肺がんの早期検出のための新規循環エピジェネティックバイオマーカーの開発

肺がんはがんによる死亡の主な原因であり、2018年には世界中で209万人が死亡しました。 肺がんを治癒可能な初期段階で阻止するための、高感度で信頼性の高いアッセイに対する大きな需要が世界的にあります。 過去の研究では、腫瘍細胞から放出された循環無細胞腫瘍 DNA (ctDNA) には、元の腫瘍細胞と同じ突然変異とメチル化パターンが含まれることが示されています。 新たな証拠により、がん患者には全身性の免疫調節不全が存在し、腫瘍反応性 T 細胞は他のバイスタンダー細胞と比較して異なる分子プロファイルを持っていることが示されています。 したがって、ctDNA および腫瘍反応性 T 細胞の分子異常は、悪性腫瘍の存在を示唆する初期の兆候の 1 つである可能性があり、その利便性と安全性の観点から、初期肺がんにおける血液ベースのアッセイ開発の有望なターゲットとして機能する可能性があります。 - 侵襲性腫瘍生検や、不十分な感度/特異性によって制限される画像ベースの方法とは対照的な侵襲性。

研究者らは、肺がんの早期検出のための新規マーカーを同定することと、高い感度と特異性を備えて臨床に適用できる新技術を開発することを目指している。 この提案の目的は多面的です: (1) 研究者らは、肺がん患者と非がん患者の循環無細胞 DNA および循環 T 細胞のゲノム規模のメチル化アトラスを作成します。 (2) 研究者らは、感度を高め、入力 DNA 要件を減らして、マルチプレックス液滴デジタル PCR (ddPCR) 技術のパフォーマンスを強化するための強化された方法を開発します。 (濃縮メチル化特異的液滴デジタル PCR、EMS-ddPCR) (3) 研究者らは、重亜硫酸塩を含まず、非 PCR ベースの単一細胞、遺伝子座特異的 DNA メチル化検出システムを開発します。 このシステムをフローサイトメトリーまたはマスサイトメトリーと組み合わせて、細胞タイプ特異的なメチル化検出を可能にすることができます。 (単細胞、遺伝子座特異的メチル化検出、scLSM-FACS) (4) 研究者らは、肺がんの早期検出のために、腫瘍由来および免疫由来のバイオマーカーからなる新規メチル化シグネチャーを同定する予定です。