膵神経内分泌腫瘍の早期発見のための多次元 Fragmentomic アッセイ

膵神経内分泌腫瘍 (pNETs) は潜行性であり、早期診断が困難です。 pNET 患者の約 36.8% にリンパ節転移があり [1]、診断時に患者の 20% ～ 64% に肝転移があります [2]。 pNET の予後は、腫瘍の悪性度および米国がん合同委員会 (AJCC) の病期分類と密接に関連しています。 米国の病理学的グレードが既知の患者の中で、高分化型NETは全生存期間の中央値が最も高く（OS、16.2年）、中分化型NETはOSが悪く（8.3年）、低分化型または未分化型NETはOSが最悪でした。 (10 か月)[3]。 限局性、局所進行性、および転移性 pNET の 5 年全生存率は、それぞれ 93%、77%、および 27% でした [4]。 初期段階の pNET の予後が進行した pNET よりもはるかに優れていることを考えると、pNET を早期に検出することで治癒の機会が得られ、生存率が大幅に向上します。

過去数十年で、68Ga-DOTANOC PET/CT、磁気共鳴画像法 (MRI)、コンピューター断層撮影法 (CT)、内視鏡超音波 (EUS) の適用により、pNET の検出率が向上しました。 しかし、それらのアプリケーションは、高コスト、十分な感度または特異性の欠如、および放射線被ばくによって制限されています。 したがって、pNETs の早期発見のために臨床現場で使用する正確で侵襲性の低いアプローチが緊急に必要とされています。

最近、無細胞 DNA (cfDNA) の研究により、固形悪性腫瘍の診断のための非侵襲的アプローチが提供されました。 cfDNA は、細胞のアポトーシスやネクローシスから血漿などのヒトの体液に放出される細胞外 DNA 断片を表し、その結果、元の細胞や組織からの遺伝情報やエピジェネティックな情報を保持します [5]。 その中で、全 cfDNA の一部として循環腫瘍 DNA (ctDNA) が腫瘍細胞によって血中に放出されます [6]。 cfDNA フラグメントミクスは全ゲノム配列決定に依存し、その特徴には主にコピー数変動 (CNV)、ヌクレオソーム フットプリント、フラグメント長およびモチーフ [5、7、8] が含まれ、ターゲットは全ゲノム レベルをカバーします。 cfDNA フラグメントミクスは、複数の研究で優れた予測性能を示しています [5、9-11]。 したがって、この前向き研究は、膵神経内分泌腫瘍の早期発見のために、無形質細胞 DNA (cfDNA) のフラグメントプロファイルを使用して、統合モデルの感度と特異性を評価することを目的としています。