- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT07365254
Точная оценка и исследование вмешательств по полному секвенированию генома новорожденных и риску генетических заболеваний
Точная оценка и исследование вмешательств по полногеномному секвенированию новорожденных и риску генетических заболеваний (Китайский проект Baby Omics)
Материнское и детское здоровье является основой общественного здравоохранения, и его состояние напрямую отражает общий уровень здоровья населения. Благодаря быстрому социально-экономическому развитию и всё более серьёзным экологическим проблемам, проблемы здоровья женщин и детей стали более распространёнными и разнообразными. В новую эпоху охрана материнства и детства сталкивается с новыми вызовами, с более высокими требованиями в таких областях, как укрепление репродуктивного здоровья, профилактика врождённых пороков развития, безопасность матери и ребёнка, а также профилактика детских заболеваний. Когортные исследования, как эпидемиологический метод исследования причин заболеваний, включают набор участников до или во время беременности и проведение наблюдений за беременностью, родами и исходами для здоровья матери и ребёнка после рождения, чтобы выявить различные факторы, влияющие на заболевания и здоровье. Сосредоточившись на ранних этапах жизни, этот подход является эффективным методом изучения взаимосвязей между факторами риска окружающей среды, генетики и поведения в раннем периоде жизни и эмбриональным развитием, здоровьем плода и здоровьем младенца.
Этот проект планирует проводить долгосрочное наблюдение за парами и их потомством на семейной основе, одновременно собирая биологические образцы в нескольких временных точках. Системная многомерная оценка, основанная на клинической информации и мультиомиксных данных зарегистрированной популяции, будет использоваться для выявления причин репродуктивных и связанных с беременностью заболеваний и нарушений развития, определения новых биомаркеров заболеваний, связанных с беременностью, создания прогностических моделей и выявления факторов риска в раннем периоде жизни потомства, тем самым обеспечивая руководство по профилактике и контролю репродуктивных и связанных с развитием заболеваний.
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Hengchao Ruan, phD
- Номер телефона: 0571-88208964
- Электронная почта: ruanhengchao@zju.edu.cn
Места учебы
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Китай, 310006
- Рекрутинг
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Семьи с текущими беременностями (с помощью вспомогательных репродуктивных технологий или естественного зачатия) и новорожденными младенцами.
Критерии исключения:
- Нет
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Данные полногеномного секвенирования
Временное ограничение: После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
Выполните полногеномное секвенирование 30-40X образца cfDNA сыворотки в соответствии с инструкциями к набору для высокопроизводительного секвенирования DNBSEQ-T7RS (FCL PE100) V2.0 и проведите биоинформатический анализ данных секвенирования.
|
После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
|
Концентрация метаболита
Временное ограничение: После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
Концентрация каждого метаболита была проанализирована и рассчитана с использованием автоматизированного программного обеспечения для целевого метаболического абсолютного количественного определения HMQuant, самостоятельно разработанного BGI.
|
После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
|
Построение и секвенирование cfRNA из периферической крови матери
Временное ограничение: После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
Сборка библиотеки и контроль качества были выполнены в соответствии с методом сборки библиотеки BGI PALM-seq, после чего было проведено секвенирование cfRNA.
Биоинформатический анализ секвенирования PALM-seq
|
После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
|
Данные метилирования ДНК всего генома
Временное ограничение: После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
Комбинирование бисульфитной обработки с технологией высокопроизводительного секвенирования позволяет эффективно и точно картировать профили метилирования ДНК по всему геному, что делает её важнейшим инструментом для эпигеномных исследований.
На основе разработанной внутри страны технологии секвенирования DNBSEQTM компания BGI самостоятельно разработала новый метод подготовки библиотек с использованием циклизации двухцепочечной ДНК.
Этот подход эффективно решает проблему систематических ошибок оснований, присутствующую в традиционном секвенировании метилирования, позволяя быстро и эффективно получать достоверные данные об уровнях метилирования.
|
После завершения сбора образцов, в среднем 1 год.
|
|
Различия в экспрессии белка и функциональный анализ
Временное ограничение: После завершения сбора образцов, в среднем через 1 год.
|
Приготовление образцов белков: Образцы брали при -80°C, и 50 μL каждого образца обрабатывали мочевиной, дитиотреитолом и иодоацетамидом для восстановления и алкилирования.
Для удаления высокоаффинных белков использовали планшеты для твердофазной экстракции, после чего добавляли трипсин для ферментативного гидролиза.
Детектирование методом жидкостной хроматографии-масс-спектрометрии: После ферментативного гидролиза пептиды анализировали с использованием нано-высокоэффективной жидкостной хроматографии-высокоточной масс-спектрометрии (Lumos, Thermo) в режиме DIA (независимый от данных сбор) для сбора данных.
Анализ данных: Программное обеспечение DIA-NN использовали для идентификации и количественного определения белков из данных DIA.
|
После завершения сбора образцов, в среднем через 1 год.
|
|
Метагеномные данные
Временное ограничение: После завершения сбора образцов, в среднем через 1 год.
|
Экстракция ДНК из вагинальных выделений и подготовка библиотек для секвенирования: для экстракции ДНК из вагинальных выделений использовали набор Magpure Stoll DNA KF; метагеномную библиотеку конструировали с использованием набора для подготовки универсальных библиотек ДНК MGIEasy; для определения диапазона фрагментов и концентрации библиотеки использовали Agilent 2100 Bioanalyzer.
Квалифицированные библиотеки секвенировали на платформе T1 в соответствии с инструкциями набора для высокопроизводительного секвенирования DNBSEQ-T7RS.
Биоинформатический анализ данных метагеномного секвенирования: исходные последовательности метагеномных данных сначала подвергали контролю качества с использованием программного обеспечения Trimomatic, затем из обработанных данных удаляли загрязненные последовательности с помощью программного обеспечения fastq_streen, включая последовательности хозяина и загрязнение библиотеки phix; после этого использовали выравниватель BWA для сравнения, сначала удаляя фрагменты человеческого генома.
Видовой состав и относительную численность микроорганизмов оценивали с использованием программного обеспечения Metaphlan2.
|
После завершения сбора образцов, в среднем через 1 год.
|
Соавторы и исследователи
Следователи
- Учебный стул: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Учебный стул: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- IRB-20250021-R
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .