开发用于肺癌早期检测的新型循环表观遗传生物标志物
研究概览
详细说明
肺癌是癌症死亡的主要原因,2018 年全球有 209 万例肺癌。 全球对灵敏可靠的检测方法有着巨大的需求,以便在肺癌可以治愈的早期阶段拦截肺癌。 过去的研究表明,从肿瘤细胞脱落的循环游离肿瘤 DNA (ctDNA) 包含与原始肿瘤细胞相同的突变和甲基化模式。 新出现的证据表明癌症患者存在系统性免疫失调,并且与其他旁观细胞相比,肿瘤反应性 T 细胞具有独特的分子特征。 因此,ctDNA 和肿瘤反应性 T 细胞的分子异常可能是提示恶性肿瘤存在的早期迹象之一,并且由于其方便和非-侵入性与侵入性肿瘤活检相反,或受限于不令人满意的灵敏度/特异性的基于成像的方法。
研究人员的目标是确定早期肺癌检测的新标志物,并开发具有高灵敏度和特异性的临床适用新技术。 该提案的目标是多方面的:(1) 研究人员将生成肺癌患者与非癌症受试者中循环无细胞 DNA 和循环 T 细胞的全基因组甲基化图谱。 (2) 研究人员将开发一种丰富的方法来提高多重液滴数字 PCR (ddPCR) 技术的性能,同时提高灵敏度并降低输入 DNA 要求。 (富集甲基化特异性液滴数字 PCR,EMS-ddPCR) (3) 研究人员将开发一种不含亚硫酸氢盐且非基于 PCR 的单细胞、位点特异性 DNA 甲基化检测系统。 该系统可以与流式细胞术或质谱细胞术结合使用,以实现细胞类型特异性甲基化检测。 (单细胞、基因座特异性甲基化检测,scLSM-FACS)(4) 研究人员将确定一种新的甲基化特征,由肿瘤衍生和免疫衍生的生物标志物组成,用于肺癌的早期检测。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Hsing-Chen Tsai, M.D., Ph.D
- 电话号码:88797 +886-2-23123456
- 邮箱:htsai@ntu.edu.tw
学习地点
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Taipei、台湾、100225
- 招聘中
- National Taiwan University Hospital
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接触:
- Hsing-Chen Tsai, M.D., Ph.D
- 电话号码:88797 +886-2-23123456
- 邮箱:htsai@ntu.edu.tw
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
- 研究对象:疑似或确诊肺癌的患者。
- 不确定的受试者:通过计算机断层扫描发现具有不确定的亚厘米肺结节或毛玻璃混浊的受试者。
- 对照组:非癌症受试者,包括健康志愿者、慢性炎症性气道疾病如慢性阻塞性气道疾病、哮喘、支气管扩张等。
描述
纳入标准:
- 疑似或确诊肺癌的受试者。
- 通过计算机断层扫描发现不确定的亚厘米肺部结节或毛玻璃混浊的受试者。
- 非癌症受试者:包括健康志愿者和慢性炎症性气道疾病,如慢性阻塞性气道疾病、哮喘、支气管扩张等。
- 受试者年龄超过 20 岁。
排除标准:
- 怀孕。
- HIV感染者。
- 无法或不愿给予知情同意。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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肺癌患者
20岁以上疑似或确诊肺癌患者。
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从每位受试者身上采集最多 20 毫升的血液,并处理血液标本以分离无浆细胞的 DNA 和免疫衍生细胞(循环 T 细胞)。
然后将鉴定循环甲基化肿瘤/免疫特征。
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不确定的主题
通过计算机断层扫描发现不确定的亚厘米肺部结节或毛玻璃混浊的受试者。
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从每位受试者身上采集最多 20 毫升的血液,并处理血液标本以分离无浆细胞的 DNA 和免疫衍生细胞(循环 T 细胞)。
然后将鉴定循环甲基化肿瘤/免疫特征。
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控制对象
非癌症患者包括健康志愿者、慢性炎症性气道疾病如慢性阻塞性气道疾病、哮喘、支气管扩张等。
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从每位受试者身上采集最多 20 毫升的血液,并处理血液标本以分离无浆细胞的 DNA 和免疫衍生细胞(循环 T 细胞)。
然后将鉴定循环甲基化肿瘤/免疫特征。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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循环肿瘤和免疫甲基化特征的鉴定
大体时间:1年
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将使用 Infinium MethylationEPIC BeadChip 平台在循环 T 细胞和从外周血收集的无细胞 DNA 中测量肺癌患者和对照受试者的全基因组甲基化谱。
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1年
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技术开发
大体时间:1年
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研究人员将开发具有更高灵敏度和更低输入 DNA 需求的富集甲基化特异性液滴数字 PCR (EMS-ddPCR)。
研究人员将开发用于流式细胞术 (scLSM-FACS) 的单细胞、基因座特异性 DNA 甲基化检测系统,以实现细胞类型特异性甲基化检测。
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1年
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技术验证
大体时间:1年
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研究人员将在不确定的肺结节患者中验证已识别的循环甲基化特征。
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1年
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合作者和调查者
调查人员
- 学习椅:Hsing-Chen Tsai, M.D., Ph.D、Graduate institute of Toxicology, NTUCM; Department of Internal Medicine, NTUH
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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