- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT07365254
Uuden syntyneen koko genomin sekvensoinnin ja geneettisen sairastumisriskin tarkka arviointi ja interventiotutkimus
Tarkka Arviointi ja Interventiotutkimus Vastasyntyneiden Koko Genomisekvensoinnista ja Geneettisistä Sairastumisriskeistä (China Baby Omics)
Äitiys- ja lapsiterveys on kansanterveyden perusta, ja sen tila heijastaa suoraan väestön kokonaisterveystasoa. Nopean sosioekonomisen kehityksen ja yhä vakavampien ympäristöongelmien myötä naisten ja lasten terveysongelmat ovat tulleet laajemmiksi ja monimuotoisemmiksi. Uudella aikakaudella äitiys- ja lastenterveydenhuolto kohtaa uusia haasteita, ja siihen liittyy korkeammat vaatimukset esimerkiksi lisääntymisterveyden edistämisessä, synnynnäisten epämuodostelmien ehkäisyssä, äidin ja lapsen turvallisuudessa sekä lasten sairauksien ehkäisyssä. Kohorttitutkimukset, jotka ovat epidemiologinen tutkimusmenetelmä sairauksien etiologian selvittämiseksi, sisältävät osallistujien rekrytoinnin ennen raskautta tai sen aikana sekä seurannan raskauden, synnytyksen ja synnytyksen jälkeisen äitiys- ja lapsiterveyden tulosten suhteen sairauksia ja terveyttä vaikuttavien eri tekijöiden tunnistamiseksi. Keskittyen elämän varhaisiin vaiheisiin tämä lähestymistapa on tehokas menetelmä tutkia varhaiselämän ja alkionkehityksen aikana esiintyvien ympäristön, perinnöllisyyden ja käyttäytymiseen liittyvien riskitekijöiden yhteyksiä sikiön ja lapsen terveyteen.
Tämä hanke suunnittelee pitkäaikaista seurantaa pareille ja heidän jälkeläisilleen perhekohtaisesti samalla keräten biologisia näytteitä useissa ajanjaksoissa. Järjestelmällinen moniulotteinen arviointi, joka perustuu rekisteröityneen väestön kliiniseen tietoon ja multi-omics-tietoihin, käytetään lisääntymiseen ja raskausiin liittyvien sairauksien sekä kehityshäiriöiden syiden päättelemiseen, uusien raskaussairauksien biomarkkereiden tunnistamiseen, ennustemallien luomiseen ja jälkeläisten varhaiselämän riskitekijöiden tunnistamiseen, tarjoten näin ohjausta lisääntymis- ja kehityssairauksien ehkäisyyn ja hallintaan.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Hengchao Ruan, phD
- Puhelinnumero: 0571-88208964
- Sähköposti: ruanhengchao@zju.edu.cn
Opiskelupaikat
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Kiina, 310006
- Rekrytointi
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällytyskriteerit:
- Perheet, joilla on meneillään olevia raskauksia (avustetun lisääntymisterapian tai luonnollisen hedelmöityksen kautta) ja vastasyntyneitä lapsia.
Poissulkemiskriteerit:
- Ei mitään
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Koko genomin sekvensointitiedot
Aikaikkuna: Ottojen keräämisen jälkeen keskimäärin 1 vuosi.
|
Suorita 30-40X kokogenominen sekvensointi seerumin cfDNA-näytteestä DNBSEQ-T7RS High-throughput Sequencing Kit (FCL PE100) V2.0 -ohjeiden mukaisesti ja toteuta sekvensointidatan bioinformatiikan analyysi.
|
Ottojen keräämisen jälkeen keskimäärin 1 vuosi.
|
|
Metaboliitin pitoisuus
Aikaikkuna: Otosten keräämisen päättymisen jälkeen keskimäärin 1 vuoden ajan.
|
Jokaisen metaboliitin pitoisuus analysoitiin ja laskettiin automaattisella kohdennetulla metabolisen absoluuttisen määrityksen ohjelmistolla HMQuant, jonka BGI on kehittänyt itsenäisesti.
|
Otosten keräämisen päättymisen jälkeen keskimäärin 1 vuoden ajan.
|
|
Emätin verinäytteestä eristetyn cfRNA:n rakentaminen ja sekvensointi
Aikaikkuna: Kokeiden keräämisen päättymisen jälkeen, keskimäärin 1 vuosi.
|
Kirjaston rakentaminen ja laadunvalvonta suoritettiin BGI PALM-seq -kirjastonrakennusmenetelmän mukaisesti, minkä jälkeen suoritettiin cfRNA-sekvensointi.
PALM-seq-sekvensointibioinformati
|
Kokeiden keräämisen päättymisen jälkeen, keskimäärin 1 vuosi.
|
|
Koko genomin DNA-metylaatiotiedot
Aikaikkuna: Näytteenkeruun päätyttyä keskimäärin 1 vuosi.
|
Bisulfiittikäsittelyn yhdistäminen suorituskykyiseen sekvensointiteknologiaan mahdollistaa tehokkaan ja tarkan koko genomin DNA-metylaatioprofiilien kartoittamisen, mikä tekee siitä ratkaisevan työkalun epigeneettisessä tutkimuksessa.
Kotimaisesti kehitettyyn DNBSEQTM-sekvensointiteknologiaan perustuen BGI on itsenäisesti kehittänyt uuden kirjastovalmistelumenetelmän, joka hyödyntää kaksoisjuosteista syklisaatiota.
Tämä lähestymistapa ratkaisee tehokkaasti perustahärän, joka on perinteisessä metylaatiosekvensoinnissa, mahdollistaen aidon metylaatiotason datan nopean ja tehokkaan hankinnan.
|
Näytteenkeruun päätyttyä keskimäärin 1 vuosi.
|
|
Proteiinin ilmentymiseroja ja toiminnallista analyysia
Aikaikkuna: Kun näytteenkeruu on valmis, keskimäärin 1 vuosi.
|
Näytteen proteiinivalmistus: Näytteet otettiin -80°C:sta, ja 50 µL kutakin näytettä käsiteltiin urealla, ditiotreitolilla ja jodoasetaamilla pelkistystä ja alkylointia varten.
Kiinteäfaasierotuslevyjä käytettiin korkean runsauden proteiinien poistamiseen, minkä jälkeen trypsiini lisättiin entsymaattista hydrolyysiä varten.
Nestekromatografia-massaspektrometriadetektio: Entsymaattisen hydrolyysin jälkeen peptidejä analysoitiin käyttämällä nanoflow-korkean suorituskyvyn nestekromatografia-korkean resoluution massaspektrometriaa (Lumos, Thermo) DIA (data-riippumaton hankinta) -tilassa datankeruuta varten.
Data-analyysi: DIA-NN-ohjelmistoa käytettiin proteiinien tunnistamiseen ja kvantifiointiin DIA-datasta.
|
Kun näytteenkeruu on valmis, keskimäärin 1 vuosi.
|
|
Metagenominen data
Aikaikkuna: Näytteenkeräyksen valmistumisen jälkeen keskimäärin 1 vuosi.
|
Emätin eritteiden DNA:n eristys ja kirjastosekvensointi: Magpure Stoll DNA KF -sarjaa käytettiin DNA:n eristämiseen emätin eritteistä; Rakennetaan metagenominen kirjasto käyttämällä MGIEasy universaalia DNA-kirjaston valmistussarjaa; Käytä Agilent 2100 Bioanalyzeria kirjaston fragmenttialueen ja pitoisuuden havaitsemiseen.
Hyväksytyt kirjastot sekvensoitiin käyttäen T1-sekvensointialustaa DNBSEQ-T7RS-suorituskykyisen sekvensointisarjan ohjeiden mukaisesti.
Metagenominen sekvensointitietojen bioinformatiikan analyysi: Metagenominen data on ensin alkuperäisten sekvenssien laadunvalvonnassa Trimomatic-ohjelmistolla, ja sitten saastuneet sekvenssit poistetaan käsitellystä datasta fastq_streen-ohjelmistolla, mukaan lukien isäntäsekvenssit ja phix-kirjaston saastuminen; Tämän jälkeen BWA-aligneria käytettiin vertailuun, ja ihmisen genomin fragmentit poistettiin ensin.
Mikrobilajien koostumus ja suhteellinen runsaus arvioitiin Metaphlan2-ohjelmistolla.
|
Näytteenkeräyksen valmistumisen jälkeen keskimäärin 1 vuosi.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Opintojen puheenjohtaja: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Opintojen puheenjohtaja: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- IRB-20250021-R
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .