Биорепозиторий ишемической болезни сердца в Катаре (QCBio)

ВСТУПЛЕНИЕ:

Прогноз событий ишемической болезни сердца (ИБС) основан на общепринятых факторах риска атеросклероза, таких как возраст, пол, артериальное давление, диабет, уровень липидов и курение. Поскольку эти факторы риска распространены среди большей части населения, доступные алгоритмы прогнозирования риска не обладают желаемой чувствительностью и специфичностью. Например, Cooper et al. показали, что алгоритмы правильно предсказали лишь около 11% событий ИБС, происходящих в течение 10 лет. Таким образом, существует острая необходимость в разработке и проверке новых биомаркеров для раннего выявления заболеваний и более точной стратификации риска. По оценкам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), к 2020 году сердечно-сосудистые заболевания станут ведущей причиной заболеваемости и смертности. Развивающиеся страны, включая государства Персидского залива, будут главными виновниками этого роста смертности и инвалидности. В недавнем отчете McKinsey & Company прогнозируется, что регион Персидского залива столкнется с беспрецедентным и беспрецедентным ростом спроса на медицинские услуги в течение следующих двух десятилетий, при этом предполагаемые общие расходы на здравоохранение составят 60 миллиардов долларов США в 2025 году по сравнению с 12 миллиардов долларов США сегодня.

Знание новых генетических и протеомных маркеров обеспечит более точную оценку риска при определении путей, важных для отдельных пациентов, выявлении новых целей для вмешательства и, в конечном итоге, обеспечит индивидуальный подход к лечению. Биохранилище образцов дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК), сыворотки и плазмы позволит исследовать патогенез ИБС у взрослых катарцев и предоставит бесценный ресурс для профилактических сердечно-сосудистых исследований и разработки биомаркеров для раннего выявления ИБС.

ЗНАЧЕНИЕ В последнее время достигнут значительный прогресс в идентификации вариантов генетической предрасположенности, а также циркулирующих протеомных маркеров атеросклеротического заболевания сосудов. Однако возможность обобщения этих результатов для пациентов, принадлежащих к разным этническим группам, неясна. Чтобы воплотить недавние достижения в области геномики и протеомики в клиническую практику, эти недавно открытые биомаркеры необходимо будет оценить у пациентов из разных этнических групп с различными характеристиками, факторами окружающей среды и использованием лекарств. Исследователи предлагают создать биорепозиторий плазмы и ДНК, связанный с демографическими и клиническими переменными, чтобы облегчить исследования биомаркеров риска, прогрессирования и исхода ИБС. Главной целью разработки Катарского биорепозитория сердечно-сосудистых заболеваний (QCBio) является создание ресурса, который будет способствовать исследованиям, направленным на выявление новых биохимических и генетических маркеров ИБС.

ДИЗАЙН И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ:

Исследователи используют следующие ресурсы, доступные для этого предложения:

1. Инфраструктура и схемы направления пациентов в лабораторию катетеризации сердца в больнице Хамад, Доха, Катар, где несколько тысяч пациентов ежегодно проходят коронарографию и чрескожное коронарное вмешательство;
2. Электронная медицинская карта (EMR) в больнице Хамад, которая включает факторы риска, лекарственную терапию, соответствующие лабораторные данные и жизненный статус; и
3. Многопрофильная исследовательская группа со значительным опытом и знаниями в области науки о биорепозиториях, включая этические, юридические и социальные последствия (ELSI), системы управления лабораторной информацией, информатику и анализ EMR для аннотирования биообразцов соответствующими клиническими ковариатами.

КОНКРЕТНЫЕ ЦЕЛИ И ЗАДАЧИ:

1. Создать биорепозиторий ДНК и плазмы (QCBio) катарских случаев ИБС и контрольных групп соответствующего этнического происхождения, чтобы можно было исследовать геномные и протеомные биомаркеры для раннего выявления и прогнозирования, а также выявления новых целей для разработки лекарств.
2. Аннотировать биорепозиторий а) демографическими, лабораторными и клиническими переменными, полученными из EMR с использованием алгоритмов электронного фенотипирования, и б) подробной информацией об истории сердечно-сосудистых заболеваний и факторах риска, полученной из опросов субъектов исследования.
3. Разработать процессы для поощрения использования биорепозитория катарскими исследователями путем облегчения доступа к биорепозиторию для исследований биомаркеров при соблюдении самых высоких этических стандартов с упором на конфиденциальность пациентов и управление биообразцами.
4. Отслеживание набора: Программа нумерации пациентов (PNP) используется для деидентификации субъектов, включенных в исследование, и отслеживания набора пациентов. Программа содержит демографическую информацию и присвоенный личный идентификационный номер (ПИН) для каждого участника.

Согласие: Потенциальные субъекты определяются координаторами исследования после изучения графиков работы лаборатории катетеризации (Cath lab) и банка крови. Координатор исследования объясняет форму согласия и анкету исследования каждому участнику. Там, где это возможно, исследователи пытаются собрать образцы крови натощак до получения какого-либо лечения и избежать дополнительной венепункции. Тем, кто соответствует требованиям, координатор исследования предоставит подробную информацию о целях исследования, рисках и потенциальных выгодах от участия, хранении, будущем использовании и конфиденциальности образцов. Кроме того, координатор исследования информирует участников об отсутствии непосредственной пользы для здоровья и их праве на выход из исследования в любое время после согласия.

Сбор и обработка образцов крови: Двадцать пять миллилитров крови берется во время процедуры в лаборатории рентгенографии, при поступлении в отделение коронарной терапии (ОРИТ) или во время сдачи крови. Образцы берутся из специальной исследовательской зоны рядом с лабораторией рентгенографии/реанимации и банком крови соответственно. Кровь набирается в соответствующие пробирки для сбора, маркируется сгенерированным в больнице идентификационным номером со штрих-кодом и отправляется в лабораторию молекулярной генетики.

Мониторинг морозильной камеры: температура всех морозильных камер круглосуточно контролируется с помощью средств управления проектом и службы безопасности Hamad Medical Corporation (HMC).

Гарантия качества: Точное обращение с пробами достигается за счет соблюдения стандартных операционных процедур (СОП) в соответствии с общими лабораторными стандартами обеспечения качества и контроля.

Отслеживание образцов: Отслеживание образцов будет осуществляться с помощью программы системы управления лабораторной информацией (LIMS), которая в настоящее время используется исследовательской группой ведущего PI.

Конфиденциальность пациентов. Исследователи будут использовать информатику и функции защиты данных для сохранения конфиденциальности пациентов. Программа нумерации пациентов (PNP) будет использоваться для деидентификации пациентов, зарегистрированных в QCBio, и для отслеживания пациентов после набора.

Этические, юридические и нормативные вопросы в отношении биохранилищ ДНК: Форма согласия включает отдельные поля для галочек для получения разрешения на сбор плазмы и использование ДНК в исследованиях различных заболеваний, а также на передачу образцов сотрудничающим исследователям. Банковское хранение биообразцов вызывает новые опасения относительно конфиденциальности и согласия пациента.

Информатика. Информатика и безопасность данных являются важнейшими компонентами биорепозитория и ключом к использованию возможностей биорепозиториев. QCBio будет связан с несколькими базами данных.

Анкета исследования: Исследователи используют анкету для сбора информации, касающейся социально-демографической информации, истории сердечно-сосудистых заболеваний, физической активности, образа жизни, прошлой медицинской информации и семейного анамнеза. Данные будут извлечены из вопросника путем сканирования или ввода вручную.

Аннотирование образцов с клиническими данными: Исследователи используют программу просмотра EMR в больнице Хамад в дополнение к лабораторным базам данных для аннотирования биорепозитория соответствующими клиническими переменными.

Установление факторов риска. Исследователи устанавливают традиционные факторы риска сердечно-сосудистых заболеваний, включая гипертонию, диабет и дислипидемию. Данные ЭМИ и опросов будут использованы для установления наличия следующих факторов риска развития атеросклероза: курение, сахарный диабет, артериальная гипертензия, дислипидемия и ожирение. Исследователи используют целенаправленный ручной просмотр бумажных записей и EMR в тандеме с доступом к электронным наборам данных для лабораторных значений, лекарств и кодов диагнозов.

Управление биообразцами и доступ к биорепозиторию: Исследователи разработают протоколы, позволяющие исследователям использовать наборы данных, связанные с образцами, обеспечивать соблюдение нормативных требований, поощрять сотрудничество между исследователями Катара, Персидского залива и Мейо и повышать эффективность исследований. Исследователи предоставят гибкую, надежную, безопасную и проверенную программу управления информацией для управления биологическими образцами. Образцы, хранящиеся в банках, будут доступны исследователям, чьи протоколы были одобрены IRB и признаны приоритетными Научной экспертной группой.

Отслеживание использования образцов: чтобы максимизировать использование биообразцов, исследователь будет использовать LIMS для отслеживания всех полученных образцов путем присвоения уникальной идентификации всем входным (пробирки с образцами) и выходным (ДНК/плазма/лейкоциты) пробиркам и регистрации движения образца. , обработка, создание и потребление. Назначенный компьютерный аналитик будет поддерживать и управлять системой.

Доступ к информации: Только члены исследовательской группы будут иметь доступ к исследовательским данным. Участники будут идентифицированы кодовыми номерами только в базе данных и в стенограммах; все данные отслеживаются в базах данных по анонимным, но связанным номерам исследований. Никакая идентифицирующая информация не будет разглашаться за пределами исследования.

Стратегия продолжения проекта. Долгосрочная цель исследовательской группы состоит в том, чтобы создать ресурс, позволяющий обнаруживать варианты генетической предрасположенности и новые циркулирующие маркеры ИБС, тем самым позволяя проводить индивидуальную оценку риска ИБС, основной причины смерти и заболеваемости в Катар. Создание биорепозитория является первым необходимым шагом для понимания геномной и протеомной ИБС у катарцев.