Wczesna diagnostyka czerniaka za pomocą profilowania ekspresji i nieinwazyjnego pobierania próbek komórek skóry (DermTech)

Jest to badanie wieloośrodkowe, sponsorowane przez Derm Tech (DTI) International.

Szczegółowe cele badania

To badanie naukowe proponuje zastosowanie nieinwazyjnej metody do wychwytywania powierzchownych komórek na pigmentowanych zmianach skórnych, co do których podejrzewa się, że są wczesnymi czerniakami. Ta nieinwazyjna technologia „biopsji” została opracowana i opatentowana przez DermTech International. RNA w komórkach skóry uchwyconych tą metodą będzie profilowane w celu zdiagnozowania charakteru zmiany (tj. czerniak złośliwy czy nie). Pomyślny wynik tej propozycji umożliwiłby stworzenie potencjalnego nieinwazyjnego testu diagnostycznego opartego na profilu ekspresji genów do identyfikacji wczesnych stadiów czerniaka. Ten test, a w szczególności diagnostyczny profil ekspresji genów, uważa się za kandydata, ponieważ profil musiałby zostać zweryfikowany (tj. okazały się diagnostyczne) w większych badaniach klinicznych. Wyniki drugorzędne mogą obejmować testy do diagnozowania i prognozowania różnych barwnikowych zmian skórnych.

Cel szczegółowy 1: Stworzenie zestawu prób pigmentowych zmian skórnych. Każda próbka składająca się z:

1. RNA odzyskane przez zdzieranie taśmy z powierzchownego naskórka pokrywającego zmianę (zdejmowanie taśmy będzie również stosowane do odzyskiwania RNA z normalnych obszarów skóry i łagodnych znamion jako kontroli).
2. Standardowa biopsja tej samej zmiany oraz towarzysząca histologia i diagnoza. Biopsje byłyby pobierane po usunięciu taśmy i poddawane standardowej analizie histopatologicznej, która zapewniłaby diagnozę „złotego standardu”. Diagnozy te można następnie skorelować z danymi wygenerowanymi w Specyfice

Cel 2.

Ten cel szczegółowy składa się z trzech celów indywidualnych:

1. Analiza wybranych próbek RNA zmian chorobowych za pomocą mikromacierzy DNA.
2. Korelacja danych dotyczących ekspresji genów z histopatologią.
3. Stworzenie potencjalnego klasyfikatora ekspresji do diagnostyki czerniaka.

Tape stripping (skomercjalizowany jako metoda odzyskiwania RNA jako Epidermal Genetic Information Retrieval lub EGIR™) jest nieinwazyjną metodą pozwalającą na odzyskanie komórek tworzących i związanych z górną warstwą naskórka [4]. Możliwości nieinwazyjnego pobierania próbek ludzkiego naskórka poprzez sekwencyjne usuwanie taśmy klejącej wykazali Morhenn i wsp. [4]. Ich praca wykazała, że ​​usuwanie taśmy ze skóry dało wystarczającą ilość RNA do analizy za pomocą testu ochrony rybonukleazy w celu wykrycia określonych gatunków RNA, w tym tych, o których wiadomo, że występują w niskiej liczebności.

4. Pobrana zostanie terapeutycznie tkanka

Procedura zdejmowania taśmy zostanie przeprowadzona przed wszystkimi procedurami biopsji. Taśma zostanie nałożona na miejsce i energicznie pocierana tępym zaokrąglonym końcem markera lub plastikowej probówki ruchem okrężnym. Przed usunięciem taśmy należy wykonać co najmniej 15 ruchów okrężnych. Aby uwzględnić fakt, że wiele miejsc będzie mniejszych niż średnica taśmy, należy zachować ostrożność, aby przykleić taśmę tylko na zmianę lub miejsce kontrolne, a nie na otaczający normalny naskórek. Granica zmiany zostanie zaznaczona na taśmie markerem chirurgicznym; kiedy taśmy są przetwarzane w celu ekstrakcji RNA, znakowanie pozwoli usunąć taśmę, która nie miała kontaktu ze zmianą chorobową (i która może zawierać normalny naskórek). W sumie 4 taśmy zostaną użyte do pobrania próbki z miejsca o średnicy większej lub równej 6 mm. Wstępne dane uzyskane z DTI pokazują, że zmiany o średnicy mniejszej niż 6 mm mogą wymagać nawet 8 taśm do odzyskania RNA. Zdjęcie taśmy zostanie również wykonane na jednym normalnie wyglądającym obszarze skóry (najlepiej na górnej części pleców lub wyrostku sutkowatym), a także na jednym łagodnym znamię (jeśli jest dostępne) do wykorzystania jako porównanie. Po pobraniu próbek taśmy będą przechowywane w temperaturze -20oC lub niższej. Taśmy zostaną wysłane do DTI w suchym lodzie, pocztą ekspresową, do analizy.

Biopsja Po zakończeniu procedury ściągania taśmy, cała zmiana zostanie usunięta chirurgicznie zgodnie ze standardową praktyką kliniczną. Biopsja jest standardową procedurą opieki, która byłaby wykonywana niezależnie od badań. Wszystkie usunięte tkanki są utrwalane w formalinie i wysyłane do laboratorium histopatologicznego, gdzie są zatapiane w parafinie i cięte na skrawki do analizy histopatologicznej. Wyniki patologii zostaną zebrane w celu postawienia diagnozy. Raporty patologiczne uczestników będą identyfikowane za pomocą przypisanych unikalnych identyfikatorów uczestników przed użyciem w badaniu w celu ochrony tożsamości uczestników.