Přesné hodnocení a výzkum intervencí v oblasti sekvenování celého genomu novorozenců a rizika genetických onemocnění
Přesné hodnocení a výzkum intervencí v oblasti sekvenování celého genomu novorozenců a rizika genetických onemocnění (China Baby Omics)
Mateřské a dětské zdraví je základem veřejného zdraví a jeho stav přímo odráží celkovou úroveň zdraví populace. S rychlým socioekonomickým rozvojem a stále závažnějšími environmentálními problémy se zdravotní problémy žen a dětí staly rozšířenějšími a rozmanitějšími. V nové éře čelí mateřské a dětské zdraví novým výzvám, s vyššími požadavky v oblastech, jako je podpora reprodukčního zdraví, prevence vrozených vad, bezpečnost matek a kojenců a prevence dětských onemocnění. Kohortové studie, jako epidemiologická výzkumná metoda pro zkoumání etiologie onemocnění, zahrnují nábor účastníků před nebo během těhotenství a provádění sledování těhotenství, porodu a výsledků mateřského a dětského zdraví po narození, aby identifikovaly různé faktory ovlivňující onemocnění a zdraví. Zaměřující se na raná stádia života je tento přístup účinnou metodou pro studium souvislostí mezi environmentálními, genetickými a behaviorálními rizikovými faktory během raného života a embryonálního vývoje, zdraví plodu a zdraví kojence.
Tento projekt plánuje provádět dlouhodobá sledování párů a jejich potomků na rodinném základě, zatímco bude sbírat biologické vzorky v několika časových bodech. Systematické multidimenzionální hodnocení, založené na klinických informacích a multi-omických datech z zapojené populace, bude použito k odvození příčin reprodukčních a těhotenských onemocnění a vývojových abnormalit, k identifikaci nových biomarkerů pro onemocnění související s těhotenstvím, k vytvoření prediktivních modelů a k rozpoznání rizikových faktorů v raném životě potomků, čímž poskytne vodítko pro prevenci a kontrolu reprodukčních a vývojových onemocnění.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Detailní popis
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Hengchao Ruan, phD
- Telefonní číslo: 0571-88208964
- E-mail: ruanhengchao@zju.edu.cn
Studijní místa
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Čína, 310006
- Nábor
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Rodiny s probíhajícími těhotenstvími (pomocí asistované reprodukce nebo přirozeného početí) a novorozenci.
Kritéria pro vyloučení:
- Žádná
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Data sekvenování celého genomu
Časové okno: Po dokončení odběru vzorků, v průměru 1 rok.
|
Proveďte 30-40X sekvenování celého genomu vzorku cfDNA ze séra podle pokynů sady DNBSEQ-T7RS High-throughput Sequencing Kit (FCL PE100) V2.0 a proveďte bioinformatickou analýzu sekvenačních dat.
|
Po dokončení odběru vzorků, v průměru 1 rok.
|
|
Koncentrace metabolitu
Časové okno: Po dokončení sběru vzorků, v průměru 1 rok.
|
Koncentrace každého metabolitu byla analyzována a vypočítána pomocí automatizovaného softwaru HMQuant pro cílenou absolutní kvantifikaci metabolitů, který nezávisle vyvinula společnost BGI.
|
Po dokončení sběru vzorků, v průměru 1 rok.
|
|
Konstrukce a sekvenování cfRNA z periferní krve matky
Časové okno: Po dokončení odběru vzorků, v průměru 1 rok.
|
Konstrukce knihovny a kontrola kvality byly provedeny podle metody konstrukce knihovny BGI PALM-seq, následované sekvenováním cfRNA.
Bioinformatika sekvenování PALM-seq |
Po dokončení odběru vzorků, v průměru 1 rok.
|
|
Data o metylaci DNA celého genomu
Časové okno: Po dokončení odběru vzorků v průměru 1 rok.
|
Kombinace bisulfitové úpravy s technologií sekvenování s vysokou propustností umožňuje efektivní a přesné mapování profilů methylace DNA celého genomu, což z ní činí klíčový nástroj pro výzkum v epigenomice.
Na základě doma vyvinuté technologie sekvenování DNBSEQTM vyvinula společnost BGI nezávisle novou metodu přípravy knihovny využívající cyklizaci dvojitého vlákna.
Tento přístup účinně řeší problém zkreslení bází přítomný v tradičním sekvenování methylace, což umožňuje rychlé a efektivní získání autentických dat o úrovni methylace.
|
Po dokončení odběru vzorků v průměru 1 rok.
|
|
Rozdíly v expresi proteinů a funkční analýza
Časové okno: Po dokončení odběru vzorků v průměru 1 rok.
|
Příprava vzorků proteinů: Vzorky byly odebrány z -80°C a 50 µL každého vzorku bylo ošetřeno močovinou, dithiotreitolem a jodoacetamidem pro redukci a alkylaci.
Pro odstranění vysoce zastoupených proteinů byly použity desky pro extrakci na pevné fázi, následované přidáním trypsinu pro enzymatickou hydrolýzu.
Detekce kapalinovou chromatografií-hmotnostní spektrometrií: Po enzymatické hydrolýze byly peptidy analyzovány pomocí nanoflow-vysokoúčinné kapalinové chromatografie-vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (Lumos, Thermo) v režimu DIA (nezávislý sběr dat) pro sběr dat.
Analýza dat: Software DIA-NN byl použit k identifikaci a kvantifikaci proteinů z dat DIA.
|
Po dokončení odběru vzorků v průměru 1 rok.
|
|
Metagenomická data
Časové okno: Po dokončení sběru vzorků v průměru 1 rok.
|
Extrakce DNA z vaginálních sekretů a sekvenování knihovny: K extrakci DNA z vaginálních sekretů byl použit kit Magpure Stoll DNA KF; Metagenomická knihovna byla zkonstruována pomocí univerzálního přípravného kitu pro DNA knihovnu MGIEasy; K detekci rozsahu fragmentů a koncentrace knihovny byl použit Agilent 2100 Bioanalyzer.
Kvalifikované knihovny byly sekvenovány pomocí sekvenační platformy T1 podle pokynů kitu pro vysokokapacitní sekvenování DNBSEQ-T7RS.
Bioinformatická analýza metagenomických sekvenačních dat: Metagenomická data jsou nejprve podrobena kontrole kvality původních sekvencí pomocí softwaru Trimomatic, a poté jsou z zpracovaných dat odstraněny kontaminované sekvence pomocí softwaru fastq_streen, včetně sekvencí hostitele a kontaminace knihovny phix; Následně byl pro porovnání použit aligner BWA a nejprve byly odstraněny fragmenty lidského genomu.
Složení mikrobiálních druhů a relativní abundance byly vyhodnoceny pomocí softwaru Metaphlan2.
|
Po dokončení sběru vzorků v průměru 1 rok.
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Studijní židle: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Studijní židle: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- IRB-20250021-R
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .