Marfan 연구에서 심혈관 중증도에 대한 게놈 차원의 전이 (GEMS)
마르판 증후군(MFS)은 안구, 골격 및 심혈관계에 다발성 발현이 나타나는 상염색체 우성 결합 조직 장애입니다. 이환율과 사망률은 대부분 대동맥 근부 동맥류 박리 및 파열에 의해 결정됩니다. 세포외 기질 단백질인 피브릴린-1을 코딩하는 유전자인 FBN1의 돌연변이가 이 질환의 유전적 원인으로 잘 알려져 있지만, 원인이 되는 FBN1 돌연변이의 성격이나 위치와 표현형 결과 사이에는 상관관계가 매우 낮습니다. 실제로, 광범위한 가족 내 및 가족 간 표현형 다양성이 관찰됩니다. 따라서 모든 가족 구성원의 동일한 일차 돌연변이가 있어도 임상 스펙트럼은 완전히 무증상부터 어린 나이에 대동맥 박리로 인한 급사까지 매우 다양합니다. 이러한 가변성을 뒷받침하는 정확한 메커니즘은 아직 파악하기 어렵습니다.
결과적으로, 1차 돌연변이의 기능적 효과에 대한 더 나은 이해가 매우 필요하며 이러한 효과를 수정하는 유전적 변이의 식별이 점점 더 중요해지고 있습니다. 이 프로젝트에서 우리는 마르판 증후군 대동맥병증과 관련하여 자연 자체의 변형 능력을 발견하기 위해 다양한 혁신적인 전략을 신중하게 선택했습니다.
연구 개요
상태
상태
정황
정황
개입 / 치료
개입 / 치료
상세 설명
이 프로젝트에서 우리는 마르판 증후군의 심혈관, 더 구체적으로 TAAD(흉부 대동맥 동맥류 박리) 발현성에 초점을 맞출 것입니다. 상당한 대동맥병증 발현성을 갖는 FBN1(피브릴린-1)에서 가장 빈번한 돌연변이는 p.Ile2585Thr이고; c.7754T>C 및 p.Ala882Val; c.2645C>T). 사용되는 인구를 p.Ile2585Thr로 제한합니다. c.7754T>C 돌연변이는 이것이 가장 큰 개체군이기 때문입니다.
동일한 FBN1 돌연변이를 보유한 마르판 증후군 환자는 한 가족 내에서도 다양한 대동맥병증 발현성을 나타냅니다. 우리는 심혈관 표현형 다양성이 유전적 변형자의 통제하에 있다고 가정합니다.
첫 번째 접근 전략은 대동맥 동맥류 질환의 중증도(Z-점수, 수술 시기 및 수동 전문 큐레이션 기준)에 따라 유의미한 가변성 대동맥병증 발현성을 나타내는 특정 FBN1 돌연변이 보유자의 순위를 매기는 것입니다. 우리는 개인을 경증 또는 대동맥 질환 없음(UMC, 영향을 받지 않은 돌연변이 보인자), 심각한 영향을 받은(AMC, 영향을 받은 돌연변이 보인자), 불확실한 데이터가 있는 참가자의 세 그룹으로 분류할 것입니다.
두 번째 접근법은 WGS(Whole Genome Sequencing) 및 연계 분석을 사용하여 25% 극단 코호트(AMC 및 UMC)의 분자 특성화입니다.
마지막으로 10개의 심각한 영향을 받은 돌연변이 보균자(AMC)와 10개의 영향을 받지 않은 돌연변이 보균자(UMC)의 피험자 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)와 2개의 대조군이 iPSC(유도 다능성 줄기 세포)로 재프로그래밍됩니다. 이들 세포는 최종적으로 VSMC(VasculairSmoth Muscle Cells)로 분화됩니다. iPSC 및 VSMC의 게놈 무결성 및 정체성은 RT-PCR 및 면역세포화학을 사용하여 검증됩니다.
전사체(즉 RNA 시퀀싱) 데이터는 이러한 특정 유도 만능 줄기 세포 유래 혈관 평활근 세포(iPSC-VSMC)로부터 획득됩니다.
두 데이터 유형의 동기화를 통해 AMC와 UMC iPSC-VSMC를 비교할 때 차별적으로 발현되는 유전자의 변종 품질과 위치를 기반으로 WGS 데이터를 필터링할 수 있습니다. 이 접근법을 통해 우리는 변형 유전자를 식별할 수 있습니다. 후보 수정자 유전자(및 그에 따른 후보 수정자 변이체)가 확인되면 해당 수정 능력은 관련 세포 또는 동물 모델에서 기능적으로 확인됩니다. 모델 시스템의 선택은 식별된 수정자의 특성에 따라 결정됩니다. 동물 모델에서 우리는 관심 있는 변이체를 보유한 동물을 MFS 모델과 교배하여 심혈관 표현형을 크게 변경함으로써 그 효과를 입증할 것입니다. 확인된 변형 유전자의 기능과 진화적 보존에 따라 제브라피시 또는 마우스 모델이 사용됩니다.
또는 식별된 수정자는 사용 가능하고 기능적으로 특성이 완전히 특성화된 iPSC-VSMC 라인에서 최첨단 CRISPR/Cas9 게놈 편집 기술을 사용하여 기능적으로 검증됩니다.
가장 흥미로운 후보 유전자의 변형 역할에 대한 추가 증거는 대규모 복제 코호트 중 심혈관계에 가장 심각하게 영향을 받은 MFS 사례 25%에서 이들 유전자의 코딩 및 조절 서열의 표적화된 재서열 분석을 수행함으로써 얻을 수 있습니다. 임상적으로나 분자적으로(FBN1 돌연변이 양성) 특성화된 지표 사례가 3000건 이상입니다.
가능할 때마다, TAAD로부터 보호된 나머지 후보 수식자 변이체의 분리는 FBN1 돌연변이를 보유하는 프로밴드 친척의 이용 가능한 gDNA 샘플에서 조사될 것입니다.
연구 유형
연구 유형
등록 (추정된)
등록
연락처 및 위치
연구 연락처
연구 연락처
- 이름: Bart Loeys, Prof,MD,PhD
- 전화번호: ++32-3-2759768
- 이메일: bart.loeys@uantwerpen.be
연구 연락처 백업
- 이름: Paul Coucke, Prof,PhD,Ing
- 전화번호: ++32-9-3323634
- 이메일: paul.coucke@ugent.be
연구 장소
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Prins Boudewijnlaan 43/6
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Edegem, Prins Boudewijnlaan 43/6, 벨기에, 2650
- 모병
- University Hospital Antwerp
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연락하다:
- Bart Loeys
- 전화번호: +3232759768
- 이메일: bart.loeys@uantwerpen.be
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연락하다:
- Paul Coucke
- 전화번호: +3293323634
- 이메일: paul.coucke@ugent.be
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부수사관:
- Julie De Backer, Prof,MD,PhD
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부수사관:
- Laura Muiño Mosquera, MD,PhD
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부수사관:
- Josephina Meester, MD,PhD
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부수사관:
- Aline Verstraeten, MD,PhD
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참여기준
자격 기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- FBN1 유전자에 입증된 돌연변이(p.Ile2585Thr;c.7754C>T)가 있는 참가자
제외 기준:
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공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
그룹/코호트 수
코호트 및 개입
그룹/코호트그룹/코호트 |
개입 / 치료개입 / 치료 |
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AMC(영향을 받는 돌연변이 운반체)
FBN1 돌연변이(마르판 증후군) - 표현형 심혈관 중증 결과
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모든 참가자는 타액 샘플(자체 샘플링 키트)을 제공합니다 - WGS 및 연계 분석을 위한 25% 극단(UMC 및 AMC) 참가자 선택
WGS 결과를 바탕으로 iPSC-VSMC 세대의 가장 극단(UMC 및 AMC) 참가자 5%를 선정합니다.
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UMC(영향을 받지 않는 돌연변이 운반체)
FBN1 돌연변이(마르판 증후군) - 표현형 심혈관 경미한 결과
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모든 참가자는 타액 샘플(자체 샘플링 키트)을 제공합니다 - WGS 및 연계 분석을 위한 25% 극단(UMC 및 AMC) 참가자 선택
WGS 결과를 바탕으로 iPSC-VSMC 세대의 가장 극단(UMC 및 AMC) 참가자 5%를 선정합니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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조립된 25% 극단 말단 코호트(UMC 및 AMC)의 분자적 특성 분석.
기간: 2023년 9월
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이 목적을 위해 WGS(Whole Genome Sequencing) 및 연계 분석이 사용됩니다.
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2023년 9월
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2차 결과 측정
2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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코호트(UMC 및 AMC)의 5% 극단에서 수정자 식별을 위한 오믹스 통합
기간: 2023년 9월
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변형자 유전자는 스펙트럼의 5% 극단에서 MFS 개체의 iPSC-VSMC가 생성되는 방식으로 식별됩니다.
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2023년 9월
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수정자의 기능적 검증.
기간: 2024년
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변형자의 검증을 위해 CRISP/Cas9 유전자 편집 기술이 사용됩니다.
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2024년
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대규모 MFS 코호트에서 식별된 수정자의 복제 기간: 2024년 12월
기간: 2024년
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가장 흥미로운 후보 유전자의 변형 역할에 대한 증거는 임상적으로나 분자적으로 3000개 이상으로 구성된 대규모 복제 코호트 중 심혈관계에 가장 심각하게 영향을 받은 MFS 사례 25%에서 이러한 유전자의 표적화된 재서열 분석을 다시 수행함으로써 얻을 수 있습니다. 특징적인 지수 참가자.
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2024년
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공동 작업자 및 조사자
협력자
협력자
수사관
수사관
- 수석 연구원: Bart Loeys, Prof,MD,PhD, University Hospital, Antwerp
- 연구 의자: Paul Coucke, Prof,MD,Ing, University Hospital, Ghent
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Loeys BL, Dietz HC, Braverman AC, Callewaert BL, De Backer J, Devereux RB, Hilhorst-Hofstee Y, Jondeau G, Faivre L, Milewicz DM, Pyeritz RE, Sponseller PD, Wordsworth P, De Paepe AM. The revised Ghent nosology for the Marfan syndrome. J Med Genet. 2010 Jul;47(7):476-85. doi: 10.1136/jmg.2009.072785.
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기타 연구 ID 번호
기타 연구 ID 번호
- 20/08/087
- 1S81820N (기타 보조금/기금 번호: FWO (Foundation for national research Belgium))
- B3002021000292 (기타 식별자: Belgian number)
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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