Cirkulerande cellfritt DNA för diagnos av hjärnabscess: En pilotstudie (METABCES-PoC)

Hjärnabscess är en sällsynt men allvarlig intrakraniell infektion, med en uppskattad incidens på cirka 0,8 fall per 100 000 individer och en rapporterad dödlighet mellan 10 % och 20 %. Den nuvarande behandlingen bygger på en kombination av neurokirurgisk intervention och långvarig intravenös antimikrobiell terapi. När det är möjligt utförs kirurgisk dränage eller stereotaktisk aspiration för att minska det intrakraniella trycket, minska infektionsbelastningen och erhålla biologiska prover för mikrobiologisk identifiering av den orsakande patogenen, vilket möjliggör riktad antimikrobiell behandling.

Emellertid är neurokirurgisk intervention inte alltid genomförbar. Tekniska faktorer som liten abscessstorlek eller djup anatomisk placering kan förhindra tillgång till läsionen, och vissa patienter kan ha kontraindikationer för neurokirurgiska ingrepp. I dessa situationer blir mikrobiologisk dokumentation särskilt utmanande. Konventionella diagnostiska metoder, inklusive blododlingar och cerebrospinalvätskeanalys, har begränsad känslighet vid hjärnabscess och misslyckas ofta med att identifiera den orsakande patogenen.

Senare framsteg inom molekylär diagnostik har lett till utvecklingen av metagenomiska sekvenseringsmetoder för patogendetektering. Metagenomisk analys möjliggör opartisk identifiering av mikrobiellt DNA direkt från kliniska prover och kan ge bredare patogendetektering än traditionella odlingsbaserade tekniker. Vid neurokirurgiska infektioner har metagenomisk sekvensering utförd på operativa prover visat lovande resultat och kan förbättra den mikrobiologiska dokumentationen jämfört med standarddiagnostiska metoder.

Parallellt representerar sekvensering av cirkulerande mikrobiellt cellfritt DNA (cfDNA) i perifert blod med hjälp av nästa generations sekvensering ett innovativt och minimalt invasivt diagnostiskt tillvägagångssätt. Denna teknik detekterar korta fragment av mikrobiellt DNA som frigörs i blodomloppet under aktiv infektion och kan ge kliniskt relevant diagnostisk information.

Denna studie syftar till att utvärdera den diagnostiska prestandan av metagenomisk sekvensering av cirkulerande mikrobiellt cfDNA hos patienter med hjärnabscess och att jämföra dess prestanda med metagenomisk sekvensering och konventionella mikrobiologiska odlingar utförda på intraoperativa prover när sådana finns tillgängliga.

Denna pilotstudie är utformad för att ge proof-of-concept-data om den diagnostiska prestandan av sekvensering av cirkulerande mikrobiellt cfDNA vid hjärnabscess. Resultaten kan hjälpa till att definiera denna diagnostiska metodiks roll i att förbättra mikrobiologisk dokumentation och vägleda riktad antimikrobiell terapi, särskilt när neurokirurgisk provtagning inte är genomförbar.