されたプロトタイプを使用することにより、システムは臨床的に使用されます。 病院の病理学者と一緒に、より多くの患者とデータが届くと、診断が下されます。 結果を病理学者と比較することで、自己学習し、時間の経過とともに精度を向上させることができます。 ステージ 3 の終わりまでに、システムは 90% を超える精度で独立した臨床病理診断能力を備えていると予想されます。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Jinsong Wu, Ph.D. & M.D.
- 電話番号:7220 +86-21-52880000
- メール:wjsongc@126.com
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Lei Jin, B.S.
- 電話番号:+8613817841756
- メール:ozlei91@126.com
研究場所
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Shanghai
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Shanghai、Shanghai、中国、200040
- 募集
- Hushan Hospital, Fudan University
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コンタクト:
- Jinsong Wu, Ph.D. & M.D.
- 電話番号:7220 +86-21-52880000
- メール:wjsongc@126.com
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
参加者は、WHO 2016 分類の CNS 腫瘍の診断により脳腫瘍と診断されました。
除外基準:
自発的に辞める
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースのみ
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
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中枢神経系腫瘍
CNS腫瘍を有する18~75歳のすべての患者が含まれ、1つのグループとしてカウントされます
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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自動病理組織診断結果(ソフトウェア開発)
時間枠:2018年11月~2019年11月
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教師付きトレーニングの後、CNS 腫瘍の組織病理学的診断のソフトウェアは、少なくとも 70% の精度を達成します。
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2018年11月~2019年11月
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顕微鏡用ポジショニングプラットフォーム(ハードウェア開発)
時間枠:2018年11月~2019年11月
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病理切片画像収集のためのハードウェア調査により、切片画像を自動的にスキャンします。
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2018年11月~2019年11月
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自動分子病理診断を組み合わせる
時間枠:2019年11月~2020年6月
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WHO 2016 CNS Tumorガイドに関する病理組織学的診断に分子情報が追加されています。
組織病理学と分子を組み合わせて最終診断を下す
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2019年11月~2020年6月
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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システムを改善するためのより多くのケースを使用した教師なしトレーニング
時間枠:2019年11月~2022年11月
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監視なしで行うことができる華山病院からの多数の中枢神経系腫瘍症例を継続的に収集することにより、システムの診断精度を向上させます。
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2019年11月~2022年11月
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協力者と研究者
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出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Gulshan V, Peng L, Coram M, Stumpe MC, Wu D, Narayanaswamy A, Venugopalan S, Widner K, Madams T, Cuadros J, Kim R, Raman R, Nelson PC, Mega JL, Webster DR. Development and Validation of a Deep Learning Algorithm for Detection of Diabetic Retinopathy in Retinal Fundus Photographs. JAMA. 2016 Dec 13;316(22):2402-2410. doi: 10.1001/jama.2016.17216.
- Louis DN, Perry A, Reifenberger G, von Deimling A, Figarella-Branger D, Cavenee WK, Ohgaki H, Wiestler OD, Kleihues P, Ellison DW. The 2016 World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary. Acta Neuropathol. 2016 Jun;131(6):803-20. doi: 10.1007/s00401-016-1545-1. Epub 2016 May 9.
- Wen PY, Huse JT. 2016 World Health Organization Classification of Central Nervous System Tumors. Continuum (Minneap Minn). 2017 Dec;23(6, Neuro-oncology):1531-1547. doi: 10.1212/CON.0000000000000536.
- Schmidhuber J. Deep learning in neural networks: an overview. Neural Netw. 2015 Jan;61:85-117. doi: 10.1016/j.neunet.2014.09.003. Epub 2014 Oct 13.
- Yu KH, Zhang C, Berry GJ, Altman RB, Re C, Rubin DL, Snyder M. Predicting non-small cell lung cancer prognosis by fully automated microscopic pathology image features. Nat Commun. 2016 Aug 16;7:12474. doi: 10.1038/ncomms12474.
- Ehteshami Bejnordi B, Veta M, Johannes van Diest P, van Ginneken B, Karssemeijer N, Litjens G, van der Laak JAWM; the CAMELYON16 Consortium, Hermsen M, Manson QF, Balkenhol M, Geessink O, Stathonikos N, van Dijk MC, Bult P, Beca F, Beck AH, Wang D, Khosla A, Gargeya R, Irshad H, Zhong A, Dou Q, Li Q, Chen H, Lin HJ, Heng PA, Hass C, Bruni E, Wong Q, Halici U, Oner MU, Cetin-Atalay R, Berseth M, Khvatkov V, Vylegzhanin A, Kraus O, Shaban M, Rajpoot N, Awan R, Sirinukunwattana K, Qaiser T, Tsang YW, Tellez D, Annuscheit J, Hufnagl P, Valkonen M, Kartasalo K, Latonen L, Ruusuvuori P, Liimatainen K, Albarqouni S, Mungal B, George A, Demirci S, Navab N, Watanabe S, Seno S, Takenaka Y, Matsuda H, Ahmady Phoulady H, Kovalev V, Kalinovsky A, Liauchuk V, Bueno G, Fernandez-Carrobles MM, Serrano I, Deniz O, Racoceanu D, Venancio R. Diagnostic Assessment of Deep Learning Algorithms for Detection of Lymph Node Metastases in Women With Breast Cancer. JAMA. 2017 Dec 12;318(22):2199-2210. doi: 10.1001/jama.2017.14585.
- Esteva A, Kuprel B, Novoa RA, Ko J, Swetter SM, Blau HM, Thrun S. Dermatologist-level classification of skin cancer with deep neural networks. Nature. 2017 Feb 2;542(7639):115-118. doi: 10.1038/nature21056. Epub 2017 Jan 25. Erratum In: Nature. 2017 Jun 28;546(7660):686.
- Litjens G, Kooi T, Bejnordi BE, Setio AAA, Ciompi F, Ghafoorian M, van der Laak JAWM, van Ginneken B, Sanchez CI. A survey on deep learning in medical image analysis. Med Image Anal. 2017 Dec;42:60-88. doi: 10.1016/j.media.2017.07.005. Epub 2017 Jul 26.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (予想される)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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