Ранняя диагностика меланомы с использованием профиля экспрессии и неинвазивного забора образцов клеток кожи (DermTech)

Это многоцентровое исследование, спонсируемое Derm Tech (DTI) International.

Конкретные цели исследования

В этом исследовании предлагается использовать неинвазивный метод для захвата поверхностных клеток на пигментных поражениях кожи, которые подозреваются в ранней стадии меланомы. Эта неинвазивная технология «биопсии» была разработана и запатентована компанией DermTech International. РНК в клетках кожи, захваченных этим методом, будет профилирована для диагностики характера поражения (т.е. злокачественная меланома или нет). Успешный результат этого предложения позволит создать неинвазивный диагностический анализ-кандидат на основе профиля экспрессии генов для выявления меланомы на ранней стадии. Этот анализ и, более конкретно, профиль экспрессии диагностического гена считаются кандидатами, поскольку профиль должен быть подтвержден (т.е. оказались диагностическими) в более крупных клинических испытаниях. Вторичные результаты могут включать тесты для диагностики и прогнозирования различных пигментных поражений кожи.

Конкретная цель 1: Создать образец набора пигментных поражений кожи. Каждый образец состоит из:

1. РНК, выделенная путем сдирания лентой поверхностного эпидермиса, покрывающего поражение (снятие лентой также будет использоваться для выделения РНК из нормальных участков кожи и доброкачественных невусов в качестве контроля).
2. Стандартная биопсия того же поражения с сопутствующей гистологией и диагнозом. Биопсии будут взяты после снятия ленты и подвергнуты стандартному гистопатологическому анализу, который обеспечит «золотой стандарт» диагноза. Затем эти диагнозы можно было бы сопоставить с данными, сгенерированными в разделе «Специфические исследования».

Цель 2.

Эта конкретная цель состоит из трех отдельных целей:

1. Анализ выбранных образцов РНК поражений с помощью ДНК-микрочипа.
2. Корреляция данных экспрессии генов с гистопатологией.
3. Создание классификатора экспрессии-кандидата для диагностики меланомы.

Ленточная зачистка (коммерциализированная как метод восстановления РНК под названием Epidermal Genetic Information Retrieval или EGIR™) является неинвазивным методом, позволяющим извлекать клетки, содержащие и связанные с верхним эпидермисом [4]. Возможность неинвазивного забора образцов эпидермиса человека путем последовательного снятия пластыря была показана Morhenn et al [4]. Их работа показала, что снятие кожи лентой дает достаточное количество РНК для анализа с помощью анализа защиты от рибонуклеазы для обнаружения определенных видов РНК, в том числе тех, которые, как известно, встречаются в небольшом количестве.

4. Будет собрана ткань, удаленная терапевтически.

Перед всеми процедурами биопсии будет выполняться процедура зачистки лентой. Лента будет наложена на участок и быстро протерта тупым закругленным концом маркера или пластиковой пробирки круговыми движениями. Перед снятием ленты необходимо совершить не менее 15 круговых движений. Чтобы учесть тот факт, что многие участки будут меньше диаметра ленты, необходимо накладывать ленту только на пораженный или контрольный участок, а не на окружающий нормальный эпидермис. Границы поражения будут обозначены на ленте хирургическим маркером; когда ленты обрабатываются для выделения РНК, маркировка позволит удалить ленту, которая не контактировала с поражением (и которая может содержать нормальный эпидермис). Всего будет использовано 4 ленты для отбора проб с участка диаметром более или равного 6 мм. Предварительные данные, полученные из DTI, показывают, что при поражениях диаметром менее 6 мм может потребоваться до 8 лент для восстановления РНК. Снятие пластыря также будет выполнено на одном участке кожи с нормальным внешним видом (предпочтительно на верхней части спины или сосцевидном отростке), а также на одном доброкачественном невусе (при наличии) для сравнения. После отбора проб ленты будут храниться при температуре -20°C или ниже. Ленты будут отправлены в DTI на сухом льду экспресс-почтой для анализа.

Биопсия После того, как процедура зачистки будет завершена, весь очаг будет иссечен хирургическим путем в соответствии со стандартной клинической практикой. Биопсия является стандартной процедурой лечения, которая проводится независимо от исследования. Все удаленные ткани фиксируют в формалине и отправляют в гистопатологическую лабораторию, где их заливают парафином и делают срезы для гистопатологического анализа. Результаты патологии будут собраны для дифференциального диагноза. Отчеты о патологии субъектов будут идентифицироваться с присвоенными уникальными идентификаторами субъектов перед использованием в исследовании для защиты личности субъекта.