- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT07365254
Accurata Valutazione e Ricerca di Intervento sul Sequenziamento dell'Intero Genoma del Neonato e sul Rischio di Malattie Genetiche
Ricerca su Valutazione Precisa e Intervento sul Sequenziamento del Genoma Completo dei Neonati e sul Rischio di Malattie Genetiche (China Baby Omics)
La salute materna e infantile è il fondamento della salute pubblica e il suo stato riflette direttamente il livello complessivo di salute della popolazione. Con il rapido sviluppo socioeconomico e i problemi ambientali sempre più gravi, i problemi di salute tra donne e bambini sono diventati più diffusi e diversificati. Nella nuova era, la salute materna e infantile affronta nuove sfide, con richieste più elevate in aree come la promozione della salute riproduttiva, la prevenzione dei difetti alla nascita, la sicurezza materna e infantile e la prevenzione delle malattie infantili. Gli studi di coorte, come metodo di ricerca epidemiologica per esplorare l'eziologia delle malattie, coinvolgono il reclutamento di partecipanti prima o durante la gravidanza e il follow-up di gravidanza, parto e risultati di salute materna e infantile dopo la nascita per identificare vari fattori che influenzano le malattie e la salute. Concentrandosi sulle fasi iniziali della vita, questo approccio è un metodo efficace per studiare le associazioni tra fattori di rischio ambientali, genetici e comportamentali durante la prima infanzia e lo sviluppo embrionale, la salute fetale e la salute infantile.
Questo progetto prevede di condurre follow-up a lungo termine sulle coppie e sulla loro prole su base familiare, raccogliendo allo stesso tempo campioni biologici in più momenti temporali. Una valutazione sistematica multidimensionale, basata su informazioni cliniche e dati multi-omici della popolazione arruolata, sarà utilizzata per dedurre le cause delle malattie riproduttive e correlate alla gravidanza e delle anomalie dello sviluppo, identificare nuovi biomarcatori per le malattie correlate alla gravidanza, stabilire modelli predittivi e riconoscere i fattori di rischio nella prima infanzia della prole, fornendo così una guida per la prevenzione e il controllo delle malattie riproduttive e dello sviluppo.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Hengchao Ruan, phD
- Numero di telefono: 0571-88208964
- Email: ruanhengchao@zju.edu.cn
Luoghi di studio
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Zhejiang
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Hangzhou, Zhejiang, Cina, 310006
- Reclutamento
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criteri di inclusione:
- Famiglie con gravidanze in corso (tramite terapia di procreazione assistita o concepimento naturale) e neonati.
Criteri di esclusione:
- Nessuno
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Dati di sequenziamento dell'intero genoma
Lasso di tempo: Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Eseguire il sequenziamento dell'intero genoma 30-40X del campione di cfDNA sierico secondo le istruzioni del kit di sequenziamento ad alto rendimento DNBSEQ-T7RS (FCL PE100) V2.0, e condurre l'analisi bioinformatica dei dati di sequenziamento.
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Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Concentrazione di metaboliti
Lasso di tempo: Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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La concentrazione di ciascun metabolita è stata analizzata e calcolata utilizzando il software di quantificazione assoluta metabolica mirata automatizzata HMQuant, sviluppato in modo indipendente da BGI.
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Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Costruzione e sequenziamento di cfRNA dal sangue periferico materno
Lasso di tempo: Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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La costruzione della libreria e il controllo di qualità sono stati eseguiti secondo il metodo di costruzione della libreria BGI PALM-seq, seguiti dal sequenziamento cfRNA.
La bioinformatica del sequenziamento PALM-seq
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Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Dati di metilazione del DNA dell'intero genoma
Lasso di tempo: Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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La combinazione del trattamento con bisolfito e della tecnologia di sequenziamento ad alto rendimento consente la mappatura efficiente e accurata dei profili di metilazione del DNA dell'intero genoma, rendendola uno strumento cruciale per la ricerca in epigenomica.
Basandosi sulla tecnologia di sequenziamento DNBSEQTM sviluppata internamente, BGI ha sviluppato autonomamente un nuovo metodo di preparazione delle librerie che utilizza la ciclizzazione a doppio filamento.
Questo approccio affronta efficacemente il problema del bias di base presente nel sequenziamento tradizionale della metilazione, consentendo l'acquisizione rapida ed efficiente di dati autentici sul livello di metilazione.
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Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Differenze nell'espressione proteica e analisi funzionale
Lasso di tempo: Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Preparazione del campione proteico: I campioni sono stati prelevati da -80°C e 50 μL di ciascun campione sono stati trattati con urea, ditiotreitolo e iodoacetamide per riduzione e alchilazione.
Le piastre per l'estrazione in fase solida sono state utilizzate per rimuovere le proteine ad alta abbondanza, seguite dall'aggiunta di tripsina per idrolisi enzimatica.
Rilevamento mediante cromatografia liquida-spettrometria di massa: Dopo l'idrolisi enzimatica, i peptidi sono stati analizzati utilizzando la nano-cromatografia liquida ad alte prestazioni-spettrometria di massa ad alta risoluzione (Lumos, Thermo) in modalità DIA (acquisizione indipendente dai dati) per l'acquisizione dei dati.
Analisi dei dati: Il software DIA-NN è stato utilizzato per identificare e quantificare le proteine dai dati DIA.
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Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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I dati metagenomici
Lasso di tempo: Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Estrazione del DNA dalle secrezioni vaginali e sequenziamento della libreria: Il kit Magpure Stoll DNA KF è stato utilizzato per estrarre il DNA dalle secrezioni vaginali; Costruire una libreria metagenomica utilizzando il kit di preparazione della libreria universale di DNA MGIEasy; Utilizzare l'Agilent 2100 Bioanalyzer per rilevare l'intervallo dei frammenti e la concentrazione della libreria.
Le librerie qualificate sono state sequenziate utilizzando la piattaforma di sequenziamento T1 secondo le istruzioni del kit di sequenziamento ad alto rendimento DNBSEQ-T7RS.
Analisi bioinformatica dei dati di sequenziamento metagenomico: I dati metagenomici sono prima sottoposti a controllo di qualità delle sequenze originali utilizzando il software Trimomatic, quindi le sequenze contaminate vengono rimosse dai dati elaborati utilizzando il software fastq_streen, incluse le sequenze dell'ospite e la contaminazione della libreria phix; Successivamente, è stato utilizzato l'allineatore BWA per il confronto, e i frammenti del genoma umano sono stati rimossi per primi.
La composizione delle specie microbiche e l'abbondanza relativa sono state valutate utilizzando il software Metaphlan2.
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Dopo il completamento della raccolta dei campioni, una media di 1 anno.
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Collaboratori e investigatori
Collaboratori
Investigatori
- Cattedra di studio: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Cattedra di studio: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Stimato)
Completamento dello studio (Stimato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- IRB-20250021-R
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
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