Molecular Profiling for Risk Stratification in Appendiceal Cancer
2026년 6월 25일 업데이트: City of Hope Medical Center
Molecular Profiling for Tumor Characterization and Risk Stratification in Patients With Appendiceal Cancer
This study investigates integrated epigenetic and epitranscriptomic features of appendiceal cancer using archived tumor tissue specimens from the same patient cohort.
The study includes DNA methylation profiling and m6A epitranscriptomic profiling to define molecular subtypes, evaluate associations with clinicopathologic features, and develop molecular risk scores for prognostic stratification.
The primary goal is to determine whether DNA methylation- and m6A-based molecular features can complement conventional histopathologic grading and improve risk stratification.
연구 개요
상태
상태
모병
정황
정황
개입 / 치료
개입 / 치료
상세 설명
Appendiceal cancer is a rare and heterogeneous malignancy with limited clinically actionable biomarkers for risk stratification. Histologic grade remains one of the strongest determinants of prognosis, but outcomes among patients with lower-grade disease remain variable. This study is designed to characterize the molecular architecture of appendiceal cancer through integrated analysis of DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiles generated from archived tumor tissue specimens from the same patient cohort.
The study uses formalin-fixed paraffin-embedded appendiceal cancer tissues, and where available benign or normal appendix tissues, together with matched clinicopathologic and follow-up data. DNA methylation profiling is performed to evaluate tumor-associated methylation patterns, identify differentially methylated regions or features, and assess their association with clinical and survival outcomes. In parallel, m6A epitranscriptomic profiling is performed using m6A-enriched RNA sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.
Molecular data are analyzed to identify tumor-associated epigenetic and epitranscriptomic alterations, define molecular subtypes, and construct continuous molecular risk scores. These molecular features are evaluated in relation to histologic grade, histologic subtype, lymph node metastasis, lymphovascular invasion, perineural invasion, peritoneal cancer index, overall survival, and progression-free survival.
The study aims to determine whether DNA methylation and m6A-based profiling can provide complementary molecular information for appendiceal cancer classification, prognostic modeling, and future biomarker development.
연구 유형
연구 유형
관찰
등록 (추정된)
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400
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 연락처
연구 연락처
- 이름: Ajay Goel
- 전화번호: 6262184673
- 이메일: ajgoel@coh.org
연구 장소
-
-
California
-
Durate, California, 미국, 91016
- 모병
- City of Hope Medical Center
-
연락하다:
- Ajay Goel, MD
- 전화번호: 6262184673
- 이메일: ajgoel@coh.org
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
The study population includes adult patients with appendiceal cancer whose archived tumor specimens and associated clinicopathologic data are available for retrospective molecular profiling.
The same patient cohort is used for DNA methylation and m6A epitranscriptomic analyses where sufficient biospecimen material is available.
Benign or normal appendix tissue specimens may be included as non-malignant reference controls.
설명
Inclusion Criteria:
- Patients with histologically confirmed appendiceal adenocarcinoma or appendiceal cancer.
- Availability of archived tumor tissue suitable for molecular profiling.
- Availability of tissue for DNA methylation profiling, m6A epitranscriptomic profiling, or both.
- Availability of relevant clinicopathologic data.
- Availability of survival or follow-up information when applicable.
- Age 18 years or older at diagnosis or tissue collection.
Exclusion Criteria:
- Insufficient tissue quantity or quality for molecular profiling.
- Inadequate DNA or RNA quality for sequencing or molecular assay preparation.
- Missing essential clinicopathologic information required for analysis.
- Non-appendiceal primary tumor or metastatic tumor to the appendix from another primary site.
- Patients who do not meet institutional review board or consent requirements, if applicable.
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
그룹/코호트 수
2
코호트 및 개입
그룹/코호트그룹/코호트 |
개입 / 치료개입 / 치료 |
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Appendiceal Cancer Cohort
Patients with histologically confirmed appendiceal cancer whose archived tumor tissue specimens and clinicopathologic data are available for integrated DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiling.
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Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes.
The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.
The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.
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Benign Appendix Reference Cohort
Individuals with benign or normal appendix tissue specimens used as non-malignant reference samples for comparison of tumor-associated DNA methylation and m6A epitranscriptomic features.
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Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes.
The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.
The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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Overall Survival
기간: Through study completion, an average of 1 year
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Overall survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics.
Survival analyses may include Kaplan-Meier analysis and Cox proportional hazards models
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Through study completion, an average of 1 year
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Progression-Free Survival
기간: Through study completion, an average of 1 year
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Progression-free survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics.
Time-to-event analyses may be performed using standard survival analysis methods.
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Through study completion, an average of 1 year
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공동 작업자 및 조사자
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연구 기록 날짜
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연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
연구 시작
2026년 5월 1일
기본 완료 (추정된)
기본 완료
2027년 1월 1일
연구 완료 (추정된)
연구 완료
2027년 1월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
최초 제출
2026년 5월 4일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2026년 5월 8일
처음 게시됨 (실제)
처음 게시됨
2026년 5월 14일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
마지막 업데이트 게시됨
2026년 6월 29일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2026년 6월 25일
마지막으로 확인됨
마지막으로 확인됨
2026년 6월 1일
추가 정보
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키워드
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기타 연구 ID 번호
기타 연구 ID 번호
- 23228_CIPHER-AC
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아니요
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아니
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아니
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