Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Radiogenomika u nádorů aerodigestivního traktu

21. března 2024 aktualizováno: Buddhist Tzu Chi General Hospital
Karcinomy aerodigestivního traktu jsou běžná malignita. Tyto rakoviny byly na Tchaj-wanu zařazeny do první desítky úmrtí souvisejících s rakovinou. Přestože se objevilo mnoho nových cílových terapií a imunoterapií, mnoho z nich nakonec selhalo. Například u cílové terapie byla hlášena 30-40% míra selhání a ještě vyšší u inhibitorů imunitního kontrolního bodu. Je zaručen spolehlivý model pro přesnější predikci odpovědi na léčbu a přežití. Radiomické vlastnosti extrahované z F-18 fluorodeoxyglukózové (18F-FDG) pozitronové emisní tomografie (PET) lze použít k určení biologie nádoru, jako je metabolom a heterogenita. Lze jej tedy použít k predikci léčebné odpovědi a individuálního přežití. Na druhé straně mohou genomická data odvozená ze sekvenování nové generace (NGS) zkoumat genetickou změnu rakovinných buněk. Může být použit ke genetické identifikaci nádoru a může být také použit k identifikaci cílových genů. Obě modality však mají svou slabinu; kombinace těchto dvou může vytvořit výkonnější prediktivní model pro přesnější klinické rozhodnutí. Výzkumníci plánují nábor pacientů ve věku alespoň 20 let s diagnózou rakoviny aerodigestivního traktu pro radiogenomickou studii. Naše předchozí studie zjistily, že radiomické vlastnosti odvozené z 18F-FDG PET mohou predikovat odpověď na léčbu a přežití u pacientů s karcinomem jícnu léčených trimodální metodou. Výzkumníci také zjistili, že radiomika může předpovídat přežití u pacientů s EGFR-mutovaným plicním adenokarcinomem léčených cílovou terapií. Kromě toho výsledky naší studie ukázaly, že úroveň exprese PD-L1 je spojena také s radiomikou. Vyšetřovatelé plánují přidat genomická data do radiomiky a zkoumat rakoviny z různých aspektů. Výzkumníci se snaží navrhnout přesnější model pro predikci léčebné odpovědi a přežití u pacientů s rakovinou aerodigestivního traktu.

Přehled studie

Postavení

Postavení

Označuje aktuální stav náboru nebo stav rozšířeného přístupu.
Dokončeno

Podmínky

Podmínky

Nemoc, porucha, syndrom, nemoc nebo zranění, které je studováno. Na webu ClinicalTrials.gov mohou podmínky zahrnovat i další problémy související se zdravím, jako je délka života, kvalita života a zdravotní rizika.

Detailní popis

Toto je prospektivní studie a vyšetřovatelé používají rutinní patologické vzorky pro sekvenování nové generace (NGS), mikrosatelitní nestabilitu (MSI) a imunohistochemické barvení.

Patologická vyšetření včetně PD-L1, stavu EGFR, ALK a ROS-1.

NGS (Next Generation Sequencing): Celková DNA byla extrahována z EDTA-periferní žilní krve a vzorků tumoru zalitých v parafínu pomocí sady QIAamp® DNA Blood Mini Kit a QIAamp DNA FFPE Tissue Kit (QIAGEN GmbH, Hilden, Německo). Pro celou sekvenci exomu DNA, krátce, byla nádorová a krevní DNA sonikována pomocí sonikátoru Covaris M220 (Life Technologies Europe, Gent, Belgie) a poté ligována do adaptéru pro další amplifikaci (Illumina® TruSeq Exome Library Prep, USA). Veškerá příprava knihovny byla provedena v Cancer Translational Core Facility na Taipei Medical University. Po přípravě knihovny byly všechny vzorky sekvenovány pomocí systému NextSeq500 podle pokynů výrobce (Illumina, San Diego, USA). Po provedení sekvenování byla kvalita souboru čtení (fastq) hodnocena pomocí FastQC a poté mapována pomocí lidského Hg19 jako reference. Soubory Bam byly použity jako vstup pro algoritmus Varscan k identifikaci zárodečných a somatických mutací. Varianty anotované a filtrované byly ručně zkontrolovány pomocí IGV (Integrative Genomics Viewer), poté potvrzeny Sangerovou sekvencí.

Pro výpočet TMB (celková mutační zátěž) na megabázi se celkový počet spočítaných mutací vydělí velikostí kódující oblasti cílového území.

Pro výpočet MATH (heterogenita tumoru mutované alely) vyšetřovatelé nejprve získají MAF (frakci DNA, která ukazuje mutovanou alelu v genovém lokusu) každého vzorku tumoru. Distribuce MAF bude použita k výpočtu mediánu (střed distribuce) a MD (střední odchylka) MAF v nádoru. MD se určuje získáním absolutních rozdílů všech MAF z mediánu MAF. Poté se medián absolutních rozdílů vynásobí faktorem 1,4826, aby se získala MD. Hodnota MATH se vypočítá jako procentuální poměr MD k mediánu: MATH = (MD/medián) × 100.

MSI (Microsatellite instability) Nestabilita mikrosatelitů polymerázová řetězová reakce (MSI-PCR) Testování MSI-PCR bylo provedeno Cancer Translational Core Facility of Taipei Medical University pomocí analytické soupravy Promega MSI (Promega). Analýza MSI se skládá z pěti téměř monomorfních mononukleotidových markerů (BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24 a MONO-27) pro stanovení MSI. Analýza MSI byla provedena podle pokynů výrobce (Promega). Produkty byly analyzovány kapilární elektroforézou a výzkumníci interpretovali mikrosatelitní nestabilitu ve 2 nebo více z 5 mononukleotidových lokusů jako MSI-vysoké, mikrosatelitní nestabilitu na jediném mononukleotidovém lokusu jako MSI-nízké a žádnou nestabilitu na žádném z lokusů jako mikrosatelitově stabilní ( MSS).

Obrazové rysy FDG PET vyšetřovatelé extrahovali následovně:

Tradiční obrazové parametry zahrnují SUVmax, objem metabolického tumoru (MTV) a glykolýzu celkové léze (TLG) primárního tumoru. Tradiční FDG PET parametry byly vypočteny pomocí komerčně dostupného softwaru (PBAS, PMOD 4.0). Radiomika (analýza textury) bude počítána pouze pro předúpravu FDG PET. Mezi matrice radiomické analýzy patří histogramová analýza, matice společného výskytu na úrovni šedé (GLCM), matice kódování společných výskytů na úrovni textury (TFCCM), matice délky běhu na úrovni šedé (GRLLM), matice zón velikosti šedé na úrovni (GLSZM) )、 matice rozdílu šedého tónu sousedství (NGTDM), matice kódování funkcí textury (TFCM), matice kódování funkcí textury (TFCCM) a matice závislosti na úrovni sousedství (NGLD).

Typ studie

Typ studie

Popisuje povahu klinické studie. Typy studií zahrnují intervenční studie (také nazývané klinické studie), observační studie (včetně registrů pacientů) a rozšířený přístup.
Pozorovací

Zápis (Aktuální)

Zápis

Počet účastníků klinické studie. „Očekávaný“ zápis je cílový počet účastníků, které výzkumníci pro studii potřebují.
139

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní kontakt

Jméno a kontaktní údaje osoby, která může odpovědět na otázky týkající se registrace do klinické studie. Každé místo, kde se studie provádí, může mít také konkrétní kontakt, který může lépe odpovědět na tyto otázky.

Studijní místa

  • Tchaj-wan
      • Hualien City, Tchaj-wan, 970
        • Hualien Tzu Chi Hospital

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Kritéria způsobilosti

Klíčové požadavky, které musí lidé, kteří se chtějí zúčastnit klinické studie, splňovat nebo vlastnosti, které musí mít. Kritéria způsobilosti se skládají jak z kritérií pro zařazení (která jsou vyžadována pro účast osoby ve studii), tak z kritérií vyloučení (která brání osobě v účasti). Typy kritérií způsobilosti zahrnují, zda studie přijímá zdravé dobrovolníky, má požadavky na věk nebo věkovou skupinu nebo je omezena pohlavím.

Věk způsobilý ke studiu

20 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Metoda odběru vzorků

Ukázka pravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti pouze s karcinomem aerodigestivního traktu, kteří mohou být analyzováni pomocí radiomik FDG PET.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Věk minimálně 20 let
  • Patologicky prokázané rakoviny aerodigestivního traktu a byly podrobeny kompletnímu stagingu
  • Patologický vzorek primárního nádoru
  • Pevná část primárního nádoru by měla být u rakoviny plic nebo hlavy a krku alespoň 2 cm. Primární nádor rakoviny jícnu by měl být alespoň cT2.

Kritéria vyloučení:

  • Koexistence rakoviny neaerodigestivního traktu.
  • Dostaňte nejlepší podpůrnou péči pouze po diagnóze.
  • Nelze splnit FDG PET/CT vyšetření.
  • Nelze určit primární nádor.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Kohorta
  • Časové perspektivy: Budoucí

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Primární výstupní opatření

V protokolu klinické studie je plánovaná výsledná míra, která je nejdůležitější pro hodnocení účinku intervence/léčby. Většina klinických studií má jedno primární měřítko výsledku, ale některé mají více než jedno.
Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Korelace radiogenomiky
Časové okno: 3 měsíce
Studujte korelaci radiomiky a genomiky a patologických znaků
3 měsíce

Sekundární výstupní opatření

Sekundární výstupní opatření

V protokolu klinické studie jde o plánované měřítko výsledku, které není tak důležité jako primární měřítko výsledku pro hodnocení účinku intervence, ale je stále zajímavé. Většina klinických studií má více než jedno sekundární měřítko výsledku.
Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Odpověď na léčbu a přežití
Časové okno: 3 roky
Studujte souvislost radiogenomiky s léčebnou odpovědí a přežitím
3 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Sponzor

Organizace nebo osoba, která iniciuje studii a která má autoritu a kontrolu nad studií.
Buddhist Tzu Chi General Hospital

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

Začátek studia

Skutečné datum, kdy byl první účastník zařazen do klinické studie. „Očekávané“ datum zahájení studie je datum, o kterém si vědci myslí, že bude datem zahájení studie.
1. srpna 2020

Primární dokončení (Aktuální)

Primární dokončení

Datum, kdy byl poslední účastník klinické studie vyšetřen nebo obdržel intervenci ke sběru konečných dat pro primární měření výsledku. Zda byla klinická studie ukončena podle protokolu nebo byla ukončena, toto datum neovlivňuje. U klinických studií s více než jedním primárním výstupním měřením s různými daty dokončení se tento termín vztahuje k datu, kdy je dokončen sběr dat pro všechna primární výsledná měření. „Očekávané“ datum primárního dokončení je datum, o kterém si vědci myslí, že bude primárním datem dokončení studie.
31. prosince 2023

Dokončení studie (Aktuální)

Dokončení studie

Datum, kdy byl poslední účastník klinické studie vyšetřen nebo dostal intervenci/léčbu za účelem shromáždění konečných dat pro měření primárního výsledku, sekundárního měření výsledku a nežádoucí příhody (tj. poslední návštěva posledního účastníka). „Očekávané“ datum dokončení studie je datum, o kterém si vědci myslí, že bude datem dokončení studie.
31. prosince 2023

Termíny zápisu do studia

První předloženo

První předloženo

Datum, kdy zadavatel studie nebo zkoušející poprvé předložil záznam studie na ClinicalTrials.gov. Mezi prvním odeslaným datem a dostupností záznamu na ClinicalTrials.gov (první zveřejněné datum) je obvykle několik dní.
17. března 2020

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

Datum, kdy zadavatel studie nebo zkoušející poprvé předloží záznam studie, který je v souladu s kritérii kontroly kvality (QC) Národní lékařské knihovny (NLM). Sponzor nebo zkoušející může potřebovat revidovat a předložit záznam studie jednou nebo vícekrát, než budou splněna kritéria kontroly kontroly kvality NLM. Je odpovědností sponzora nebo zkoušejícího zajistit, aby byl záznam studie v souladu s kritérii kontroly kontroly kvality NLM.
17. března 2020

První zveřejněno (Aktuální)

První zveřejněno

Datum, kdy byl záznam studie poprvé k dispozici na webu ClinicalTrials.gov poté, co byla dokončena kontrola kontroly kvality (QC) National Library of Medicine (NLM). Mezi datem, kdy zadavatel studie nebo zkoušející předložil záznam studie, a prvním zveřejněným datem je typicky několik dní zpoždění.
19. března 2020

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

Poslední zveřejněná aktualizace

Nejnovější datum, kdy byly změny záznamu studie zpřístupněny na ClinicalTrials.gov. Mezi okamžikem, kdy byly změny odeslány na ClinicalTrials.gov sponzorem nebo zkoušejícím studie (datum poslední předložení aktualizace), a datem zveřejnění poslední aktualizace může nastat zpoždění.
22. března 2024

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

Nejnovější datum, kdy zadavatel studie nebo zkoušející předložil změny záznamu studie, které jsou v souladu s kritérii kontroly kvality (QC) National Library of Medicine (NLM). Je odpovědností sponzora nebo zkoušejícího zajistit, aby byl záznam studie v souladu s kritérii kontroly kontroly kvality NLM.
21. března 2024

Naposledy ověřeno

Naposledy ověřeno

Nejnovější datum, kdy zadavatel studie nebo zkoušející potvrdil informace o klinické studii na webu ClinicalTrials.gov jako přesné a aktuální. Pokud jde o studii s náborovým statusem náboru; ještě nenabírá nábor; nebo aktivní, nebyl nábor potvrzen během posledních 2 let, status náboru studie je uveden jako neznámý.
1. září 2022

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

Další identifikační čísla studie

Identifikátory nebo ID čísla jiná než číslo NCT, které klinické studii přiděluje zadavatel studie, financující subjekty nebo jiní. Tato čísla mohou zahrnovat jedinečné identifikátory z jiných registrů studií a čísla grantů National Institutes of Health.
  • IRB108-249-A

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Nastavení souborů cookie

Používáme cookies, abychom zajistili, že vám poskytneme nejlepší zážitek z našich webových stránek. Pro více informací si pečlivě přečtěte naše Zásady ochrany osobních údajů a cookies. ...>>>Svou preference můžete kdykoli změnit nebo svůj souhlas odvolat odstraněním cookies z vašeho webu nebo počítače, jak je popsáno v zásadách. Přijměte to a vyberte své předvolby zaškrtnutím příslušných polí v části „Správa nastavení“ níže. Než budete pokračovat v používání jakékoli části tohoto webu, pozorně si prosím přečtěte naše Podmínky služby.
«Spravovat nastavení