Multidimenzionální fragmentační test pro včasnou detekci pankreatických neuroendokrinních nádorů
Multidimenzionální fragmentační test pro časnou detekci pankreatických neuroendokrinních nádorů: prospektivní studie
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Pankreatické neuroendokrinní tumory (pNET) jsou zákeřné a obtížně diagnostikovatelné. Přibližně 36,8 % pacientů s pNET má metastázy v lymfatických uzlinách[1] a 20 % – 64 % pacientů má v době diagnózy metastázy v játrech[2]. Prognóza pNET úzce souvisí se stupněm nádoru a stagingem podle American Joint Committee on Cancer (AJCC). Mezi pacienty se známými patologickými stupni ve Spojených státech měly dobře diferencované NET nejvyšší medián celkového přežití (OS, 16,2 let), středně diferencované NET měly horší OS (8,3 let) a špatně diferencované nebo nediferencované NET měly nejhorší OS (10 měsíců)[3]. Celková pětiletá míra přežití u lokalizovaných, lokálně pokročilých a metastatických pNET byla 93 %, 77 % a 27 % [4]. Vzhledem k tomu, že prognóza pNET v časném stadiu je výrazně lepší než u pokročilých pNET, časná detekce pNET může poskytnout příležitost k vyléčení a významně zlepšit přežití.
V posledních několika desetiletích aplikace 68Ga-DOTANOC PET/CT, zobrazování magnetickou rezonancí (MRI), počítačová tomografie (CT) a endoskopický ultrazvuk (EUS) zlepšily míru detekce pNET. Jejich použití je však omezeno vysokými náklady, nedostatečnou citlivostí nebo specifitou a radiační zátěží. Proto existuje naléhavá potřeba přesných a méně invazivních přístupů pro použití v klinické praxi pro časnou detekci pNET.
Studie bezbuněčné DNA (cfDNA) nedávno poskytla neinvazivní přístup k diagnostice solidních malignit. cfDNA představují extracelulární fragmenty DNA uvolněné z buněčné apoptózy a nekrózy do lidských tělesných tekutin, jako je plazma, a tak přenášejí genetickou a epigenetickou informaci z buňky a tkáně původu[5]. Mezi nimi je cirkulující nádorová DNA (ctDNA), jako součást celkové cfDNA, uvolňována do krve nádorovými buňkami[6]. Fragmentomika cfDNA závisí na sekvenování celého genomu a mezi její charakteristiky patří především variace počtu kopií (CNV), stopa nukleozomu, délka fragmentu a motiv[5, 7, 8], přičemž cíle pokrývají celou úroveň genomu. cfDNA fragmentomics prokázala vynikající prediktivní výkon v mnoha studiích [5, 9-11]. Tato prospektivní studie si proto klade za cíl vyhodnotit senzitivitu a specifičnost integrovaného modelu pomocí fragmentomických profilů plazmatických buněk bez DNA (cfDNA) pro časnou detekci neuroendokrinních nádorů pankreatu.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Xianjun Yu, MD, PhD
- Telefonní číslo: 021-64175590-88503
- E-mail: yuxianjun@fudanpci.org
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Shunrong Ji, MD, PhD
- Telefonní číslo: 13788993956
- E-mail: jishunrong@fudanpci.org
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Skupina pNETs: Neužívali před operací protinádorovou léčbu a byly u nich histopatologicky potvrzeny neuroendokrinní nádory pankreatu.
Zdravá skupina: zdraví dobrovolníci.
Popis
Kritéria pro zařazení:
- věk 18 a více let, bez ohledu na pohlaví;
- Histopatologická diagnóza s neuroendokrinním nádorem pankreatu před operací;
- Neabsolvování žádné protinádorové léčby před operací, včetně chemoterapie, embolizace, ablace, radioterapie a molekulárně cílené terapie;
- Žádné zjevné chirurgické kontraindikace;
- Schopnost vyhovět plánům výzkumu, plánům sledování a dalším požadavkům protokolu;
- Dobrovolná účast a podepsaný informovaný souhlas.
Kritéria vyloučení:
- Patologická diagnóza byla nepankreatický neuroendokrinní nádor;
- V současné době diagnostikován s jinými typy nádorů nebo s jakoukoli rakovinou v anamnéze;
- Diagnostikováno s rodinnými syndromy;
- Příjem protinádorové léčby před operací, včetně chemoterapie, embolizace, ablace, radioterapie a molekulárně cílené terapie;
- Probíhající horečka nebo příjemce protizánětlivé léčby během 14 dnů před odběrem krve ve studii;
- Příjemce krevní transfuze do 30 dnů před odběrem krve ve studii;
- Příjemce transplantace orgánu nebo předchozí neautologní (alogenní) transplantace kostní dřeně nebo kmenových buněk;
- Špatný zdravotní stav a nevhodné pro odběr krve;
- Jakékoli jiné onemocnění/stav, které výzkumník nepovažuje za vhodné pro zápis do studie.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Zdravý
Zdraví dobrovolníci.
|
Odběr krve a testování časné detekce založené na fragmentomických profilech plazmatické cfDNA
|
|
pNET
Pacienti s pankreatickými neuroendokrinními tumory (pNETs).
|
Odběr krve a testování časné detekce založené na fragmentomických profilech plazmatické cfDNA
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Citlivost a specifičnost
Časové okno: Od data prvního odběru krve do první zdokumentované diagnózy pNETs, hodnoceno do 3 let
|
Citlivost a specificita integrovaného modelu využívajícího fragmentomické profily plazmatické cfDNA pro časnou detekci pNET
|
Od data prvního odběru krve do první zdokumentované diagnózy pNETs, hodnoceno do 3 let
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Pozitivní prediktivní hodnota a negativní prediktivní hodnota
Časové okno: Od data prvního odběru krve do první zdokumentované diagnózy pNETs, hodnoceno do 3 let
|
Pozitivní prediktivní hodnota (PPV) a negativní prediktivní hodnota (NPV) integrovaného modelu využívajícího fragmentomické profily plazmatické cfDNA pro včasnou detekci pNET
|
Od data prvního odběru krve do první zdokumentované diagnózy pNETs, hodnoceno do 3 let
|
|
Senzitivita a specifičnost při rozlišování různých stadií AJCC
Časové okno: Od data prvního odběru krve do první zdokumentované diagnózy pNETs, hodnoceno do 3 let
|
Senzitivita a specifičnost integrovaného modelu využívajícího fragmentomické profily plazmatické cfDNA při rozlišení různých stádií AJCC
|
Od data prvního odběru krve do první zdokumentované diagnózy pNETs, hodnoceno do 3 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Snyder MW, Kircher M, Hill AJ, Daza RM, Shendure J. Cell-free DNA Comprises an In Vivo Nucleosome Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin. Cell. 2016 Jan 14;164(1-2):57-68. doi: 10.1016/j.cell.2015.11.050.
- Dasari A, Shen C, Halperin D, Zhao B, Zhou S, Xu Y, Shih T, Yao JC. Trends in the Incidence, Prevalence, and Survival Outcomes in Patients With Neuroendocrine Tumors in the United States. JAMA Oncol. 2017 Oct 1;3(10):1335-1342. doi: 10.1001/jamaoncol.2017.0589.
- Mathios D, Johansen JS, Cristiano S, Medina JE, Phallen J, Larsen KR, Bruhm DC, Niknafs N, Ferreira L, Adleff V, Chiao JY, Leal A, Noe M, White JR, Arun AS, Hruban C, Annapragada AV, Jensen SO, Orntoft MW, Madsen AH, Carvalho B, de Wit M, Carey J, Dracopoli NC, Maddala T, Fang KC, Hartman AR, Forde PM, Anagnostou V, Brahmer JR, Fijneman RJA, Nielsen HJ, Meijer GA, Andersen CL, Mellemgaard A, Bojesen SE, Scharpf RB, Velculescu VE. Detection and characterization of lung cancer using cell-free DNA fragmentomes. Nat Commun. 2021 Aug 20;12(1):5060. doi: 10.1038/s41467-021-24994-w.
- Fischer L, Bergmann F, Schimmack S, Hinz U, Priess S, Muller-Stich BP, Werner J, Hackert T, Buchler MW. Outcome of surgery for pancreatic neuroendocrine neoplasms. Br J Surg. 2014 Oct;101(11):1405-12. doi: 10.1002/bjs.9603. Epub 2014 Aug 13.
- Zhang X, Wang Z, Tang W, Wang X, Liu R, Bao H, Chen X, Wei Y, Wu S, Bao H, Wu X, Shao Y, Fan J, Zhou J. Ultrasensitive and affordable assay for early detection of primary liver cancer using plasma cell-free DNA fragmentomics. Hepatology. 2022 Aug;76(2):317-329. doi: 10.1002/hep.32308. Epub 2022 Jan 26.
- Fece de la Cruz F, Corcoran RB. Methylation in cell-free DNA for early cancer detection. Ann Oncol. 2018 Jun 1;29(6):1351-1353. doi: 10.1093/annonc/mdy134. No abstract available.
- Guo W, Chen X, Liu R, Liang N, Ma Q, Bao H, Xu X, Wu X, Yang S, Shao Y, Tan F, Xue Q, Gao S, He J. Sensitive detection of stage I lung adenocarcinoma using plasma cell-free DNA breakpoint motif profiling. EBioMedicine. 2022 Jul;81:104131. doi: 10.1016/j.ebiom.2022.104131. Epub 2022 Jun 30.
- Bao H, Wang Z, Ma X, Guo W, Zhang X, Tang W, Chen X, Wang X, Chen Y, Mo S, Liang N, Ma Q, Wu S, Xu X, Chang S, Wei Y, Zhang X, Bao H, Liu R, Yang S, Jiang Y, Wu X, Li Y, Zhang L, Tan F, Xue Q, Liu F, Cai S, Gao S, Peng J, Zhou J, Shao Y. Letter to the Editor: An ultra-sensitive assay using cell-free DNA fragmentomics for multi-cancer early detection. Mol Cancer. 2022 Jun 11;21(1):129. doi: 10.1186/s12943-022-01594-w.
- Ma X, Chen Y, Tang W, Bao H, Mo S, Liu R, Wu S, Bao H, Li Y, Zhang L, Wu X, Cai S, Shao Y, Liu F, Peng J. Multi-dimensional fragmentomic assay for ultrasensitive early detection of colorectal advanced adenoma and adenocarcinoma. J Hematol Oncol. 2021 Oct 26;14(1):175. doi: 10.1186/s13045-021-01189-w.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Očekávaný)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
- Nemoci trávicího systému
- Novotvary podle histologického typu
- Novotvary
- Novotvary podle místa
- Novotvary, žlázové a epiteliální
- Onemocnění endokrinního systému
- Novotvary trávicího systému
- Novotvary endokrinních žláz
- Neuroektodermální nádory
- Novotvary, zárodečné buňky a embryonální
- Novotvary, nervová tkáň
- Onemocnění slinivky břišní
- Adenom
- Novotvary pankreatu
- Neuroendokrinní nádory
- Adenom, Islet Cell
Další identifikační čísla studie
- CSPAC-NEN-3
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Neuroendokrinní nádor pankreatu
-
University of PennsylvaniaZatím nenabírámeTumor, Solid
-
Varian, a Siemens Healthineers CompanyDokončeno
-
Varian, a Siemens Healthineers CompanyDokončeno
-
University of Wisconsin, MadisonNational Cancer Institute (NCI); National Institutes of Health (NIH)Ukončeno
-
Eikon TherapeuticsSeven and Eight Biopharmaceuticals IncDokončenoTumor, SolidSpojené státy
-
Merck Sharp & Dohme LLCUkončeno
-
Varian, a Siemens Healthineers CompanyZatím nenabíráme
-
Peking Union Medical College HospitalNábor
-
The First Affiliated Hospital of Xiamen UniversityNábor