ADN libre de células circulante para el diagnóstico de abscesos cerebrales: Un estudio piloto (METABCES-PoC)

El absceso cerebral es una infección intracraneal rara pero grave, con una incidencia estimada de aproximadamente 0,8 casos por cada 100.000 individuos y una tasa de mortalidad reportada que oscila entre el 10% y el 20%. El manejo actual se basa en una combinación de intervención neuroquirúrgica y terapia antimicrobiana intravenosa prolongada. Cuando es factible, se realiza drenaje quirúrgico o aspiración estereotáctica para reducir la presión intracraneal, disminuir la carga infecciosa y obtener muestras biológicas para la identificación microbiológica del patógeno causante, lo que permite un tratamiento antimicrobiano dirigido.

Sin embargo, la intervención neuroquirúrgica no siempre es factible. Factores técnicos como el tamaño pequeño del absceso o la ubicación anatómica profunda pueden impedir el acceso a la lesión, y algunos pacientes pueden presentar contraindicaciones para los procedimientos neuroquirúrgicos. En estas situaciones, la documentación microbiológica se vuelve particularmente desafiante. Los métodos de diagnóstico convencionales, incluidos los hemocultivos y el análisis del líquido cefalorraquídeo, tienen una sensibilidad limitada en el absceso cerebral y con frecuencia no logran identificar el patógeno causante.

Los avances recientes en diagnósticos moleculares han llevado al desarrollo de enfoques de secuenciación metagenómica para la detección de patógenos. El análisis metagenómico permite la identificación imparcial del ADN microbiano directamente de muestras clínicas y puede proporcionar una detección de patógenos más amplia que las técnicas tradicionales basadas en cultivo. En infecciones neuroquirúrgicas, la secuenciación metagenómica realizada en muestras operatorias ha mostrado resultados prometedores y puede mejorar la documentación microbiológica en comparación con los métodos de diagnóstico estándar.

En paralelo, la secuenciación de ADN libre de células microbianas circulante (cfDNA) en sangre periférica utilizando secuenciación de próxima generación representa un enfoque diagnóstico innovador y mínimamente invasivo. Esta tecnología detecta fragmentos cortos de ADN microbiano liberados en el torrente sanguíneo durante una infección activa y puede proporcionar información diagnóstica clínicamente relevante.

Este estudio tiene como objetivo evaluar el rendimiento diagnóstico de la secuenciación metagenómica de cfDNA microbiano circulante en pacientes con absceso cerebral y comparar su rendimiento con la secuenciación metagenómica y los cultivos microbiológicos convencionales realizados en muestras intraoperatorias cuando están disponibles.

Este estudio piloto está diseñado para proporcionar datos de prueba de concepto sobre el rendimiento diagnóstico de la secuenciación de cfDNA microbiano circulante en el absceso cerebral. Los resultados pueden ayudar a definir el papel de este enfoque diagnóstico en la mejora de la documentación microbiológica y la guía de la terapia antimicrobiana dirigida, particularmente cuando el muestreo neuroquirúrgico no es factible.