피부 세포의 발현 프로파일링 및 비침습적 샘플링을 이용한 흑색종의 조기 진단 (DermTech)

이것은 Derm Tech(DTI) International이 후원하는 다기관 연구입니다.

연구의 특정 목표

본 연구는 초기 흑색종으로 의심되는 색소성 피부 병변에서 표면 세포를 포획하기 위해 비침습적 방법을 사용할 것을 제안합니다. 이 비침습적 "생검" 기술은 DermTech International에서 개발하고 특허를 받았습니다. 이 방법으로 캡처한 피부 세포의 RNA는 병변의 특성을 진단하기 위해 프로파일링됩니다(즉, 악성 흑색종 여부). 이 제안의 성공적인 결과는 초기 단계의 흑색종을 식별하기 위한 유전자 발현 프로필을 기반으로 후보 비침습적 진단 분석을 생성할 것입니다. 이 분석 및 특히 진단 유전자 발현 프로필은 프로필이 검증되어야 하기 때문에 후보로 간주됩니다(즉, 더 큰 규모의 임상 시험에서 진단적임이 입증됨). 이차 결과에는 다양한 색소 피부 병변의 진단 및 예후를 위한 테스트가 포함될 수 있습니다.

특정 목표 1: 색소성 피부 병변의 샘플 세트를 생성합니다. 각 샘플은 다음으로 구성됩니다.

1. 병변 위에 있는 표면 표피를 테이프로 스트리핑하여 RNA를 회수했습니다(테이프 스트리핑은 대조군으로서 정상 피부 영역 및 양성 모반에서 RNA를 회수하는 데에도 사용될 것입니다).
2. 동일한 병변의 표준 생검 및 조직학 및 진단 동반. 생검은 테이프 스트리핑 후에 취해지고 표준 조직병리학적 분석을 받게 되며, 이는 "골드 스탠다드" 진단을 제공할 것입니다. 그런 다음 이러한 진단을 특정에서 생성된 데이터와 연관시킬 수 있습니다.

목표 2.

이 특정 목표는 세 가지 개별 목표로 구성됩니다.

1. DNA 마이크로어레이에 의한 선택된 병변 RNA 샘플의 분석.
2. 유전자 발현 데이터와 조직병리학의 상관관계.
3. 흑색종 진단을 위한 후보 발현 분류기 생성.

테이프 스트리핑(Epidermal Genetic Information Retrieval 또는 EGIR™과 같은 RNA 복구 방법으로 상용화됨)은 상부 표피를 포함하고 관련된 세포를 복구할 수 있는 비침습적 방법입니다[4]. Morhenn et al[4]은 순차 접착 테이프 스트리핑에 의한 인간 표피의 비침습적 샘플링 가능성을 보여주었습니다. 그들의 작업은 피부의 테이프 스트리핑이 풍부하지 않은 것으로 알려진 것을 포함하여 특정 RNA 종을 검출하기 위해 리보뉴클레아제 보호 분석에 의한 분석을 위한 충분한 RNA를 산출한다는 것을 보여주었습니다.

4. 치료적으로 제거된 조직을 수집합니다.

테이프 스트리핑 절차는 모든 생검 절차 전에 수행됩니다. 테이프를 부위에 붙이고 마커 또는 플라스틱 시험관의 뭉툭하고 둥근 끝으로 원을 그리며 빠르게 문지릅니다. 테이프를 제거하기 전에 최소 15회 원형 동작을 완료해야 합니다. 많은 부위가 테이프의 직경보다 작다는 사실을 수용하기 위해 테이프를 주변 정상 표피가 아닌 병변 또는 제어 부위에만 적용하도록 주의를 기울일 것입니다. 병변의 경계는 외과용 마커로 테이프에 표시됩니다. 테이프가 RNA 추출을 위해 처리될 때 마킹을 통해 병변과 접촉하지 않은(및 정상 표피를 포함할 수 있는) 테이프를 제거할 수 있습니다. 총 4개의 테이프를 사용하여 직경이 6mm 이상인 부위를 샘플링합니다. DTI에서 얻은 예비 데이터에 따르면 직경 6mm 미만의 병변은 RNA를 복구하기 위해 최대 8개의 테이프가 필요할 수 있습니다. 테이프 스트리핑은 하나의 정상적으로 보이는 피부 영역(바람직하게는 등 상부 또는 유양 돌기)과 하나의 양성 모반(가능한 경우)에 수행되어 비교용으로 사용됩니다. 샘플링 후 테이프는 -20oC 이하에서 보관됩니다. 테이프는 분석을 위해 속달 우편으로 드라이아이스에 담아 DTI로 배송됩니다.

생검 테이프 스트리핑 절차가 완료된 후 전체 병변은 표준 임상 실습에 따라 외과적으로 절제됩니다. 생검은 연구와 관계없이 수행되는 치료 절차의 표준입니다. 제거된 모든 조직은 포르말린에 고정되어 조직병리학 실험실로 보내지며, 그곳에서 조직병리학 분석을 위해 파라핀에 포매되고 절단됩니다. 진단을 구별하기 위해 병리학 결과가 수집됩니다. 피험자 병리 보고서는 피험자 신원을 보호하기 위해 연구에 사용하기 전에 할당된 고유한 피험자 식별자로 식별됩니다.