Keringő sejtmentes DNS agytályog diagnosztikájához: egy előtanulmány (METABCES-PoC)

Az agyi tályog egy ritka, de súlyos intracraniális fertőzés, amelynek becsült előfordulása körülbelül 0,8 eset 100 000 főre vetítve, és a jelentett halálozási arány 10% és 20% között mozog. A jelenlegi kezelés a neurosebészeti beavatkozás és a hosszú ideig tartó intravénás antimikrobiális terápia kombinációján alapul. Amikor lehetséges, sebészi drenázst vagy sztereotaxiás aspirációt végeznek az intracraniális nyomás csökkentése, a fertőzési terhelés csökkentése és a biológiai minták megszerzése érdekében a kórokozó patogén mikrobiológiai azonosításához, lehetővé téve a célzott antimikrobiális kezelést.

Azonban a neurosebészeti beavatkozás nem mindig lehetséges. Technikai tényezők, például a kis tályogméret vagy a mély anatómiai elhelyezkedés megakadályozhatják a lézió elérését, és egyes betegeknél ellenjavallatok lehetnek a neurosebészeti eljárásokkal szemben. Ilyen helyzetekben a mikrobiológiai dokumentáció különösen kihívást jelent. A hagyományos diagnosztikai módszerek, beleértve a vérkultúrákat és a cerebrospinális folyadék elemzését, korlátozott érzékenységgel rendelkeznek az agyi tályog esetében, és gyakran nem sikerül azonosítani a kórokozó patogént.

A molekuláris diagnosztika legújabb fejleményei a patogén kimutatására szolgáló metagenomikai szekvenálási megközelítések kifejlesztéséhez vezettek. A metagenomikai elemzés lehetővé teszi a mikrobák DNS-ének elfogulatlan azonosítását közvetlenül klinikai mintákból, és szélesebb körű patogén kimutatást nyújthat, mint a hagyományos kultúra-alapú technikák. A neurosebészeti fertőzésekben a műtéti mintákon végzett metagenomikai szekvenálás ígéretes eredményeket mutatott, és javíthatja a mikrobiológiai dokumentációt a szokásos diagnosztikai módszerekhez képest.

Párhuzamosan a perifériás vérben keringő mikrobális sejtnélküli DNS (cfDNS) szekvenálása újgenerációs szekvenálással egy innovatív és minimálisan invazív diagnosztikai megközelítést képvisel. Ez a technológia rövid mikrobális DNS-fragmenseket észlel, amelyek az aktív fertőzés során a véráramba kerülnek, és klinikailag releváns diagnosztikai információkat nyújthat.

Ez a tanulmány célja, hogy értékelje a keringő mikrobális cfDNS metagenomikai szekvenálás diagnosztikai teljesítményét agyi tályogos betegekben, és összehasonlítsa annak teljesítményét a metagenomikai szekvenálással és a hagyományos mikrobiológiai kultúrákkal, amelyeket műtéti mintákon végeznek, amikor azok rendelkezésre állnak.

Ez a pilot tanulmány koncepcióigazoló adatokat kíván szolgáltatni a keringő mikrobális cfDNS szekvenálás diagnosztikai teljesítményéről agyi tályog esetében. Az eredmények segíthetnek meghatározni ennek a diagnosztikai megközelítésnek a szerepét a mikrobiológiai dokumentáció javításában és a célzott antimikrobiális terápia irányításában, különösen akkor, amikor a neurosebészeti mintavétel nem lehetséges.