Molecular Profiling for Risk Stratification in Appendiceal Cancer
Molecular Profiling for Tumor Characterization and Risk Stratification in Patients With Appendiceal Cancer
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Appendiceal cancer is a rare and heterogeneous malignancy with limited clinically actionable biomarkers for risk stratification. Histologic grade remains one of the strongest determinants of prognosis, but outcomes among patients with lower-grade disease remain variable. This study is designed to characterize the molecular architecture of appendiceal cancer through integrated analysis of DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiles generated from archived tumor tissue specimens from the same patient cohort.
The study uses formalin-fixed paraffin-embedded appendiceal cancer tissues, and where available benign or normal appendix tissues, together with matched clinicopathologic and follow-up data. DNA methylation profiling is performed to evaluate tumor-associated methylation patterns, identify differentially methylated regions or features, and assess their association with clinical and survival outcomes. In parallel, m6A epitranscriptomic profiling is performed using m6A-enriched RNA sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.
Molecular data are analyzed to identify tumor-associated epigenetic and epitranscriptomic alterations, define molecular subtypes, and construct continuous molecular risk scores. These molecular features are evaluated in relation to histologic grade, histologic subtype, lymph node metastasis, lymphovascular invasion, perineural invasion, peritoneal cancer index, overall survival, and progression-free survival.
The study aims to determine whether DNA methylation and m6A-based profiling can provide complementary molecular information for appendiceal cancer classification, prognostic modeling, and future biomarker development.
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Ajay Goel
- Numer telefonu: 6262184673
- E-mail: ajgoel@coh.org
Lokalizacje studiów
-
-
California
-
Durate, California, Stany Zjednoczone, 91016
- Rekrutacyjny
- City of Hope Medical Center
-
Kontakt:
- Ajay Goel, MD
- Numer telefonu: 6262184673
- E-mail: ajgoel@coh.org
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Inclusion Criteria:
- Patients with histologically confirmed appendiceal adenocarcinoma or appendiceal cancer.
- Availability of archived tumor tissue suitable for molecular profiling.
- Availability of tissue for DNA methylation profiling, m6A epitranscriptomic profiling, or both.
- Availability of relevant clinicopathologic data.
- Availability of survival or follow-up information when applicable.
- Age 18 years or older at diagnosis or tissue collection.
Exclusion Criteria:
- Insufficient tissue quantity or quality for molecular profiling.
- Inadequate DNA or RNA quality for sequencing or molecular assay preparation.
- Missing essential clinicopathologic information required for analysis.
- Non-appendiceal primary tumor or metastatic tumor to the appendix from another primary site.
- Patients who do not meet institutional review board or consent requirements, if applicable.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Appendiceal Cancer Cohort
Patients with histologically confirmed appendiceal cancer whose archived tumor tissue specimens and clinicopathologic data are available for integrated DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiling.
|
Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes.
The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.
The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.
|
|
Benign Appendix Reference Cohort
Individuals with benign or normal appendix tissue specimens used as non-malignant reference samples for comparison of tumor-associated DNA methylation and m6A epitranscriptomic features.
|
Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes.
The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.
The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Overall Survival
Ramy czasowe: Through study completion, an average of 1 year
|
Overall survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics.
Survival analyses may include Kaplan-Meier analysis and Cox proportional hazards models
|
Through study completion, an average of 1 year
|
|
Progression-Free Survival
Ramy czasowe: Through study completion, an average of 1 year
|
Progression-free survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics.
Time-to-event analyses may be performed using standard survival analysis methods.
|
Through study completion, an average of 1 year
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Nowotwory według lokalizacji
- Nowotwory
- Choroby jelit
- Nowotwory według typu histologicznego
- Nowotwory przewodu pokarmowego
- Nowotwory Układu Pokarmowego
- Choroby Układu Pokarmowego
- Choroby przewodu pokarmowego
- Nowotwory jelit
- Nowotwory gruczołowe i nabłonkowe
- Rak gruczołowy
- Rak
- Nowotwory, torbielowate, śluzowe i surowicze
- Nowotwory jelita ślepego
- Choroby jelita ślepego
- Gruczolakorak, Śluzowy
- Nowotwory wyrostka robaczkowego
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 23228_CIPHER-AC
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .