Nøjagtig vurdering og interventionsforskning om nyfødt helgenomsekventering og risiko for genetiske sygdomme
Præcis Vurdering og Intervention Forskning om Nyfødt Hele Genom Sekventering og Genetisk Sygdomsrisiko (China Baby Omics)
Modre- og spædbarnssundhed er grundlaget for folkesundheden, og dens status afspejler direkte befolkningens samlede sundhedsniveau. Med hurtig socioøkonomisk udvikling og stadig mere alvorlige miljøproblemer er sundhedsproblemer blandt kvinder og børn blevet mere udbredte og forskelligartede. I den nye tid står modre- og børnesundhed over for nye udfordringer, med højere krav inden for områder som reproduktiv sundhedsfremme, forebyggelse af fødselsdefekter, modre- og spædbarnssikkerhed og forebyggelse af barndomssygdomme. Kohortestudier, som en epidemiologisk forskningsmetode til at udforske sygdomsætiologi, involverer rekruttering af deltagere før eller under graviditet og gennemførelse af opfølgninger på graviditet, fødsel og modre- og børnesundhedsresultater efter fødslen for at identificere forskellige faktorer, der påvirker sygdomme og sundhed. Med fokus på livets tidlige stadier er denne tilgang en effektiv metode til at studere sammenhænge mellem miljømæssige, genetiske og adfærdsmæssige risikofaktorer i det tidlige liv og under embryoudvikling, fosterets sundhed og spædbarnets sundhed.
Dette projekt planlægger at gennemføre langvarige opfølgninger på par og deres afkom på en familiebasis, samtidig med at der indsamles biologiske prøver på flere tidspunkter. En systematisk multidimensionel vurdering, baseret på kliniske oplysninger og multi-omics data fra den indskrevne befolkning, vil blive brugt til at udlede årsagerne til reproduktive og graviditetsrelaterede sygdomme og udviklingsabnormaliteter, identificere nye biomarkører for graviditetsrelaterede sygdomme, etablere prædiktive modeller og genkende risikofaktorer i afkommets tidlige liv, og derved give vejledning til forebyggelse og kontrol af reproduktive og udviklingsmæssige sygdomme.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Hengchao Ruan, phD
- Telefonnummer: 0571-88208964
- E-mail: ruanhengchao@zju.edu.cn
Studiesteder
-
-
Zhejiang
-
Hangzhou, Zhejiang, Kina, 310006
- Rekruttering
- Women's Hospital, School of Medicine, Zhejiang University
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Familier med igangværende graviditeter (via assisteret reproduktiv behandling eller naturlig undfangelse) og nyfødte børn.
Eksklusionskriterier:
- Ingen
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Helt-genom sekventeringsdata
Tidsramme: Efter afslutningen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
Udfør 30-40X hele-genom sekventering af serum cfDNA-prøven i henhold til instruktionerne i DNBSEQ-T7RS High-throughput Sequencing Kit (FCL PE100) V2.0, og udfør bioinformatisk analyse af sekventeringsdataene.
|
Efter afslutningen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
|
Koncentration af metabolit
Tidsramme: Efter fuldførelsen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
Koncentrationen af hvert metabolit blev analyseret og beregnet ved hjælp af den automatiserede målrettede metabolske absolutte kvantificeringssoftware HMQuant, der er uafhængigt udviklet af BGI.
|
Efter fuldførelsen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
|
Konstruktion og sekventering af cfRNA fra moderens perifere blod
Tidsramme: Efter afslutningen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
Bibliotekskonstruktionen og kvalitetskontrol blev udført i henhold til BGI PALM-seq bibliotekskonstruktionsmetoden, efterfulgt af cfRNA-sekventering.
PALM-seq-sekventeringsbioinformatikken
|
Efter afslutningen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
|
Hele-genomet DNA-methyleringsdata
Tidsramme: Efter afslutningen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
Kombinationen af bisulfitbehandling med højtydende sekventeringsteknologi muliggør effektiv og præcis kortlægning af hele-genom DNA-methyleringsprofiler, hvilket gør den til et afgørende værktøj til epigenomikforskning.
Baseret på den hjemligt udviklede DNBSEQTM-sekventeringsteknologi har BGI selvstændigt udviklet en ny biblioteksforberedelsesmetode, der anvender dobbeltstrengs-cirkularisering.
Denne tilgang adresserer effektivt basebias-problemet, der er til stede i traditionel methyleringssekventering, hvilket muliggør hurtig og effektiv indhentning af autentiske methyleringsniveau-data.
|
Efter afslutningen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
|
Proteinudtryksforskelle og funktionel analyse
Tidsramme: Efter gennemførelsen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
Prøveproteinforberedelse: Prøver blev taget fra -80°C, og 50 μL af hver prøve blev behandlet med urea, dithiotreitol og jodoacetamid til reduktion og alkylering.
Fastfaseekstraktionsplader blev brugt til at fjerne højforekomstproteiner, efterfulgt af tilsætning af trypsin til enzymatisk hydrolyse.
Væskekromatografi-massenspektrometridetektering: Efter enzymatisk hydrolyse blev peptiderne analyseret ved hjælp af nanoflow-højtydende væskekromatografi-højopløsningsmassenspektrometri (Lumos, Thermo) i DIA (data-uafhærig indsamling) tilstand til dataindsamling.
Dataanalyse: DIA-NN-software blev brugt til at identificere og kvantificere proteiner fra DIA-dataene.
|
Efter gennemførelsen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
|
De metagenomiske data
Tidsramme: Efter gennemførelsen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
DNA-ekstraktion og bibliotekssekventering af vaginale sekreter: Magpure Stoll DNA KF kit blev brugt til at ekstrahere DNA fra vaginale sekreter; Konstruer et metagenomisk bibliotek ved hjælp af MGIEasy universelle DNA-biblioteksforberedelseskit; Brug Agilent 2100 Bioanalyzer til at detektere fragmentområdet og koncentrationen af biblioteket.
Kvalificerede biblioteker blev sekventeret ved hjælp af T1-sekventeringsplatformen i henhold til DNBSEQ-T7RS højtydende sekventeringskit-instruktionerne.
Bioinformatikanalyse af metagenomiske sekventeringsdata: Metagenomiske data undergår først kvalitetskontrol af de originale sekvenser ved hjælp af Trimomatic-softwaren, og derefter fjernes forurenede sekvenser fra de behandlede data ved hjælp af fastq_streen-softwaren, inklusive værtssekvenser og phix-biblioteksforurening; Derefter blev BWA-aligneren brugt til sammenligning, og de humane genomfragmenter blev først fjernet.
Den mikrobielle artsammensætning og relative overflod blev evalueret ved hjælp af Metaphlan2-softwaren.
|
Efter gennemførelsen af prøveindsamlingen, i gennemsnit 1 år.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Studiestol: Hefeng Huang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
- Studiestol: Dan Zhang, Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- IRB-20250021-R
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .