Včasná diagnostika melanomu pomocí expresního profilování a neinvazivního odběru vzorků kožních buněk (DermTech)

Jedná se o multicentrickou studii sponzorovanou společností Derm Tech (DTI) International.

Specifické cíle studie

Tato výzkumná studie navrhuje použít neinvazivní metodu k zachycení povrchových buněk na pigmentových kožních lézích, u kterých je podezření, že se jedná o časné melanomy. Tato neinvazivní technologie „biopsie“ byla vyvinuta a patentována společností DermTech International. RNA v kožních buňkách zachycených touto metodou bude profilována za účelem diagnostiky povahy léze (tj. maligní melanom nebo ne). Úspěšný výsledek tohoto návrhu by vytvořil kandidátní neinvazivní diagnostický test založený na profilu genové exprese pro identifikaci časných stádií melanomů. Tento test a konkrétněji profil diagnostické genové exprese jsou považovány za kandidáty, protože profil by musel být validován (tj. prokázané jako diagnostické) ve větších klinických studiích. Sekundární výsledky mohou zahrnovat testy pro diagnostiku a prognózu různých pigmentových kožních lézí.

Specifický cíl 1: Vytvořit vzorovou sadu pigmentovaných kožních lézí. Každý vzorek se skládá z:

1. RNA získaná páskou z povrchové epidermis překrývající léze (stažení pásky bude také použito k získání RNA z normálních kožních oblastí a benigních névů jako kontroly).
2. Standardní biopsie stejné léze a doprovodná histologie a diagnóza. Biopsie by byly odebrány po odstranění pásky a podrobeny standardní histopatologické analýze, která by poskytla diagnózu "zlatého standardu". Tyto diagnózy by pak mohly být korelovány s daty generovanými v Specific

Cíl 2

Tento konkrétní cíl se skládá ze tří samostatných cílů:

1. Analýza vybraných vzorků RNA lézí pomocí DNA microarray.
2. Korelace dat genové exprese s histopatologií.
3. Vytvoření kandidátního expresního klasifikátoru pro diagnostiku melanomu.

Odizolování pásky (komerčně dostupné jako metoda pro obnovu RNA jako Epidermal Genetic Information Retrieval nebo EGIR™) je neinvazivní metoda, která umožňuje obnovu buněk obsahujících a spojených s horní epidermis [4]. Morhenn et al [4] prokázali proveditelnost neinvazivního odběru vzorků lidské epidermis sekvenčním stahováním lepicí pásky. Jejich práce ukázala, že odstranění pásky z kůže poskytlo dostatek RNA pro analýzu ribonukleázovým ochranným testem k detekci specifických druhů RNA, včetně těch, o kterých je známo, že jsou v nízkém množství.

4. Bude odebrána terapeuticky odstraněná tkáň

Před všemi bioptickými procedurami bude proveden postup stažení pásky. Páska se přiloží na místo a svižně se krouživými pohyby otírá tupým zaobleným koncem fixu nebo plastové zkumavky. Před odstraněním pásky je nutné provést minimálně 15 krouživých pohybů. Aby se vyhovělo skutečnosti, že mnohá místa budou menší než průměr pásky, dbejte na to, abyste pásku aplikovali pouze na léze nebo kontrolní místo a ne na okolní normální epidermis. Hranice léze bude na pásce ohraničena chirurgickým markerem; když jsou pásky zpracovány pro extrakci RNA, označení umožní odstranění pásky, která se nedotýkala léze (a která by mohla obsahovat normální epidermis). Celkem 4 pásky budou použity k odběru vzorků z místa o průměru větším nebo rovném 6 mm. Předběžná data získaná z DTI ukazují, že léze o průměru menším než 6 mm mohou vyžadovat až 8 pásek k získání RNA. Stažení pásky bude také provedeno na jedné normálně se objevující oblasti kůže (nejlépe; horní část zad nebo mastoidní výběžek) a také jeden benigní névus (pokud je k dispozici) pro srovnání. Po vzorkování budou pásky skladovány při -20oC nebo nižší. Pásky budou odeslány do DTI na suchém ledu expresní poštou k analýze.

Biopsie Po dokončení postupu stahování pásky bude celá léze chirurgicky vyříznuta podle standardní klinické praxe. Biopsie je standardní postup péče, který by byl prováděn bez ohledu na výzkum. Všechny odebrané tkáně jsou fixovány ve formalínu a odeslány do histopatologické laboratoře, kde jsou zality v parafínu a nařezány pro histopatologickou analýzu. Výsledky patologie budou shromažďovány pro rozlišení diagnózy. Patologické zprávy subjektu budou identifikovány přiřazenými jedinečnými identifikátory subjektu před použitím ve studii k ochraně identity subjektu.