Циркулирующая бесклеточная ДНК для диагностики абсцесса головного мозга: пилотное исследование (METABCES-PoC)

Абсцесс головного мозга — это редкая, но тяжелая внутричерепная инфекция с расчетной частотой около 0,8 случаев на 100 000 человек и зарегистрированным уровнем смертности от 10% до 20%. Текущее лечение основывается на сочетании нейрохирургического вмешательства и длительной внутривенной антимикробной терапии. При возможности проводится хирургическое дренирование или стереотаксическая аспирация для снижения внутричерепного давления, уменьшения инфекционной нагрузки и получения биологических образцов для микробиологической идентификации возбудителя, что позволяет проводить целенаправленную антимикробную терапию.

Однако нейрохирургическое вмешательство не всегда возможно. Технические факторы, такие как небольшой размер абсцесса или глубокая анатомическая локализация, могут препятствовать доступу к очагу, а у некоторых пациентов могут быть противопоказания к нейрохирургическим процедурам. В таких ситуациях микробиологическая документация становится особенно сложной. Традиционные диагностические методы, включая посевы крови и анализ спинномозговой жидкости, имеют ограниченную чувствительность при абсцессе головного мозга и часто не позволяют идентифицировать возбудителя.

Недавние достижения в молекулярной диагностике привели к разработке метагеномных подходов секвенирования для выявления патогенов. Метагеномный анализ позволяет проводить беспристрастную идентификацию микробной ДНК непосредственно из клинических образцов и может обеспечить более широкое выявление патогенов по сравнению с традиционными культуральными методами. При нейрохирургических инфекциях метагеномное секвенирование, проведенное на операционных образцах, показало многообещающие результаты и может улучшить микробиологическую документацию по сравнению со стандартными диагностическими методами.

Параллельно секвенирование циркулирующей микробной внеклеточной ДНК (вкДНК) в периферической крови с использованием секвенирования нового поколения представляет собой инновационный и малоинвазивный диагностический подход. Эта технология обнаруживает короткие фрагменты микробной ДНК, высвобождаемые в кровоток во время активной инфекции, и может предоставлять клинически значимую диагностическую информацию.

Данное исследование направлено на оценку диагностической эффективности метагеномного секвенирования циркулирующей микробной вкДНК у пациентов с абсцессом головного мозга и сравнение его эффективности с метагеномным секвенированием и традиционными микробиологическими посевами, проведенными на интраоперационных образцах, когда это возможно.

Это пилотное исследование разработано для получения данных, подтверждающих концепцию диагностической эффективности секвенирования циркулирующей микробной вкДНК при абсцессе головного мозга. Результаты могут помочь определить роль этого диагностического подхода в улучшении микробиологической документации и направлении целенаправленной антимикробной терапии, особенно когда нейрохирургический забор образцов невозможен.