Multidimensionale fragmentomische assay voor vroege detectie van neuro-endocriene pancreastumoren

Pancreatische neuro-endocriene tumoren (pNET's) zijn verraderlijk en moeilijk te diagnosticeren in een vroeg stadium. Ongeveer 36,8% van de pNET-patiënten heeft lymfekliermetastasen[1] en 20% -64% van de patiënten heeft levermetastasen op het moment van diagnose[2]. De prognose van pNET's hangt nauw samen met de tumorgraad en de stadiëring van de American Joint Committee on Cancer (AJCC). Van de patiënten met bekende pathologische graden in de Verenigde Staten hadden goed gedifferentieerde NET's de hoogste mediane totale overleving (OS, 16,2 jaar), matig gedifferentieerde NET's hadden de slechtste OS (8,3 jaar) en slecht gedifferentieerde of ongedifferentieerde NET's hadden de slechtste OS (10 maanden)[3]. De totale overlevingspercentages na 5 jaar van gelokaliseerde, lokaal gevorderde en gemetastaseerde pNET's waren respectievelijk 93%, 77% en 27%[4]. Aangezien de prognose van pNET's in een vroeg stadium aanzienlijk beter is dan die van geavanceerde pNET's, kan vroege detectie van pNET's een kans op genezing bieden en de overleving aanzienlijk verbeteren.

In de afgelopen decennia heeft de toepassing van 68Ga-DOTANOC PET/CT, magnetische resonantiebeeldvorming (MRI), computertomografie (CT) en endoscopische echografie (EUS) de detectiegraad van pNET's verbeterd. Maar hun toepassing wordt beperkt door hoge kosten, gebrek aan voldoende gevoeligheid of specificiteit en blootstelling aan straling. Daarom is er dringend behoefte aan nauwkeurige en minder invasieve benaderingen die in de klinische praktijk kunnen worden gebruikt voor de vroege detectie van pNET's.

Onlangs heeft de studie van celvrij DNA (cfDNA) een niet-invasieve benadering opgeleverd voor de diagnose van solide maligniteiten. cfDNA's vertegenwoordigen extracellulaire DNA-fragmenten die vrijkomen uit celapoptose en necrose in menselijke lichaamsvloeistoffen zoals plasma, en dragen zo de genetische en epigenetische informatie van de cel en het weefsel van herkomst[5]. Onder hen wordt circulerend tumor-DNA (ctDNA), als onderdeel van het totale cfDNA, door tumorcellen in het bloed afgegeven [6]. cfDNA-fragmentomics is afhankelijk van de sequentiebepaling van het hele genoom en de kenmerken ervan omvatten voornamelijk kopie-aantalvariatie (CNV), nucleosoomvoetafdruk, fragmentlengte en motief [5, 7, 8], met doelen die het volledige genoomniveau beslaan. cfDNA-fragmentomics heeft uitstekende voorspellende prestaties laten zien in meerdere onderzoeken [5, 9-11]. Daarom heeft deze prospectieve studie tot doel de sensitiviteit en specificiteit van een geïntegreerd model te evalueren met behulp van fragmentomische profielen van plasmacelvrij DNA (cfDNA) voor vroege detectie van neuro-endocriene pancreastumoren.