DNA 메틸화 및 자가면역 갑상선 질환 (THYRODNA)
자가면역 갑상선 질환을 앓고 있는 소아 및 청소년의 DNA 메틸화에 관한 연구
연구 개요
상세 설명
하시모토 갑상선염(HT)과 그레이브스병(GD)은 자가 세포 및 조직에 대한 비정상적인 면역 반응에 의해 발생하는 것으로 알려져 있습니다. HT는 갑상선기능저하증으로 이어지는 갑상선의 세포 매개 자가면역 파괴를 포함합니다. GD는 면역 세포가 갑상선의 갑상선 자극 호르몬(TSH) 수용체에 대한 자극 항체를 만들어 갑상선 기능 항진증을 일으키는 과정에 의해 발생합니다. 유전적 요인이 자가면역 질환 발병 위험을 증가시킨다는 실질적인 증거가 있지만 일란성 쌍둥이는 여전히 질병에 대해 일치하지 않으며(질병 일치성은 결코 100%가 아님) 환경 요인과 후성유전학의 역할을 시사합니다.
후생유전학은 환경이 유전자형과 상호작용하여 DNA 서열을 직접 변경하지 않는 염색질의 변형을 통해 다양한 표현형을 생성하는 메커니즘을 연구하는 새로운 생물학 분야입니다. 이러한 변형은 변경된 유전자 발현 및 반복 요소의 침묵과 관련이 있으며 유사분열로 유전될 수 있습니다. Epigenetic 메커니즘에는 DNA 메틸화, 히스톤 변형 또는 miRNA 전사 후 조절이 포함됩니다. DNA 메틸화는 메틸 공여체 S-아데노실메티오닌으로부터 CpG 디뉴클레오티드의 탄소-5 위치에 메틸 그룹을 공유 결합하는 것과 관련되며 DNA 메틸트랜스퍼라제(DNMT)라는 효소 그룹에 의해 매개됩니다. CpG 디뉴클레오티드는 일반적으로 CGI(섬)로 알려진 영역에서 함께 그룹화됩니다. CGI는 유전자의 프로모터 영역에서 찾을 수 있으며, 이러한 유전자 프로모터의 CpG 메틸화는 전사 침묵과 관련이 있습니다. 대조적으로, 과메틸화된 유전자는 전사적으로 활성인 것으로 밝혀졌다.
지금까지 HT 및 GD 환자에 대한 매우 제한된 수의 후생유전학 연구가 발표되었습니다. 따라서 본 연구의 목적은 CD40L, FOXP3, CTLA4와 같은 자가면역 갑상선 질환에 대한 감수성 유전자좌 또는 부위로 이전에 확인된 게놈 부위의 프로모터 영역 내 백혈구(WBC)의 DNA 메틸화 상태를 분석하는 것입니다. , PTPN22, IL2RA, FCRL3 및 HLADRB1 유전자.
처음에는 혈액 샘플 수집뿐만 아니라 환자 및 대조군 모집이 이루어질 것입니다. 또한 연구에 포함된 모든 참가자에 대해 완전한 신체 검사를 수행할 것이며, 포함하기 전에 자세한 개인, 가족, 임신 및 주산기 이력도 얻을 것입니다. 모든 참가자의 혈액 샘플을 채취하여 원심분리한 다음 백혈구(WBC), 혈장 및 혈청을 분리하여 냉동고에 보관합니다.
실험실 분석이 뒤따를 것입니다. 제조업체의 지침에 따라 QIAamp DNA Blood Mini Kit를 사용하여 말초 백혈구에서 DNA를 분리합니다. 그런 다음 제조업체의 프로토콜에 따라 Zymo EZ DNA 메틸화-골드 키트를 사용하여 아황산수소나트륨으로 처리합니다. 따라서 메틸화되지 않은 시토신은 우라실로 전환되는 반면, 메틸화 시토신은 변하지 않고 남게 됩니다. 연구 중인 유전자 프로모터 영역에서 DNA의 메틸화 상태의 정량화는 변형된 DNA를 감지하는 특정 프라이머를 사용하여 실시간 PCR 및 선택된 DNA 단편의 용융 곡선 분석을 통해 이루어집니다. 앰플리콘은 또한 전기영동으로 분석되고 자외선 투과 조명으로 시각화됩니다.
전자 데이터베이스가 구축되고 통계 분석이 뒤따를 것입니다. 결과 및 결론은 피어 리뷰 저널에 게시되고 국제 회의에서 발표됩니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Thessaloniki, 그리스, 56403
- Unit of Pediatric Endocrinology, Diabetes and Metabolism-4th Department of Pediatrics, Medical School of Aristotle University of Thessaloniki
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
HT의 경우:
항갑상선 과산화효소(anti-TPO) 또는 항갑상선글로불린(anti-Tg) 항체의 양성 역가 및 다음 중 하나 이상:
- L-thyroxine으로 대체 치료가 필요한 비정상적인 갑상선 기능(TSH > 5 μIU/ml 및 fT4 또는 fT3 수준의 감소 또는 정상)
- 갑상선의 부피 증가(고이터)
- 갑상선 초음파의 형태학적 변화
GD의 경우:
- 갑상선 자극 항체(anti-TSI)의 양성 역가 및
- TSH 수치 감소 및 fT4 또는 fT3 수치 증가
컨트롤의 경우:
- 그렇지 않으면 건강한 어린이 및 청소년, 환자와 연령 및 성별 일치
- 이전에 알려진 자가면역 병인 또는 아토피의 만성 질환이 없는 자(항히스타민제, 항염증제, 코르티코스테로이드 또는 항간질제로 만성 치료를 받은 병력이 있는 사람 포함)
- 직계가족의 자가면역질환 가족력 부재
제외 기준:
- 백인 출신이 아니거나 참가자 간의 친화력이 없습니다.
- 18세 이상의 진단 연령
- 질병 기간 3개월 미만
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 케이스 컨트롤
- 시간 관점: 단면
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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하시모토 갑상선염(HT)
하시모토 갑상선염이 있는 소아 및 청소년은 갑상선 기능 저하 또는 정상 갑상선입니다.
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그레이브스병(GD)
관해 상태이거나 항갑상선 약물 치료를 받고 있는 그레이브스병을 앓고 있는 소아 및 청소년.
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컨트롤(C)
1) 자가면역질환이 없고 2) 직계가족 중 자가면역질환의 가족력이 없는 건강한 사람
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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유전자 프로모터 내 CpG의 DNA 메틸화 상태
기간: 1 개월
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백혈구(WBC)에서 CD40L, FOXP3, CTLA4, PTPN22, IL2RA, FCRL3 및 HLADRB1 프로모터 유전자 내 CpG의 DNA 메틸화 백분율.
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1 개월
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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나이
기간: 1 일
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각 참가자의 나이
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1 일
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발병 연령
기간: 1 일
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질병 진단 연령
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1 일
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섹스
기간: 1 일
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남성 또는 여성
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1 일
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체질량 지수
기간: 1 일
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체중(kg) / 신장(m) * 신장(m)
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1 일
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사춘기
기간: 1 일
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사춘기 전 또는 사춘기
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1 일
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항체 역가
기간: 1 일
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혈액 내 antiTPO, antiTg, anti-TSI 항체 역가
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1 일
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갑상선 부피
기간: 1 일
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총 갑상선의 부피(두 엽)
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1 일
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치료 용량
기간: 1 일
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체중 kg당 레보티록신/티아마졸 용량/일(해당하는 경우)
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1 일
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B12
기간: 1 일
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혈중 B12 수치
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1 일
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엽산
기간: 1 일
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혈중 엽산 수치
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1 일
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IgA, IgG, IgM, IgE 면역글로불린
기간: 1 일
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혈중 IgA, IgG, IgM, IgE 면역글로불린 수치
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1 일
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감염의 역사
기간: 1 일
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연간 이전 열성 바이러스/박테리아 감염 수
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1 일
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약물의 역사
기간: 1 일
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연간 이전 약물 수
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1 일
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기타 자가면역질환
기간: 1 일
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공존하는 자가면역질환의 진단(자가면역성 갑상선질환 제외)
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1 일
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자가면역 갑상선(또는 기타) 질환의 가족력
기간: 1 일
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자가면역 갑상선(또는 기타) 질환의 가족력 여부
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1 일
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부모의 교육 수준
기간: 1 일
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초등학교, 고등학교 또는 대학교 졸업자
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1 일
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거주 유형
기간: 1 일
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도시 또는 시골 거주지
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1 일
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부모 흡연
기간: 1 일
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각 부모에 대한 자녀의 평생 동안 하루 총 담배 수(해당하는 경우)
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1 일
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이전 출생
기간: 1 일
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이전 출생 수
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1 일
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생년월일
기간: 1 일
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생년월일(1월~12월)
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1 일
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배송 유형
기간: 1 일
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제왕 절개 또는 질 분만
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1 일
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출생 체중
기간: 1 일
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출생 체중
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1 일
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임신 기간
기간: 1 일
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임신 기간
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1 일
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임신 중 약물
기간: 1 일
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임신 중에 받은 모든 종류의 약물 수(해당하는 경우)
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1 일
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임신 중 산모의 흡연
기간: 1 일
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임신 중 하루 총 담배 수(해당하는 경우)
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1 일
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임신 중 산모의 음주
기간: 1 일
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임신 중 하루 총 알코올 소비량(해당하는 경우)
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1 일
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전자간증(임신 중)
기간: 1 일
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전자간증(임신 중) 진단 여부
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1 일
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임신성 당뇨병(임신 중)
기간: 1 일
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임신성 당뇨병 진단(임신 중) 여부
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1 일
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질 출혈(임신 중)
기간: 1 일
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질 출혈 유무(임신 중) 여부
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1 일
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산모 열성 감염(임신 중)
기간: 1 일
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산모의 열성 감염 진단(임신 중) 여부
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1 일
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모유 수유 기간
기간: 1 일
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중단할 때까지 모유 수유 기간
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1 일
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광선 요법의 역사
기간: 1 일
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신생아 기간 동안 광선 요법의 역사 (또는 하지)
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1 일
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APGAR 점수
기간: 1 일
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생후 1분 및 5분의 APGAR 점수
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1 일
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Assimina Galli-Tsinopoulou, Professor, Medical School, Aristotle University of Thessaloniki
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Akirav EM, Lebastchi J, Galvan EM, Henegariu O, Akirav M, Ablamunits V, Lizardi PM, Herold KC. Detection of beta cell death in diabetes using differentially methylated circulating DNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Nov 22;108(47):19018-23. doi: 10.1073/pnas.1111008108. Epub 2011 Nov 9.
- Barrett JC, Clayton DG, Concannon P, Akolkar B, Cooper JD, Erlich HA, Julier C, Morahan G, Nerup J, Nierras C, Plagnol V, Pociot F, Schuilenburg H, Smyth DJ, Stevens H, Todd JA, Walker NM, Rich SS; Type 1 Diabetes Genetics Consortium. Genome-wide association study and meta-analysis find that over 40 loci affect risk of type 1 diabetes. Nat Genet. 2009 Jun;41(6):703-7. doi: 10.1038/ng.381. Epub 2009 May 10.
- Cooper JD, Simmonds MJ, Walker NM, Burren O, Brand OJ, Guo H, Wallace C, Stevens H, Coleman G; Wellcome Trust Case Control Consortium, Franklyn JA, Todd JA, Gough SC. Seven newly identified loci for autoimmune thyroid disease. Hum Mol Genet. 2012 Dec 1;21(23):5202-8. doi: 10.1093/hmg/dds357. Epub 2012 Aug 24.
- Dang MN, Buzzetti R, Pozzilli P. Epigenetics in autoimmune diseases with focus on type 1 diabetes. Diabetes Metab Res Rev. 2013 Jan;29(1):8-18. doi: 10.1002/dmrr.2375.
- Davies TF, Latif R, Yin X. New genetic insights from autoimmune thyroid disease. J Thyroid Res. 2012;2012:623852. doi: 10.1155/2012/623852. Epub 2012 Feb 28.
- Fradin D, Le Fur S, Mille C, Naoui N, Groves C, Zelenika D, McCarthy MI, Lathrop M, Bougneres P. Association of the CpG methylation pattern of the proximal insulin gene promoter with type 1 diabetes. PLoS One. 2012;7(5):e36278. doi: 10.1371/journal.pone.0036278. Epub 2012 May 2.
- Huber A, Menconi F, Corathers S, Jacobson EM, Tomer Y. Joint genetic susceptibility to type 1 diabetes and autoimmune thyroiditis: from epidemiology to mechanisms. Endocr Rev. 2008 Oct;29(6):697-725. doi: 10.1210/er.2008-0015. Epub 2008 Sep 5.
- Lu Q. The critical importance of epigenetics in autoimmunity. J Autoimmun. 2013 Mar;41:1-5. doi: 10.1016/j.jaut.2013.01.010. Epub 2013 Feb 1.
- MacFarlane AJ, Strom A, Scott FW. Epigenetics: deciphering how environmental factors may modify autoimmune type 1 diabetes. Mamm Genome. 2009 Sep-Oct;20(9-10):624-32. doi: 10.1007/s00335-009-9213-6. Epub 2009 Aug 22.
- Quintero-Ronderos P, Montoya-Ortiz G. Epigenetics and autoimmune diseases. Autoimmune Dis. 2012;2012:593720. doi: 10.1155/2012/593720. Epub 2012 Mar 22.
- Rakyan VK, Beyan H, Down TA, Hawa MI, Maslau S, Aden D, Daunay A, Busato F, Mein CA, Manfras B, Dias KR, Bell CG, Tost J, Boehm BO, Beck S, Leslie RD. Identification of type 1 diabetes-associated DNA methylation variable positions that precede disease diagnosis. PLoS Genet. 2011 Sep;7(9):e1002300. doi: 10.1371/journal.pgen.1002300. Epub 2011 Sep 29.
- Weetman AP. Determinants of autoimmune thyroid disease. Nat Immunol. 2001 Sep;2(9):769-70. doi: 10.1038/ni0901-769. No abstract available.
- Yin X, Latif R, Tomer Y, Davies TF. Thyroid epigenetics: X chromosome inactivation in patients with autoimmune thyroid disease. Ann N Y Acad Sci. 2007 Sep;1110:193-200. doi: 10.1196/annals.1423.021.
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