- ICH GCP
- Registro de ensaios clínicos dos EUA
- Ensaio Clínico NCT07365254
Investigação de Avaliação e Intervenção Precisas sobre Sequenciação do Genoma Completo de Recém-nascidos e Risco de Doenças Genéticas
Investigação de Avaliação e Intervenção Precisas sobre Sequenciamento do Genoma Completo de Recém-Nascidos e Risco de Doenças Genéticas (China Baby Omics)
A saúde materna e infantil é o alicerce da saúde pública, e o seu estado reflete diretamente o nível geral de saúde da população. Com o rápido desenvolvimento socioeconómico e questões ambientais cada vez mais graves, os problemas de saúde entre mulheres e crianças tornaram-se mais generalizados e diversificados. Na nova era, a saúde materno-infantil enfrenta novos desafios, com exigências mais elevadas em áreas como a promoção da saúde reprodutiva, a prevenção de defeitos congénitos, a segurança materna e infantil e a prevenção de doenças na infância. Os estudos de coorte, como método de investigação epidemiológica para explorar a etiologia das doenças, envolvem o recrutamento de participantes antes ou durante a gravidez e a realização de acompanhamentos sobre a gravidez, o parto e os resultados de saúde materna e infantil após o nascimento, para identificar vários fatores que influenciam doenças e saúde. Centrando-se nas fases iniciais da vida, esta abordagem é um método eficaz para estudar as associações entre fatores de risco ambientais, genéticos e comportamentais durante a vida inicial e o desenvolvimento embrionário, a saúde fetal e a saúde infantil.
Este projeto planeia realizar acompanhamentos de longo prazo a casais e aos seus descendentes com base familiar, enquanto recolhe amostras biológicas em múltiplos momentos. Uma avaliação sistemática multidimensional, baseada em informação clínica e dados multi-ómicos da população inscrita, será usada para inferir as causas de doenças reprodutivas e relacionadas com a gravidez e anomalias de desenvolvimento, identificar novos biomarcadores para doenças relacionadas com a gravidez, estabelecer modelos preditivos e reconhecer fatores de risco na vida inicial dos descendentes, fornecendo assim orientação para a prevenção e controlo de doenças reprodutivas e de desenvolvimento.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Descrição detalhada
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Hengchao Ruan, phD
- Número de telefone: 0571-88208964
- E-mail: ruanhengchao@zju.edu.cn
Locais de estudo
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Zhejiang
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Hangzhou, Zhejiang, China, 310006
- Recrutamento
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critérios de Inclusão:
- Famílias com gravidezes em curso (através de terapia de reprodução assistida ou conceção natural) e bebés recém-nascidos.
Critérios de Exclusão:
- Nenhum
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Dados de sequenciação do genoma completo
Prazo: Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Realizar a sequenciação completa do genoma 30-40X da amostra de cfDNA do soro de acordo com as instruções do DNBSEQ-T7RS High-throughput Sequencing Kit (FCL PE100) V2.0, e realizar a análise bioinformática dos dados de sequenciação.
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Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Concentração de metabolito
Prazo: Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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A concentração de cada metabolito foi analisada e calculada usando o software de quantificação absoluta metabólica automatizada HMQuant, desenvolvido independentemente pela BGI.
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Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Construção e sequenciação de cfRNA a partir de sangue periférico materno
Prazo: Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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A construção da biblioteca e o controlo de qualidade foram realizados de acordo com o método de construção da biblioteca BGI PALM-seq, seguido de sequenciação de cfRNA.
A bioinformática de sequenciação PALM-seq
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Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Dados de metilação do DNA do genoma completo
Prazo: Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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A combinação do tratamento com bissulfito com a tecnologia de sequenciação de alto débito permite o mapeamento eficiente e preciso de perfis de metilação do ADN do genoma completo, tornando-a uma ferramenta crucial para a investigação em epigenómica.
Com base na tecnologia de sequenciação DNBSEQTM desenvolvida internamente, a BGI desenvolveu independentemente um novo método de preparação de bibliotecas que utiliza a ciclização de cadeia dupla.
Esta abordagem resolve eficazmente o problema de viés de base presente na sequenciação de metilação tradicional, permitindo a aquisição rápida e eficiente de dados autênticos de níveis de metilação.
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Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Diferenças na expressão proteica e análise funcional
Prazo: Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Preparação da amostra de proteína: As amostras foram retiradas de -80°C, e 50 µL de cada amostra foram tratados com ureia, ditiotreitol e iodoacetamida para redução e alquilação.
Placas de extração em fase sólida foram utilizadas para remover proteínas de alta abundância, seguido da adição de tripsina para hidrólise enzimática.
Detecção por cromatografia líquida-espectrometria de massa: Após a hidrólise enzimática, os péptidos foram analisados utilizando cromatografia líquida de nanofluxo de alto desempenho-espectrometria de massa de alta resolução (Lumos, Thermo) no modo DIA (aquisição de dados independente) para aquisição de dados.
Análise de dados: O software DIA-NN foi utilizado para identificar e quantificar proteínas a partir dos dados DIA.
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Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Os dados metagenómicos
Prazo: Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Extração de ADN de secreções vaginais e sequenciação da biblioteca: Utilizou-se o kit Magpure Stoll DNA KF para extrair ADN das secreções vaginais; Construiu-se uma biblioteca metagenómica utilizando o kit de preparação de biblioteca de ADN universal MGIEasy; Utilizou-se o Agilent 2100 Bioanalyzer para detetar o intervalo de fragmentos e a concentração da biblioteca.
Bibliotecas qualificadas foram sequenciadas utilizando a plataforma de sequenciação T1 de acordo com as instruções do kit de sequenciação de alto rendimento DNBSEQ-T7RS.
Análise bioinformática de dados de sequenciação metagenómica: Os dados metagenómicos são primeiro submetidos a controlo de qualidade das sequências originais utilizando o software Trimomatic, e depois as sequências contaminadas são removidas dos dados processados utilizando o software fastq_streen, incluindo sequências do hospedeiro e contaminação da biblioteca phix; Posteriormente, o alinhador BWA foi utilizado para comparação, e os fragmentos do genoma humano foram primeiro removidos.
A composição das espécies microbianas e a abundância relativa foram avaliadas utilizando o software Metaphlan2.
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Após a conclusão da recolha de amostras, uma média de 1 ano.
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Colaboradores e Investigadores
Colaboradores
Investigadores
- Cadeira de estudo: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Cadeira de estudo: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- IRB-20250021-R
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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