- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT07365254
Dokładna Ocena i Badania Interwencyjne Dotyczące Sekwencjonowania Całego Genomu Noworodka oraz Ryzyka Chorób Genetycznych
Dokładna Ocena i Badania Interwencyjne dotyczące Sekwencjonowania Całego Genomu Noworodka i Ryzyka Chorób Genetycznych (China Baby Omics)
Zdrowie matek i niemowląt jest fundamentem zdrowia publicznego, a jego stan bezpośrednio odzwierciedla ogólny poziom zdrowotności populacji. Szybki rozwój społeczno-gospodarczy i coraz poważniejsze problemy środowiskowe sprawiły, że problemy zdrowotne kobiet i dzieci stały się bardziej powszechne i zróżnicowane. W nowej epoce zdrowie matek i dzieci stoi przed nowymi wyzwaniami, z większymi wymaganiami w obszarach takich jak promocja zdrowia reprodukcyjnego, zapobieganie wadom wrodzonym, bezpieczeństwo matek i niemowląt oraz profilaktyka chorób wieku dziecięcego. Badania kohortowe, jako metoda badawcza epidemiologii służąca do poznawania etiologii chorób, polegają na rekrutacji uczestników przed lub w trakcie ciąży oraz prowadzeniu obserwacji dotyczących ciąży, porodu i wyników zdrowotnych matek i dzieci po urodzeniu, w celu zidentyfikowania różnych czynników wpływających na choroby i zdrowie. Skupiając się na wczesnych etapach życia, to podejście jest skuteczną metodą badania związków między środowiskowymi, genetycznymi i behawioralnymi czynnikami ryzyka we wczesnym życiu a rozwojem embrionalnym, zdrowiem płodu i zdrowiem niemowląt.
Ten projekt planuje przeprowadzić długoterminowe obserwacje par i ich potomstwa w oparciu o rodzinę, jednocześnie zbierając próbki biologiczne w wielu punktach czasowych. Systematyczna, wielowymiarowa ocena, oparta na informacjach klinicznych i danych multi-omicznych z populacji objętej badaniem, zostanie wykorzystana do wnioskowania o przyczynach chorób reprodukcyjnych i związanych z ciążą oraz nieprawidłowości rozwojowych, zidentyfikowania nowych biomarkerów chorób związanych z ciążą, opracowania modeli predykcyjnych oraz rozpoznania czynników ryzyka we wczesnym życiu potomstwa, dostarczając tym samym wskazówek dla zapobiegania i kontroli chorób reprodukcyjnych i rozwojowych.
Przegląd badań
Status
Warunki
Szczegółowy opis
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Hengchao Ruan, phD
- Numer telefonu: 0571-88208964
- E-mail: ruanhengchao@zju.edu.cn
Lokalizacje studiów
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Chiny, 310006
- Rekrutacyjny
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria włączenia:
- Rodziny z trwającą ciążą (poprzez terapię wspomaganego rozrodu lub naturalne poczęcie) oraz noworodkami.
Kryteria wyłączenia:
- Brak
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Dane sekwencjonowania całego genomu
Ramy czasowe: Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
Przeprowadź sekwencjonowanie całego genomu 30-40X próbki cfDNA z surowicy zgodnie z instrukcją zestawu do sekwencjonowania wysokoprzepustowego DNBSEQ-T7RS (FCL PE100) V2.0 i wykonaj analizę bioinformatyczną danych sekwencjonowania.
|
Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
|
Stężenie metabolitu
Ramy czasowe: Po zakończeniu pobierania próbek średnio 1 rok.
|
Stężenie każdego metabolitu zostało przeanalizowane i obliczone przy użyciu zautomatyzowanego oprogramowania do bezwzględnej ilościowej oceny metabolizmu HMQuant, opracowanego niezależnie przez BGI.
|
Po zakończeniu pobierania próbek średnio 1 rok.
|
|
Konstrukcja i sekwencjonowanie cfRNA z krwi obwodowej matki
Ramy czasowe: Po zakończeniu pobierania próbek średnio 1 rok.
|
Budowę biblioteki i kontrolę jakości przeprowadzono zgodnie z metodą budowy biblioteki BGI PALM-seq, a następnie wykonano sekwencjonowanie cfRNA.
Bioinformatyka sekwencjonowania PALM-seq
|
Po zakończeniu pobierania próbek średnio 1 rok.
|
|
Dane dotyczące metylacji DNA całego genomu
Ramy czasowe: Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
Połączenie traktowania siarczynem z technologią sekwencjonowania wysokoprzepustowego umożliwia efektywne i precyzyjne mapowanie profili metylacji DNA w całym genomie, czyniąc to kluczowym narzędziem w badaniach epigenomicznych.
Opierając się na opracowanej krajowo technologii sekwencjonowania DNBSEQTM, BGI samodzielnie opracował nową metodę przygotowania bibliotek wykorzystującą cyklizację dwuniciową.
Podejście to skutecznie rozwiązuje problem zniekształceń zasad występujący w tradycyjnym sekwencjonowaniu metylacji, umożliwiając szybkie i efektywne uzyskiwanie autentycznych danych dotyczących poziomu metylacji.
|
Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
|
Różnice w ekspresji białek i analiza funkcjonalna
Ramy czasowe: Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
Przygotowanie próbki białka: Próbki pobrano z -80°C, a 50 μL każdej próbki poddano działaniu mocznika, ditiotreitolu i jodoacetamidu w celu redukcji i alkilacji.
Do usunięcia białek o wysokiej zawartości zastosowano płyty do ekstrakcji w fazie stałej, po czym dodano trypsynę do hydrolizy enzymatycznej.
Detekcja chromatografii cieczowej-spektrometrii mas: Po hydrolizie enzymatycznej peptydy analizowano przy użyciu nanorozdziału-chromatografii cieczowej wysokosprawnej-spektrometrii mas wysokiej rozdzielczości (Lumos, Thermo) w trybie DIA (niezależne od danych pozyskiwanie danych) do pozyskiwania danych.
Analiza danych: Do identyfikacji i ilościowego oznaczania białek z danych DIA wykorzystano oprogramowanie DIA-NN.
|
Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
|
Dane metagenomiczne
Ramy czasowe: Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
Ekstrakcja DNA z wydzieliny pochwowej i sekwencjonowanie biblioteki: Do ekstrakcji DNA z wydzieliny pochwowej użyto zestawu Magpure Stoll DNA KF; Skonstruowano bibliotekę metagenomiczną przy użyciu zestawu do przygotowania uniwersalnej biblioteki DNA MGIEasy; Do wykrycia zakresu fragmentów i stężenia biblioteki użyto analizatora Agilent 2100 Bioanalyzer.
Kwalifikowane biblioteki zostały zsekwencjonowane przy użyciu platformy sekwencjonowania T1 zgodnie z instrukcjami zestawu do sekwencjonowania wysokoprzepustowego DNBSEQ-T7RS.
Analiza bioinformatyczna danych sekwencjonowania metagenomicznego: Dane metagenomiczne są najpierw poddawane kontroli jakości oryginalnych sekwencji przy użyciu oprogramowania Trimomatic, a następnie z przetworzonych danych usuwane są zanieczyszczone sekwencje za pomocą oprogramowania fastq_streen, w tym sekwencje gospodarza i zanieczyszczenie biblioteki phix; Następnie użyto narzędzia do porównywania BWA, a fragmenty genomu ludzkiego zostały najpierw usunięte.
Skład gatunkowy mikroorganizmów i względną obfitość oceniono za pomocą oprogramowania Metaphlan2.
|
Po zakończeniu pobierania próbek, średnio 1 rok.
|
Współpracownicy i badacze
Współpracownicy
Śledczy
- Krzesło do nauki: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Krzesło do nauki: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- IRB-20250021-R
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .