カタールの冠動脈疾患のバイオレポジトリ (QCBio)

前書き：

冠状動脈性心疾患 (CHD) イベントの予測は、年齢、性別、血圧、糖尿病、脂質レベル、喫煙状況など、従来のアテローム性動脈硬化の危険因子に基づいています。 これらの危険因子は人口の多くに蔓延しているため、利用可能なリスク予測アルゴリズムには、望ましい感度と特異性が欠けています。 たとえば、Cooper らは、アルゴリズムが 10 年以内に発生する CHD イベントの約 11% を正しく予測したことを示しました。 したがって、疾患の早期発見とより正確なリスク層別化のために、新しいバイオマーカーを開発して検証することが急務です。 世界保健機関 (WHO) の推定によると、心血管疾患は 2020 年までに罹患率と死亡率の主要な原因になるでしょう。 湾岸諸国を含む開発途上国は、この増加する死亡と障害の主な原因となるでしょう。 マッキンゼー・アンド・カンパニーの最近のレポートでは、湾岸地域は今後 20 年間で比類のない前例のない医療需要の増加に直面し、2025 年の医療費総額は 600 億米ドルに上ると予測されています。現在120億ドル。

新しい遺伝子およびプロテオミクス マーカーの知識は、リスクのより正確な推定値を提供すると同時に、個々の患者にとって重要な経路を定義し、介入の新しいターゲットを明らかにし、最終的には個別化されたケアへのアプローチを可能にします。 デオキシリボ核酸（DNA）、血清、および血漿サンプルのバイオレポジトリは、カタールの成人におけるCHDの病因の調査を可能にし、CHDの早期発見のためのバイオマーカーの予防的心血管研究および開発のための非常に貴重なリソースを提供します.

重要性 アテローム性動脈硬化性血管疾患の循環プロテオミクス マーカーと同様に、遺伝的感受性バリアントの特定において、最近大きな進歩が見られました。 ただし、多様な民族グループに属する患者へのこれらの結果の一般化可能性は不明です。 ゲノミクスとプロテオミクスの最近の進歩を臨床診療に反映させるには、これらの新たに発見されたバイオマーカーを、さまざまな特徴、環境要因、および薬物使用を持つ多様な民族グループの患者で評価する必要があります。 研究者らは、CHD のリスク、進行、および転帰のバイオマーカー研究を促進するために、人口統計学的変数および臨床変数に関連する血漿および DNA のバイオレポジトリを確立することを提案しています。 Qatar Cardiovascular Biorepository (QCBio) の開発における包括的な目標は、CHD の新しい生化学的および遺伝的マーカーを特定することを目的とした研究を促進するリソースを作成することです。

研究計画と方法:

調査員は、この提案に利用できる次のリソースを活用しています。

1. カタールのドーハにあるハマド病院の心臓カテーテル検査室のインフラストラクチャと患者紹介パターン。毎年数千人の患者が冠動脈造影と経皮的冠動脈インターベンションを受けています。
2. 危険因子、薬物療法、関連する検査データ、生命状態を含むハマド病院の電子医療記録 (EMR)。と
3. 倫理的、法的、社会的影響 (ELSI)、検査室情報管理システム、インフォマティクス、EMR のマイニングを含むバイオレポジトリ科学における豊富な経験と専門知識を備えた学際的な調査チームは、関連する臨床共変量で生物標本に注釈を付けます。

具体的な目的と目的:

1. カタールの CHD 症例および民族性が一致した対照の DNA および血漿バイオレポジトリ (QCBio) を確立して、早期発見および予後予測のためのゲノムおよびプロテオミクスバイオマーカーの調査、ならびに医薬品開発の新しい標的の特定を可能にします。
2. 電子表現型解析アルゴリズムを使用して EMR から派生した a) 人口統計学、実験室、および臨床変数、および b) 研究対象者の調査から派生した心血管疾患および危険因子の歴史に関する詳細な情報で、バイオリポジトリに注釈を付けます。
3. バイオマーカー研究のためのバイオレポジトリへのアクセスを促進することにより、カタールの研究者によるバイオレポジトリの使用を促進するプロセスを開発する一方で、患者の機密保持と生体試料の管理に重点を置いて最高の倫理基準を維持します。
4. 募集の追跡: 患者番号付けプログラム (PNP) を使用して、研究に登録された被験者の身元を特定せず、患者の募集を追跡します。 このプログラムには、人口統計情報と各参加者に割り当てられた個人識別番号 (PIN) が含まれています。

同意: 潜在的な被験者は、カテーテル検査室 (Cath lab) および血液バンクのスケジュールを確認した後、研究コーディネーターによって特定されています。 研究コーディネーターは、各参加者に同意書と研究アンケートを説明しています。 可能な限り、調査員は、治療を受ける前に絶食状態で血液検体を採取し、追加の静脈穿刺の負担を回避しようとしています。 資格のあるものについては、研究コーディネーターが、研究の目的、参加によるリスクと潜在的な利益、サンプルの保管、将来の使用、およびプライバシーに関する詳細を提供します。 さらに、研究コーディネーターは、参加者に健康への即時の利益がないこと、および同意後いつでも研究を中止する権利があることを通知しています.

血液サンプルの収集と処理: 25 ミリリットルの血液が、カテーテル検査室での処置時、冠状動脈治療室 (CCU) への入院時、または献血時に採取されます。 サンプルは、それぞれカテーテル検査室/CCU および血液バンクに近い特別研究エリアから収集されます。 血液は適切な採取管に引き込まれ、病院で生成されたバーコード識別番号でラベル付けされ、分子遺伝学研究所に送られます。

冷凍庫の監視: すべての冷凍庫の温度は、プロジェクト管理施設とハマド メディカル コーポレーション (HMC) のセキュリティの組み合わせによって 24 時間体制で監視されています。

品質保証: 正確なサンプル処理は、一般的なラボの品質保証および管理基準に従って、標準操作手順 (SOP) を順守することによって実現されています。

標本追跡: サンプル追跡は、主任研究員の研究グループによって現在使用されている研究所情報管理システム (LIMS) プログラムによって達成されます。

患者の機密保持: 治験責任医師は、インフォマティクスおよびデータ セキュリティ機能を使用して、患者の機密保持を維持します。 患者番号付けプログラム (PNP) は、QCBio に登録された患者の匿名化と、募集後の患者の追跡に使用されます。

DNA バイオレポジトリにおける倫理的、法的、および規制上の問題: 同意書には、さまざまな疾患の研究における血漿および DNA の収集と、協力研究者への標本の送付の許可を求めるための個別のチェックボックスが含まれています。 生体試料の保管は、患者のプライバシーと同意に関する新たな懸念を引き起こします。

インフォマティクス: インフォマティクスとデータ セキュリティは、バイオレポジトリにとって重要な要素であり、バイオレポジトリの力を活用するための鍵です。 QCBio は複数のデータベースにリンクされます。

研究アンケート: 研究者はアンケートを使用して、社会人口学的情報、心血管系の病歴、身体活動、ライフスタイル、過去の医療情報、および家族歴に関する情報を収集しています。 データは、スキャンまたは手入力によってアンケートから抽出されます。

臨床データによる検体の注釈: 研究者は、ラボ データベースに加えて Hamad 病院の EMR ビューアーを使用して、関連する臨床変数でバイオレポジトリに注釈を付けています。

危険因子の確認: 研究者は、高血圧、糖尿病、脂質異常症などの従来の心血管危険因子を確認しています。 EMR と調査データは、アテローム性動脈硬化の次の危険因子の存在を確認するために使用されます: 喫煙、糖尿病、高血圧、脂質異常症、および肥満。 研究者は、検査値、投薬、診断コードの電子データセットへのアクセスと並行して、紙の記録と EMR の的を絞った手動レビューを使用しています。

生物標本の管理とバイオレポジトリへのアクセス: 研究者は、研究者が標本に関連するデータセットを活用し、規制ガイドラインへの準拠を確保し、カタール、ガルフ、メイヨーの研究者間の協力を促進し、研究の生産性を向上できるようにするためのプロトコルを開発します。 研究者は、生体試料を管理するための柔軟で堅牢、安全、かつ検証済みの情報管理ワークスペース プログラムを提供します。 IRB によって承認され、Scientific Review Panel によって優先順位が付けられたプロトコルを持つ研究者は、保存された標本を利用できます。

標本の使用の追跡: 生体標本を最大限に活用するために、研究者は LIMS を使用して、すべての入力 (サンプル チューブ) および出力 (DNA/血漿/白血球) チューブに一意の識別を割り当てることによって受け取ったすべての標本を追跡し、サンプルの動きを記録します。 、処理、作成、および消費。 指名されたコンピューター アナリストがシステムを保守および管理します。

情報へのアクセス: 研究チームのメンバーのみが研究データにアクセスできます。 参加者は、データベースとトランスクリプトでのみコード番号で識別されます。すべてのデータは、匿名だがリンク可能な研究番号によってデータベースで追跡されます。 個人を特定できる情報が研究以外に公開されることはありません。

プロジェクト継続の戦略: 調査チームの長期的な目標は、CHD の遺伝的感受性バリアントと新規の循環マーカーの発見を可能にするリソースを作成し、それによって CHD のリスクの個別評価を可能にすることです。カタール。 バイオレポジトリーの作成は、カタール人における CHD のゲノムおよびプロテオミクスを理解するために必要な最初のステップです。