Kiertävä Soluvapaa DNA Aivopussin Tunnistamisessa: Pilottitutkimus (METABCES-PoC)

Aivopussinpaise on harvinainen mutta vakava kallon sisäinen infektio, jonka arvioitu esiintyvyys on noin 0,8 tapausta 100 000 henkilöä kohden ja ilmoitettu kuolleisuus vaihtelee 10 %:sta 20 %:iin. Nykyinen hoito perustuu yhdistelmään neurokirurgista toimenpidettä ja pitkäaikaista laskimonsisäistä mikrobilääkehoitoa. Kun mahdollista, suoritetaan kirurginen dreenaus tai stereotaktinen aspiraatio vähentämään kallon sisäistä painetta, vähentämään infektiotaakkaa ja saamaan biologisia näytteitä aiheuttavan patogeenin mikrobilogista tunnistamista varten, mikä mahdollistaa kohdennetun mikrobilääkehoidon.

Neurokirurginen toimenpide ei kuitenkaan aina ole mahdollinen. Tekniset tekijät, kuten pieni paiseen koko tai syvä anatominen sijainti, voivat estää pääsyn leesioon, ja joillakin potilailla voi olla kontraindikaatioita neurokirurgisiin toimenpiteisiin. Näissä tilanteissa mikrobiloginen dokumentointi tulee erityisen haastavaksi. Perinteisillä diagnoosimenetelmillä, mukaan lukien veriviljelyt ja selkäydinnesteanalyysi, on rajoitettu herkkyys aivopussinpaiseessa, ja ne usein epäonnistuvat tunnistamaan aiheuttavan patogeenin.

Viimeaikaiset edistysaskeleet molekyylidiagnostiikassa ovat johtaneet metagenomisen sekvensoinnin menetelmien kehittämiseen patogeenien havaitsemiseksi. Metagenominen analyysi mahdollistaa puolueettoman mikrobi-DNA:n tunnistamisen suoraan kliinisistä näytteistä ja voi tarjota laajemman patogeenien havaitsemisen kuin perinteiset viljelyyn perustuvat tekniikat. Neurokirurgisissa infektioissa leikkausnäytteistä suoritettu metagenominen sekvensointi on osoittanut lupaavia tuloksia ja voi parantaa mikrobilogista dokumentointia verrattuna standardeihin diagnoosimenetelmiin.

Rinnakkain verenkierrossa olevan mikrobilähtöisen soluvapaan DNA:n (cfDNA) sekvensointi perifeerisestä verestä käyttäen uuden sukupolven sekvensointia edustaa innovatiivista ja minimaalisesti invasiivista diagnoosimenetelmää. Tämä teknologia havaitsee lyhyitä mikrobilähtöisen DNA:n fragmentteja, jotka vapautuvat verenkiertoon aktiivisen infektion aikana, ja voi tarjota kliinisesti merkityksellistä diagnoosietä tietoa.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on arvioida kiertävän mikrobilähtöisen cfDNA:n metagenomisen sekvensoinnin diagnostista suorituskykyä aivopussinpaiseen potilailla ja verrata sen suorituskykyä metagenomiseen sekvensointiin ja perinteisiin mikrobilogisiin viljelyihin, jotka suoritetaan leikkausnäytteistä, kun saatavilla.

Tämä pilottitutkimus on suunniteltu tarjoamaan konseptin todistusaineistoa kiertävän mikrobilähtöisen cfDNA:n sekvensoinnin diagnostisesta suorituskyvystä aivopussinpaiseessa. Tulokset voivat auttaa määrittelemään tämän diagnoosimenetelmän roolia parantamaan mikrobilogista dokumentointia ja ohjaamaan kohdennettua mikrobilääkehoitoa, erityisesti kun neurokirurginen näytteenotto ei ole mahdollinen.