Desarrollo de nuevos biomarcadores epigenéticos circulantes para la detección temprana del cáncer de pulmón

El cáncer de pulmón es la principal causa de muerte por cáncer, con 2,09 millones de casos en 2018 en todo el mundo. Existe una gran demanda a nivel mundial de ensayos sensibles y confiables para detectar el cáncer de pulmón en etapas tempranas cuando se puede curar. Estudios anteriores han demostrado que el ADN tumoral libre de células (ctDNA) circulante que se desprende de las células tumorales contiene las mismas mutaciones y patrones de metilación que las células tumorales originales. La evidencia emergente ha indicado la presencia de desregulación inmune sistémica en pacientes con cáncer, y que las células T reactivas al tumor tienen un perfil molecular distinto en comparación con otras células testigo. Por lo tanto, la anormalidad molecular de ctDNA y células T reactivas a tumores puede ser uno de los primeros signos que insinúan la presencia de malignidad, y puede servir como un objetivo prometedor para el desarrollo de ensayos basados ​​en sangre en cáncer de pulmón temprano por su conveniencia y no -invasividad en oposición a la biopsia tumoral invasiva, o métodos basados ​​en imágenes que están limitados por una sensibilidad/especificidad insatisfactoria.

El objetivo de los investigadores es identificar marcadores novedosos para la detección temprana del cáncer de pulmón, así como desarrollar nuevas tecnologías que sean clínicamente aplicables con alta sensibilidad y especificidad. Los objetivos de esta propuesta son multifacéticos: (1) Los investigadores generarán un atlas de metilación de todo el genoma del ADN libre de células circulantes y de las células T circulantes en pacientes con cáncer de pulmón frente a sujetos sin cáncer. (2) Los investigadores desarrollarán un método enriquecido para mejorar el rendimiento de la tecnología de PCR digital de gotitas múltiplex (ddPCR) con una mayor sensibilidad y un menor requisito de entrada de ADN. (PCR digital de gotas específicas de metilación enriquecida, EMS-ddPCR) (3) Los investigadores desarrollarán un sistema de detección de metilación de ADN de una sola célula, específico de locus, libre de bisulfito y no basado en PCR. El sistema puede combinarse con citometría de flujo o citometría de masas para permitir la detección de metilación específica del tipo de célula. (detección de metilación unicelular, locus-específica, scLSM-FACS) (4) Los investigadores identificarán una nueva firma de metilación que consiste en biomarcadores derivados de tumores e inmunes para la detección temprana del cáncer de pulmón.