ADN libre circulant pour le diagnostic des abcès cérébraux : Une étude pilote (METABCES-PoC)

L'abcès cérébral est une infection intracrânienne rare mais sévère, avec une incidence estimée d'environ 0,8 cas pour 100 000 individus et un taux de mortalité rapporté variant de 10 % à 20 %. La prise en charge actuelle repose sur une combinaison d'intervention neurochirurgicale et d'une thérapie antimicrobienne intraveineuse prolongée. Lorsque cela est réalisable, un drainage chirurgical ou une aspiration stéréotaxique est effectué pour réduire la pression intracrânienne, diminuer la charge infectieuse et obtenir des échantillons biologiques pour l'identification microbiologique de l'agent pathogène causal, permettant un traitement antimicrobien ciblé.

Cependant, l'intervention neurochirurgicale n'est pas toujours réalisable. Des facteurs techniques tels que la petite taille de l'abcès ou une localisation anatomique profonde peuvent empêcher l'accès à la lésion, et certains patients peuvent présenter des contre-indications aux procédures neurochirurgicales. Dans ces situations, la documentation microbiologique devient particulièrement difficile. Les méthodes diagnostiques conventionnelles, y compris les hémocultures et l'analyse du liquide céphalorachidien, ont une sensibilité limitée dans l'abcès cérébral et échouent fréquemment à identifier l'agent pathogène causal.

Les progrès récents en diagnostic moléculaire ont conduit au développement d'approches de séquençage métagénomique pour la détection des agents pathogènes. L'analyse métagénomique permet l'identification non biaisée de l'ADN microbien directement à partir d'échantillons cliniques et peut fournir une détection plus large des agents pathogènes que les techniques traditionnelles basées sur la culture. Dans les infections neurochirurgicales, le séquençage métagénomique effectué sur des échantillons opératoires a montré des résultats prometteurs et peut améliorer la documentation microbiologique par rapport aux méthodes diagnostiques standard.

Parallèlement, le séquençage de l'ADN microbien acellulaire (ADNac) circulant dans le sang périphérique à l'aide du séquençage de nouvelle génération représente une approche diagnostique innovante et peu invasive. Cette technologie détecte de courts fragments d'ADN microbien libérés dans la circulation sanguine pendant une infection active et peut fournir des informations diagnostiques cliniquement pertinentes.

Cette étude vise à évaluer la performance diagnostique du séquençage métagénomique de l'ADNac microbien circulant chez les patients atteints d'abcès cérébral et à comparer sa performance avec le séquençage métagénomique et les cultures microbiologiques conventionnelles réalisées sur des échantillons peropératoires lorsque disponibles.

Cette étude pilote est conçue pour fournir des données de preuve de concept sur la performance diagnostique du séquençage de l'ADNac microbien circulant dans l'abcès cérébral. Les résultats pourraient aider à définir le rôle de cette approche diagnostique dans l'amélioration de la documentation microbiologique et l'orientation du traitement antimicrobien ciblé, en particulier lorsque l'échantillonnage neurochirurgical n'est pas réalisable.