循环游离DNA用于脑脓肿诊断：一项初步研究 (METABCES-PoC)
评估循环游离DNA对脑脓肿微生物学诊断的价值：一项先导概念验证研究
脑脓肿是一种严重的颅内感染，具有显著的发病率和死亡率。 标准治疗方案结合神经外科干预（如可行）与长期静脉抗生素治疗。 神经外科手术，如手术引流或立体定向穿刺，在降低颅内压力、减少感染负荷以及获取样本进行微生物鉴定方面发挥着关键作用。
然而，由于技术限制或患者相关禁忌症，神经外科干预并非总是可行。 在这些情况下，微生物学记录变得尤为困难。 传统诊断方法的敏感性有限，血培养和腰椎穿刺仅在约25%的脑脓肿病例中产生阳性结果。
传染病诊断的最新进展引入了宏基因组学方法，可能改善病原体检测。 研究表明，手术样本的宏基因组分析可以提供比传统基于培养的方法更全面的微生物学记录。 此外，血液中循环微生物游离DNA的下一代测序（NGS）能够检测半衰期短的微生物DNA片段，反映活动性感染。 该技术已在微生物学记录困难的情况下（如发热性中性粒细胞减少症）显示出有希望的结果。 本研究旨在评估该方法在脑脓肿患者中的表现。
研究概览
详细说明
脑脓肿是一种罕见但严重的颅内感染，估计发病率约为每10万人中0.8例，报告的死亡率在10%到20%之间。 当前的治疗依赖于神经外科干预和长期静脉抗菌治疗的结合。 在可行的情况下，进行外科引流或立体定向抽吸以降低颅内压，减少感染负担，并获取生物样本进行致病病原体的微生物学鉴定，从而实现靶向抗菌治疗。
然而，神经外科干预并非总是可行。 技术因素如脓肿体积小或解剖位置深可能阻碍对病灶的接近，且部分患者可能存在神经外科手术的禁忌症。 在这些情况下，微生物学记录变得尤为困难。 传统诊断方法，包括血培养和脑脊液分析，在脑脓肿中敏感性有限，常常无法识别致病病原体。
分子诊断学的最新进展导致了用于病原体检测的宏基因组测序方法的发展。 宏基因组分析能够直接从临床样本中无偏倚地识别微生物DNA，可能比传统的基于培养的技术提供更广泛的病原体检测。 在神经外科感染中，对手术样本进行的宏基因组测序已显示出有希望的结果，与标准诊断方法相比，可能改善微生物学记录。
同时，使用下一代测序对循环微生物无细胞DNA（cfDNA）进行外周血测序代表了一种创新且微创的诊断方法。 该技术检测在活动性感染期间释放到血液中的微生物DNA短片段，可能提供临床相关的诊断信息。
本研究旨在评估循环微生物cfDNA宏基因组测序在脑脓肿患者中的诊断性能，并在可用时，将其性能与术中样本进行的宏基因组测序和传统微生物培养进行比较。
这项初步研究旨在提供关于循环微生物cfDNA测序在脑脓肿中诊断性能的概念验证数据。 结果可能有助于定义这种诊断方法在改善微生物学记录和指导靶向抗菌治疗中的作用，特别是在神经外科采样不可行时。
研究类型
注册 (估计的)
阶段
- 不适用
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Saber touati, PhD
- 电话号码：04 76 76 58 05
- 邮箱：stouati1@chu-grenoble.fr
研究联系人备份
- 姓名：Marion LE MARECHAL, MD,PhD
- 电话号码：04 76 76 52 91
- 邮箱：MLemarechal@chu-grenoble.fr
学习地点
-
-
-
Grenoble、法国
- CHU de Grenoble Alpes, Laboratoire de bactériologie
-
接触：
- Yvan Caspar, PharmD; PhD
- 电话号码：04 76 76 63 12
- 邮箱：YCaspar@chu-grenoble.fr
-
Grenoble、法国
- CHU de Grenoble Alpes, Service de réanimation neurochirurgicale
-
接触：
- Clotilde Schilte, MD
- 电话号码：04 76 76 66 88
- 邮箱：CSchilte@chu-grenoble.fr
-
-
参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
描述
纳入标准：
- 参与者年龄≥18岁。
- 参与者患有需神经外科手术的脑脓肿。
- 已签署知情同意书
- 有医疗保险覆盖
排除标准：
- 参与者处于另一项研究的排除期
- 参与者属于《公共卫生法典》第L1121-5至L1121-8条所述情况（对应所有受保护人群：孕妇、产妇、哺乳期妇女、被司法或行政决定剥夺自由者、根据第L.3212-1和L.3213-1条接受精神病治疗但不符合第L.1121-8条规定者、为研究目的以外的原因入住医疗或社会机构者、未成年人、受法律保护或无法表达同意者）。
- 与主要研究者存在隶属关系的工作人员
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：诊断
- 分配：不适用
- 介入模型：单组作业
- 屏蔽：无（打开标签）
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
|---|---|
|
实验性的：宏基因组诊断评估
|
在神经外科干预前，将采集20 mL外周血样本，用于循环微生物细胞游离DNA的宏基因组下一代测序（mNGS）分析。
结果将与术中脑脓肿标本的宏基因组分析和常规培养进行比较，后者作为微生物鉴定的参考标准。
|
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
血液与脑脓肿宏基因组学一致性
大体时间：第 0 天
|
血液样本中无细胞DNA（cfDNA）宏基因组下一代测序与术中脑脓肿样本宏基因组分析所鉴定的细菌物种比较。
|
第 0 天
|
次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
宏基因组新一代测序与培养一致性对比
大体时间：第 0 天
|
利用宏基因组下一代测序与金标准培养技术对围手术期脑脓肿样本进行细菌种类鉴定的评估。
|
第 0 天
|
|
血浆游离DNA与脓肿培养相关性
大体时间：第0天
|
通过血液样本中循环游离DNA（cfDNA）的宏基因组分析与术中脑脓肿样本传统培养鉴定的细菌物种比较。
|
第0天
|
|
对抗菌治疗的潜在临床影响
大体时间：1个月后
|
与标准培养诊断相比，评估宏基因组下一代测序结果可能引发的治疗调整或抗生素优化。
|
1个月后
|
合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (估计的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索，没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求，请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改，我们的网站上也会自动更新.