Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Genetika diabetu 2. typu u západní Afriky

Genetika diabetu 2. typu u různých populací

Pozadí:

  • Diabetes typu 2 (T2D) a související komplikace jsou hlavními přispěvateli k celosvětové zátěži nemocí. T2D je již velkou zdravotní hrozbou pro populace ve vyspělých zemích a rychle se ujímá v rozvojovém světě.
  • Předpokládá se, že pochopení komplexní souhry mezi genetickými charakteristikami a charakteristikami životního stylu v etiologii T2D a souvisejících komplikací povede k rozvoji lepších preventivních a terapeutických strategií. Výsledky tohoto projektu nám navíc usnadní pochopení příčin diabetu u Afroameričanů, dalších amerických a světových populací.

Cíle:

  • Provést celogenomovou asociační studii (GWAS) k identifikaci genetických variant náchylnosti k diabetu mezi Yoruby v Ibadanu v Nigérii.
  • Zapsat a prozkoumat 300 nesouvisejících případů T2D a 300 etnicky odpovídajících jorubských kontrol.
  • Provést nové sekvenování pozičního kandidátního genu/lokusu k identifikaci pravděpodobných funkčních variant v podskupině kohorty.
  • Provést replikační studie 100 nejlepších bodovaných variant ve třech nezávislých vzorcích afrických a evropských předků.
  • Zkoumat, zda varianty spojené s diabetem objevené v evropské populaci zvyšují riziko diabetu u Západoafričanů.

Způsobilost:

  • Pacienti ve věku 18 let s potvrzenou T2D, kteří jsou nově diagnostikováni nebo jsou léčeni etnickým původem Yoruba v Ibadanu v Nigérii. Kontrolní subjekty jsou nediabetici etnicky odpovídající pacientům.

Design:

  • Návrh studie pro pacienty i kontroly sestává z následujících kroků:
  • Diskutujte o procesu informovaného souhlasu a získejte podepsaný formulář informovaného souhlasu. Informovaný souhlas poskytne vyškolený personál kliniky.
  • Přiřadit ID studie (čárový kód)
  • Administrovat dotazníky
  • Získejte vzorek moči
  • Změřte krevní tlak
  • Získejte antropometrická měření včetně složení těla
  • Proveďte píchnutí do prstu pro stanovení hladiny glukózy v krvi
  • Získejte vzorky žilní krve
  • Proveďte oční vyšetření
  • Následující den proveďte konfirmační glykémii pro malou podskupinu účastníků vyžadujících potvrzení předchozího výsledku testu Extrakce DNA z uložených vzorků bude provedena buď v National Institutes of Health nebo v laboratoři v Nigérii.
  • GWAS bude prováděn pomocí veřejně dostupných softwarových balíčků.

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Podmínky

Detailní popis

Tento výzkumný protokol je určen ke studiu genetického základu diabetu 2. typu (T2D) a souvisejících stavů v Africe. Tento projekt, Africa America Diabetes Mellitus (AADM) Study, byl nepřetržitě financován více než deset let několika instituty na NIH, včetně grantu R01 od NIDDK Dr. Rotimimu, když byl profesorem na Howard University. Díky tomu má studie AADM dobře vybudovanou mezinárodní infrastrukturu s dlouholetými spolupracovníky. Zatímco předchozí fáze této studie zahrnovaly příbuzné jedince, v současné době zařazujeme pouze nesouvisející případy T2D a kontroly, abychom usnadnili celogenomové asociační studie (GWAS) nebo podobné typy genetických analýz, pro které jsou optimální nesouvisející datové soubory. Celkově očekáváme zapsání 10 000 případů a kontrol z 5 center v západní Africe (Enugu, Ibadan a Lagos v Nigérii; Accra a Kumasi v Ghaně). Vzorkováním z těchto regionů zařadíme jednotlivce reprezentující primárně 4 hlavní etnické skupiny (Jorubové, Ibo, Akan a Ga) a také malý počet jednotlivců z různých jiných etnických skupin. K dnešnímu dni jsme zapsali 6 486 jedinců. Tato data budou použita pro různé genetické analýzy, včetně asociačních studií založených na datech z celého genomu, exomových čipových polí a datových sad kandidátních genů/lokusů, mapování vazebné nerovnováhy (LD) a funkčních studií v různých etnicky definovaných populacích. Na každém místě bude vyvinuto úsilí o zařazení etnicky vyvážených případů a kontrol s cílem usnadnit provádění studií GWAS a kandidátských genů/lokusů v širokém spektru populací. Abychom dále porozuměli komplexnímu metabolickému pozadí T2D a jeho důsledkům, budou tato data také zkoumána s ohledem na různé rysy související s T2D, včetně obezity, hypertenze, sérových lipidů, zánětu, nefropatie a neuropatie. Kromě toho budou tyto vzorky použity ke studiu genetických variací v kontextu toho, jak účastníci různého původu reagují na drogy a další environmentální faktory a jak tato variace mohla formovat populační historii. Celkově se tyto studie zaměřují na další pochopení genetického základu T2D u afrických jedinců. Vzhledem k minulým aktivitám se také očekává, že tento zdroj bude tvořit základ mnohočetné spolupráce mezi laboratoří Dr. Rotimi, několika výzkumníky z NIH a vědci mimo NIH. Doufáme, že v průběhu času mohou být do této studie přidány další populace z Afriky a mimo ni, aby se rozšířilo zaměření na jednotlivce z různého původu; každá další populace bude používat stejné postupy jako v probíhající práci mezi Afričany.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

7418

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

Studijní místa

      • Accra, Ghana
        • University of Ghana
      • Kumasi, Ghana
        • University of Science and Tech
      • Enugu, Nigérie
        • University of Nigeria
      • Ibadan, Nigérie
        • University of Ibadan
      • Lagos, Nigérie
        • University of Lagos

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti s potvrzeným T2D, kteří jsou nově diagnostikováni nebo jsou léčeni, a pacienti bez T2D (etnicky odpovídající) v Ibadanu v Nigérii

Popis

  • KRITÉRIA PRO ZAŘAZENÍ:

Případy - Muži a ženy s potvrzeným diabetes mellitus 2. typu, kteří se buď léčí na diabetes, nebo mají nově diagnostikovanou hladinu cukru v krvi při více než jedné příležitosti vyšší nebo rovnou 126 mg/dl. Tyto osoby musí být starší 118 let. V tomto ohledu budou všichni nově diagnostikovaní účastníci povinni navštívit kliniku následující den, aby provedli test glykémie nalačno k potvrzení předchozích výsledků.

Kontroly Muži a ženy s plazmatickou glukózou nalačno (FPG) nižší než 100 mg/dl (5,6 mmol/l). Kontroly musí být starší 18 let a měly by být etnicky sladěny s případy. Zapsané případy a kontroly spolu nesmí souviset. Proto může být z každé rodiny zapsána pouze jedna osoba, pokud nejsou manželé.

Pokusí se přihlásit stejný počet mužů a žen. Aby bylo zajištěno, že v každé studii bude zachována etnická distribuce, navrhujeme zapsat etnicky odpovídající účastníky relevantní pro každou studii.

KRITÉRIA VYLOUČENÍ:

Lidé, kteří nesplňují výše uvedená kritéria (např. mladší 18 let, bez požadavků na hladinu cukru v krvi atd.). Ne více než jeden nemanželský člen každé rodiny. Do této studie nebudou zahrnuti žádní vězni, těhotné ženy ani plody.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Case-Control
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Řízení
Kontrolní subjekty jsou nediabetici etnicky odpovídající pacientům
T2D
Pacienti s potvrzenou T2D, kteří jsou nově diagnostikováni nebo jsou léčeni v Ibadanu v Nigérii

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Já
Časové okno: pokračující
V podskupině účastníků prozkoumat vztah mezi stravou, střevní mikrobiotou a rysy souvisejícími s T2D.
pokračující
H
Časové okno: pokračující
Zkoumat, zda je hemoglobin A1c (HbA1c) jako indikátor kontroly hladiny glukózy v krvi v průběhu času spolehlivý v přítomnosti srpkovitého znaku (HbS), běžné hemoglobinopatie v západní Africe. Bude hodnocena souvislost mezi opakovanými měřeními HbA1c a změnami ve vlastnostech souvisejících s T2D v průběhu času. Budeme také hodnotit, zda existuje systematický rozdíl (bias) v odhadu A1c u nositelů srpkovitého znaku a nenosičů u osob s diabetem a bez diabetu.
pokračující
G
Časové okno: pokračující
g- V podskupině účastníků, abychom prozkoumali klíčové tkáně v patofyziologii T2D, budeme studovat rozdíly v genové expresi kosterního svalstva a tukové tkáně u štíhlých a obézních jedinců s a bez T2D (n=100, Biopsy Substudy).
pokračující
F
Časové okno: pokračující
f- Provádět populační genetické analýzy k popisu populační historie a vyvinout statistické techniky vhodné pro genetickou analýzu jedinců afrických předků.
pokračující
E
Časové okno: pokračující
e-Popsat tyto jedince epidemiologicky z hlediska metabolických znaků a prevalence příslušných stavů, protože pro některé znaky může jít o první rozsáhlou epidemiologickou populační studii Afričanů s vhodnými údaji pro takový popis.
pokračující
D
Časové okno: pokračující
d- Provést trans-etnické jemné mapování, aby se zjistilo, zda snížená LD napříč genomem u jedinců afrických předků může zpřesnit oblast zájmu kolem genetických asociací objevených v populacích neafrických předků. Provádět resekvenování kandidátských genů, sekvenování celého genomu (WGS) nebo sekvenování celého exomu (WES), jak to financování umožňuje, u účastníků se zájmovými metabolickými profily. Například budou vybráni jedinci, kteří mají extrémní hodnoty sérových lipidů pro WES. Varianty identifikované tímto resekvenováním budou genotypovány ve větší studijní populaci pro asociační analýzu.
pokračující
C
Časové okno: pokračující
c- Vyvinout rozsáhlý genetický epidemiologický zdroj pro replikaci nálezů v jiných studiích souvisejících vlastností u jedinců afrických a neafrických předků.
pokračující
B
Časové okno: pokračující
b- Zkoumat příspěvek interakcí gen x prostředí k riziku T2D a k ovlivnění souvisejících vlastností. Tato zkoumání mohou být prováděna buď na základě hypotéz, lokusově specifickým způsobem nebo agnosticky, tj. v celém genomu. Mezi varianty prostředí, které je třeba zvážit, patří faktory životního stylu (např. dieta, měřená dotazníky frekvence jídla (FFQ), socioekonomickými opatřeními a užívanými léky.
pokračující
A
Časové okno: pokračující
a- Provádět genetické asociační studie T2D a souvisejících vlastností (včetně krevního tlaku, sérových lipidů, krevní glukózy, adipozity) u západních Afričanů různých etnických skupin. Přístupy budou zahrnovat celogenomové asociační studie (včetně dat exomových čipů) a asociační analýzy kandidátních genů/lokusů.
pokračující

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Charles N Rotimi, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

3. února 2009

Termíny zápisu do studia

První předloženo

4. února 2009

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

4. února 2009

První zveřejněno (Odhadovaný)

5. února 2009

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

1. září 2026

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

29. srpna 2026

Naposledy ověřeno

8. června 2026

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další identifikační čísla studie

  • 999909070
  • 09-HG-N070

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Popis plánu IPD

Byla provedena rozsáhlá kontrola souhlasů souvisejících s tímto protokolem ze strany NHGRI IRB a bylo zjištěno, že protože proces počátečního souhlasu neřešil sdílení údajů účastníků a související rizika a pečlivě vytvořený vztah a důvěru s africkým obyvatelstvem a spolupracovníky , nebylo by vhodné sdílet data účastníka. V případě potřeby lze za tímto účelem poskytnout memorandum. I nadále budeme otevřeni zpřístupňování údajů prostřednictvím spolupráce, tedy používání údajů, které byly popsány v počátečních formulářích souhlasu.

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .