発現プロファイリングと皮膚細胞の非侵襲的サンプリングを使用した黒色腫の早期診断 (DermTech)

これは、Derm Tech (DTI) International の後援による多施設共同研究です。

研究の具体的な目的

この研究では、非侵襲的方法を使用して、初期黒色腫が疑われる色素沈着した皮膚病変の表在細胞を捕捉することを提案しています。 この非侵襲的な「生検」技術は、DermTech International によって開発され、特許を取得しています。 この方法で捕捉された皮膚細胞内の RNA は、病変の性質（すなわち、 悪性黒色腫かどうか）。 この提案が成功すれば、初期段階の黒色腫を同定するための遺伝子発現プロファイルに基づく非侵襲的診断アッセイの候補が作成されることになる。 このアッセイ、特に診断用遺伝子発現プロファイルは、プロファイルを検証する必要があるため、候補と考えられます（つまり、プロファイルが検証される必要があるため）。 大規模な臨床試験で診断効果があることが証明されています。 副次的結果には、さまざまな色素沈着した皮膚病変の診断と予後を診断するための検査が含まれる可能性があります。

具体的な目的 1: 色素沈着した皮膚病変のサンプル セットを作成すること。 各サンプルは次の内容で構成されます。

1. 病変を覆う表面表皮をテープ剥離することによってRNAを回収した(テープ剥離は、対照として正常な皮膚領域および良性母斑からRNAを回収するためにも使用される)。
2. 同じ病変の標準的な生検と、それに付随する組織像および診断。 生検はテープ剥離後に採取され、「ゴールドスタンダード」診断を提供する標準的な病理組織学的分析を受けることになる。 これらの診断は、特定のデータで生成されたデータと関連付けることができます。

目標2.

この具体的な目標は、次の 3 つの個別の目標で構成されています。

1. DNA マイクロアレイによる選択された病変 RNA サンプルの分析。
2. 遺伝子発現データと組織病理学の相関関係。
3. 黒色腫の診断のための候補発現分類子の作成。

テープストリッピング (Epidermal Genetic Information Retrieval または EGIR™ として RNA 回収方法として商品化されている) は、上部表皮を構成する、および上部表皮に関連する細胞の回収を可能にする非侵襲的方法です [4]。 連続的な粘着テープ剥離によるヒト表皮の非侵襲的サンプリングの実現可能性は、Morhenn et al [4] によって示されました。 彼らの研究は、皮膚のテープ剥離により、存在量が少ないことが知られているものを含む特定の RNA 種を検出するためのリボヌクレアーゼ保護アッセイによる分析に十分な RNA が得られることを示しました。

4. 治療的に除去された組織が収集されます

テープストリッピング手順は、すべての生検手順の前に実行されます。 テープを患部に貼り、マーカーまたはプラスチック試験管の鈍く丸い端で円を描くように勢いよくこすります。 テープを取り外す前に、少なくとも 15 回の円運動を完了する必要があります。 多くの部位がテープの直径よりも小さいという事実に対応するために、周囲の正常な表皮ではなく、病変部位または対照部位にのみテープを貼付するように注意が払われます。 病変の境界は、外科用マーカーを使用してテープ上で境界が定められます。テープが RNA 抽出のために処理されるとき、マーキングにより、病変に接触しなかった (正常な表皮が存在する可能性がある) テープを取り除くことができます。 合計 4 本のテープを使用して、直径 6 mm 以上の部位をサンプリングします。 DTI から得られた予備データによると、直径 6 mm 未満の病変では RNA を回収するのに最大 8 本のテープが必要になる可能性があります。 テープストリッピングは、比較として使用するために、1 つの正常に見える皮膚領域 (背中上部または乳突突起が望ましい) と 1 つの良性母斑 (利用可能な場合) にも実行されます。 サンプリング後、テープは-20℃以下で保管されます。 テープは分析のためにドライアイスに入れて速達で DTI に発送されます。

生検 テープ剥離手順が完了した後、標準的な臨床実践に従って病変全体が外科的に切除されます。 生検は、研究に関係なく行われる標準的な治療手順です。 切除されたすべての組織はホルマリンで固定され、病理組織検査室に送られ、そこでパラフィンに包埋され、組織病理学的分析のために切片化されます。 鑑別診断のために病理結果が収集されます。 被験者の病理レポートは、被験者の身元を保護するために研究で使用する前に、割り当てられた固有の被験者識別子で識別されます。