Разработка новых циркулирующих эпигенетических биомаркеров для раннего выявления рака легких

Рак легких является ведущей причиной смерти от рака: в 2018 году во всем мире было зарегистрировано 2,09 миллиона случаев. Во всем мире существует огромный спрос на чувствительные и надежные тесты для выявления рака легких на ранних стадиях, когда его можно вылечить. Прошлые исследования показали, что циркулирующая бесклеточная опухолевая ДНК (цДНК), выделяемая из опухолевых клеток, содержит те же мутации и паттерны метилирования, что и исходные опухолевые клетки. Появляющиеся данные указывают на наличие системной иммунной дисрегуляции у онкологических больных и на то, что опухолереактивные Т-клетки имеют особый молекулярный профиль по сравнению с другими клетками-свидетелями. Таким образом, молекулярная аномалия цтДНК и опухоле-реактивных Т-клеток может быть одним из ранних признаков, указывающих на наличие злокачественного новообразования, и может служить многообещающей мишенью для разработки анализов на основе крови при раннем раке легкого из-за его удобства и недоступности. - инвазивность в отличие от инвазивной биопсии опухоли или методов визуализации, ограниченных неудовлетворительной чувствительностью/специфичностью.

Исследователи стремятся идентифицировать новые маркеры для раннего выявления рака легких, а также разработать новые технологии, которые клинически применимы с высокой чувствительностью и специфичностью. Цели этого предложения многогранны: (1) Исследователи создадут полногеномный атлас метилирования циркулирующей внеклеточной ДНК и циркулирующих Т-клеток у пациентов с раком легких по сравнению с субъектами без рака. (2) Исследователи разработают обогащенный метод для повышения производительности технологии мультиплексной капельной цифровой ПЦР (ddPCR) с повышенной чувствительностью и меньшими требованиями к входной ДНК. (Обогащенная цифровая ПЦР, специфичная к метилированию, EMS-ddPCR) (3) Исследователи разработают одноклеточную, локус-специфическую систему обнаружения метилирования ДНК, не содержащую бисульфитов и не основанную на ПЦР. Систему можно сочетать с проточной цитометрией или масс-цитометрией, чтобы обеспечить обнаружение специфического метилирования клеток. (одноклеточное, локус-специфическое обнаружение метилирования, scLSM-FACS) (4) Исследователи идентифицируют новую сигнатуру метилирования, состоящую из биомаркеров опухолевого и иммунного происхождения, для раннего выявления рака легких.