新生児全ゲノムシーケンシングと遺伝性疾患リスクに関する正確な評価および介入研究
新生児全ゲノムシーケンシングと遺伝性疾患リスクに関する正確な評価と介入研究(チャイナ・ベビー・オミクス)
母子保健は公衆衛生の基礎であり、その状況は人口全体の健康水準を直接反映します。 急速な社会経済発展とますます深刻な環境問題により、女性と子供の健康問題はより広範かつ多様化しています。 新しい時代において、母子保健は新たな課題に直面しており、生殖健康の促進、出生異常の予防、母子の安全、小児疾患の予防などの分野でより高い要求があります。 コホート研究は、疾病の病因を探求する疫学的研究方法として、妊娠前または妊娠中に参加者を募集し、妊娠、出産、出生後の母子健康アウトカムに関する追跡調査を実施し、疾病と健康に影響を与える様々な要因を特定します。 生命の初期段階に焦点を当てたこのアプローチは、早期生命期および胚発生期における環境的、遺伝的、行動的リスク要因と胎児健康、乳児健康との関連を研究する効果的な方法です。
このプロジェクトは、家族単位でカップルとその子孫を長期的に追跡調査する一方、複数の時点で生物学的サンプルを収集する計画です。 登録集団からの臨床情報とマルチオミクスデータに基づく体系的な多次元評価を用いて、生殖および妊娠関連疾患と発達異常の原因を推測し、妊娠関連疾患の新たなバイオマーカーを特定し、予測モデルを確立し、子孫の早期生命期におけるリスク要因を認識することで、生殖および発達疾患の予防と管理のための指針を提供します。
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Hengchao Ruan, phD
- 電話番号:0571-88208964
- メール:ruanhengchao@zju.edu.cn
研究場所
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Zhejiang
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Hangzhou、Zhejiang、中国、310006
- 募集
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
参加基準:
- 継続中の妊娠(生殖補助医療または自然妊娠による)および新生児を対象としたご家族。
除外基準:
- なし
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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全ゲノムシーケンシングデータ
時間枠:サンプル収集完了後、平均1年間。
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DNBSEQ-T7RS ハイスループットシーケンシングキット(FCL PE100)V2.0 の指示に従って、血清 cfDNA サンプルの 30-40X 全ゲノムシーケンシングを完了し、シーケンシングデータのバイオインフォマティクス解析を実施してください。
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サンプル収集完了後、平均1年間。
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代謝産物の濃度
時間枠:サンプル収集完了後、平均1年。
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各代謝産物の濃度は、BGIが独自に開発した自動化ターゲット代謝絶対定量ソフトウェアHMQuantを用いて分析および計算されました。
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サンプル収集完了後、平均1年。
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母体末梢血からのcfRNAの構築とシーケンシング
時間枠:サンプル収集完了後、平均1年。
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ライブラリ構築と品質管理は、BGI PALM-seqライブラリ構築法に従って実施され、その後cfRNAシーケンシングが行われました。
PALM-seqシーケンシングバイオインフォマティ
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サンプル収集完了後、平均1年。
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全ゲノムDNAメチル化データ
時間枠:サンプル収集完了後、平均1年。
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ビスルファイト処理とハイスループットシーケンシング技術を組み合わせることで、全ゲノムDNAメチル化プロファイルの効率的かつ正確なマッピングが可能となり、エピゲノミクス研究において重要なツールとなっています。
国内で開発されたDNBSEQTMシーケンシング技術に基づき、BGIは二重鎖環状化を利用した新しいライブラリ調製法を独自に開発しました。
このアプローチは、従来のメチル化シーケンシングに存在する塩基バイアスの問題を効果的に解決し、真正なメチル化レベルデータの迅速かつ効率的な取得を可能にします。
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サンプル収集完了後、平均1年。
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タンパク質発現の差異と機能解析
時間枠:サンプル収集完了後、平均1年間。
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サンプルタンパク質調製:サンプルは-80℃から採取し、各サンプル50 μLを尿素、ジチオトレイトール、ヨードアセトアミドで処理し、還元とアルキル化を行いました。
固相抽出プレートを用いて高存在量タンパク質を除去した後、トリプシンを添加して酵素加水分解を行いました。
液体クロマトグラフィー-質量分析検出:酵素加水分解後、ペプチドをナノフロー-高性能液体クロマトグラフィー-高分解能質量分析(Lumos、Thermo)を用いてDIA(データ非依存取得)モードで解析し、データ取得を行いました。
データ分析:DIAデータからタンパク質を同定および定量するためにDIA-NNソフトウェアを使用しました。
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サンプル収集完了後、平均1年間。
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メタゲノムデータ
時間枠:サンプル収集完了後、平均1年。
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腟分泌物からのDNA抽出およびライブラリーシーケンシング:MAGPURE Stool DNA KFキットを用いて腟分泌物からDNAを抽出しました。MGIEasy universal DNA library preparation kitを使用してメタゲノムライブラリーを構築しました。Agilent 2100 Bioanalyzerを使用してライブラリーのフラグメント範囲および濃度を検出しました。
適格なライブラリーは、DNBSEQ-T7RSハイスループットシーケンシングキットの指示に従ってT1シーケンシングプラットフォームを使用してシーケンシングされました。
メタゲノムシーケンシングデータのバイオインフォマティクス分析:メタゲノムデータは、まずTrimomaticソフトウェアを使用して元の配列の品質管理を行い、次にfastq_streenソフトウェアを使用して処理されたデータから宿主配列およびphixライブラリー汚染を含む汚染配列を除去しました。その後、BWAアライナーを使用して比較を行い、ヒトゲノムフラグメントを最初に除去しました。
微生物種組成および相対存在量は、Metaphlan2ソフトウェアを使用して評価されました。
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サンプル収集完了後、平均1年。
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協力者と研究者
捜査官
- スタディチェア:Hefeng Huang、Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- スタディチェア:Dan Zhang、Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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