폐암 조기 발견을 위한 새로운 순환 후생유전학적 바이오마커 개발
연구 개요
상세 설명
폐암은 2018년 전 세계적으로 209만 건을 차지하는 암 사망의 주요 원인입니다. 폐암이 완치될 수 있는 초기 단계에서 차단하기 위한 민감하고 신뢰할 수 있는 분석법에 대한 세계적 수요가 엄청납니다. 과거 연구에서는 종양 세포에서 흘러나온 순환 무세포 종양 DNA(ctDNA)가 원래 종양 세포와 동일한 돌연변이 및 메틸화 패턴을 포함하고 있음을 보여주었습니다. 새로운 증거는 암 환자의 전신 면역 조절 장애의 존재와 종양 반응성 T 세포가 다른 방관자 세포와 비교하여 뚜렷한 분자 프로필을 가지고 있음을 나타냅니다. 따라서 ctDNA와 종양 반응성 T 세포의 분자적 이상은 악성 종양의 존재를 암시하는 초기 징후 중 하나일 수 있으며, 편의성과 비효율성 때문에 초기 폐암에서 혈액 기반 분석 개발의 유망한 표적이 될 수 있습니다. -불만족스러운 민감도/특이성에 의해 제한되는 침습성 종양 생검 또는 영상 기반 방법과 반대되는 침습성.
연구자들은 조기 폐암 발견을 위한 새로운 마커를 식별하고 높은 민감도와 특이도로 임상에 적용할 수 있는 새로운 기술을 개발하는 것을 목표로 합니다. 이 제안의 목적은 다면적입니다. (1) 연구자는 폐암 환자 대 비암 환자에서 순환 무세포 DNA 및 순환 T 세포의 게놈 전체 메틸화 아틀라스를 생성할 것입니다. (2) 조사관은 민감도를 높이고 입력 DNA 요구 사항을 줄인 다중 액적 디지털 PCR(ddPCR) 기술의 성능을 향상시키는 풍부한 방법을 개발할 것입니다. (Enriched methylation-specific droplet digital PCR, EMS-ddPCR) (3) 연구자들은 바이설파이트가 없고 PCR 기반이 아닌 단일 세포, 유전자좌 특이적 DNA 메틸화 검출 시스템을 개발할 것입니다. 이 시스템은 세포 유형별 메틸화 검출을 가능하게 하기 위해 유동 세포측정법 또는 질량 세포측정법과 결합될 수 있습니다. (single-cell, locus-specific methylation detection, scLSM-FACS) (4) 연구자들은 폐암의 조기 발견을 위해 종양 유래 및 면역 유래 바이오마커로 구성된 새로운 메틸화 시그니처를 식별할 것입니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Hsing-Chen Tsai, M.D., Ph.D
- 전화번호: 88797 +886-2-23123456
- 이메일: htsai@ntu.edu.tw
연구 장소
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Taipei, 대만, 100225
- 모병
- National Taiwan University Hospital
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연락하다:
- Hsing-Chen Tsai, M.D., Ph.D
- 전화번호: 88797 +886-2-23123456
- 이메일: htsai@ntu.edu.tw
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
- 연구 대상자: 폐암 진단이 의심되거나 확인된 환자.
- 불확실한 피험자: 컴퓨터 단층 촬영에서 발견된 불확실한 서브센티미터 폐 결절 또는 젖빛 유리 혼탁이 있는 피험자.
- 대조군 : 건강한 지원자를 포함한 비암 피험자, 만성 폐쇄성 기도 질환, 천식, 기관지확장증 등의 만성 염증성 기도 질환 등
설명
포함 기준:
- 폐암 진단이 의심되거나 확인된 피험자.
- 컴퓨터 단층 촬영으로 발견된 불명확한 서브센티미터 폐 결절 또는 젖빛 유리 혼탁이 있는 피험자.
- 비암 대상자: 건강한 지원자와 만성 폐쇄성 기도 질환, 천식 및 기관지 확장증 등의 만성 염증성 기도 질환을 포함합니다.
- 피험자는 20세 이상입니다.
제외 기준:
- 임신.
- HIV 감염 대상자.
- 정보에 입각한 동의를 할 수 없거나 제공할 의사가 없습니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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폐암 환자
20세 이상으로 폐암 진단이 의심되거나 확인된 환자.
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각 피험자로부터 최대 20ml의 혈액을 채취하고 혈액 검체를 처리하여 형질 세포가 없는 DNA와 면역 유래 세포(순환 T 세포)를 분리합니다.
그러면 순환하는 메틸화 종양/면역 시그니처가 확인됩니다.
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불확실한 주제
컴퓨터 단층 촬영으로 발견된 불명확한 서브센티미터 폐 결절 또는 젖빛 유리 혼탁이 있는 피험자.
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각 피험자로부터 최대 20ml의 혈액을 채취하고 혈액 검체를 처리하여 형질 세포가 없는 DNA와 면역 유래 세포(순환 T 세포)를 분리합니다.
그러면 순환하는 메틸화 종양/면역 시그니처가 확인됩니다.
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제어 대상
건강한 지원자를 포함한 비암 환자, 만성폐쇄성 기도질환, 천식, 기관지확장증 등의 만성 염증성 기도질환 등
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각 피험자로부터 최대 20ml의 혈액을 채취하고 혈액 검체를 처리하여 형질 세포가 없는 DNA와 면역 유래 세포(순환 T 세포)를 분리합니다.
그러면 순환하는 메틸화 종양/면역 시그니처가 확인됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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순환 종양 및 면역 메틸화 시그니처의 식별
기간: 일년
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Infinium MethylationEPIC BeadChip 플랫폼을 사용하여 말초 혈액에서 수집한 순환 T 세포와 무세포 DNA 모두에서 폐암 환자 및 대조군 대상의 게놈 전체 메틸화 프로필을 측정합니다.
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일년
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기술 개발
기간: 일년
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연구자들은 민감도가 증가하고 입력 DNA 요구량이 감소된 풍부한 메틸화 특이적 액적 디지털 PCR(EMS-ddPCR)을 개발할 것입니다.
연구자들은 세포 유형 특이적 메틸화 검출을 가능하게 하기 위해 유세포분석(scLSM-FACS)을 위한 단일 세포, 유전자좌 특이적 DNA 메틸화 검출 시스템을 개발할 것입니다.
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일년
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기술 검증
기간: 일년
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조사관은 불명확한 폐 결절이 있는 환자에서 식별된 순환 메틸화 시그니처를 검증할 것입니다.
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일년
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 연구 의자: Hsing-Chen Tsai, M.D., Ph.D, Graduate institute of Toxicology, NTUCM; Department of Internal Medicine, NTUH
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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