Melanooman varhainen diagnoosi käyttämällä ilmentymisprofiilia ja ei-invasiivista ihosolunäytteenottoa (DermTech)

Tämä on monikeskustutkimus, jota sponsoroi Derm Tech (DTI) International.

Tutkimuksen erityistavoitteet

Tässä tutkimustutkimuksessa ehdotetaan ei-invasiivista menetelmää pintasolujen sieppaamiseen pigmentoituneista ihovaurioista, joiden epäillään olevan varhaisia ​​melanoomaa. DermTech International on kehittänyt ja patentoinut tämän ei-invasiivisen "biopsia"-tekniikan. Tällä menetelmällä siepattujen ihosolujen RNA profiloidaan leesion luonteen diagnosoimiseksi (ts. pahanlaatuinen melanooma vai ei). Tämän ehdotuksen onnistunut tulos loisi ei-invasiivisen diagnostisen ehdokasmäärityksen, joka perustuu geeniekspressioprofiiliin varhaisen vaiheen melanoomien tunnistamiseksi. Tätä määritystä ja erityisesti diagnostista geeniekspressioprofiilia pidetään ehdokkaana, koska profiili olisi validoitava (ts. diagnostiseksi) suuremmissa kliinisissä tutkimuksissa. Toissijaisiin tuloksiin voivat kuulua testit useiden pigmentoituneiden ihovaurioiden diagnosoimiseksi ja ennustamiseksi.

Erityinen tavoite 1: Luoda näytesarja pigmentoituneista ihovaurioista. Jokainen näyte koostuu:

1. RNA, joka on saatu talteen poistamalla teipillä leesion päällä oleva pinnallinen orvaskesi (teipin poistamista käytetään myös RNA:n talteenottamiseksi normaaleista ihoalueista ja hyvänlaatuisista nevusista kontrollina).
2. Tavallinen biopsia samasta vauriosta ja siihen liittyvä histologia ja diagnoosi. Biopsiat otettaisiin teipin irrotuksen jälkeen ja niille tehtiin standardi histopatologinen analyysi, joka antaisi "kultastandardin" diagnoosin. Nämä diagnoosit voitaisiin sitten korreloida Specificissa luotujen tietojen kanssa

Tavoite 2.

Tämä erityinen tavoite koostuu kolmesta yksittäisestä tavoitteesta:

1. Valittujen leesion RNA-näytteiden analyysi DNA-mikrosirulla.
2. Geeniekspressiotietojen korrelaatio histopatologian kanssa.
3. Ehdokasilmentymisluokittajan luominen melanooman diagnosointiin.

Teipin poistaminen (kaupallinen menetelmä RNA:n talteenottamiseksi nimellä Epidermal Genetic Information Retrieval tai EGIR™) on ei-invasiivinen menetelmä, joka mahdollistaa ylemmän orvaskeden sisältävien ja siihen liittyvien solujen talteenoton [4]. Morhenn et al [4] osoittivat ei-invasiivisen näytteenoton toteutettavuuden ihmisen epidermiksestä peräkkäisellä teipin poistamisella. Heidän työnsä osoitti, että ihon irrotus teipillä tuotti riittävästi RNA:ta analysoitavaksi ribonukleaasisuojausmäärityksellä spesifisten RNA-lajien havaitsemiseksi, mukaan lukien sellaiset, joiden tiedetään olevan vähäisessä määrin.

4. Terapeuttisesti poistettu kudos kerätään

Teipin poistaminen suoritetaan ennen kaikkia biopsiatoimenpiteitä. Teippi kiinnitetään paikalle ja hierotaan reippaasti tussin tai muovisen koeputken tylpällä pyöristetyllä päässä pyörivin liikkein. Vähintään 15 ympyräliikettä on suoritettava ennen nauhan poistamista. Sen tosiasian huomioon ottamiseksi, että monet kohdat ovat pienempiä kuin nauhan halkaisija, kiinnitetään teippi vain vaurio- tai kontrollikohtaan, ei ympäröivään normaaliin orvasketeen. Leesion raja rajataan teippiin kirurgisella merkillä; kun teippejä käsitellään RNA:n uuttamista varten, merkintä mahdollistaa teipin poistamisen, joka ei koskettanut vauriota (ja jossa saattaa olla normaali orvaskesi). Yhteensä 4 nauhaa käytetään näytteenottoon kohdasta, jonka halkaisija on vähintään 6 mm. DTI:ltä saadut alustavat tiedot osoittavat, että halkaisijaltaan alle 6 mm:n vauriot voivat vaatia jopa 8 teippiä RNA:n talteenottamiseksi. Teipin poisto tehdään myös yhdelle normaalilta näyttävälle ihoalueelle (mieluiten yläselän tai mastoidin prosessille) sekä yhdelle hyvänlaatuiselle nevuselle (jos saatavilla) käytettäväksi vertailuna. Näytteenoton jälkeen nauhat säilytetään -20 oC:ssa tai sen alle. Nauhat toimitetaan DTI:lle kuivajäässä pikapostina analysointia varten.

Biopsia Kun teipin poistaminen on suoritettu loppuun, koko leesio leikataan kirurgisesti normaalin kliinisen käytännön mukaisesti. Biopsia on standardi hoitomenettely, joka suoritetaan tutkimuksesta riippumatta. Kaikki poistetut kudokset kiinnitetään formaliiniin ja lähetetään histopatologiseen laboratorioon, jossa ne upotetaan parafiiniin ja leikataan histopatologista analyysiä varten. Patologian tulokset kerätään diagnoosin erottamiseksi. Kohteen patologiaraportit tunnistetaan määritetyillä yksilöllisillä koehenkilötunnisteilla ennen käyttöä tutkimuksessa potilaan identiteetin suojaamiseksi.