Tidlig diagnose af melanom ved brug af udtryksprofilering og ikke-invasiv prøveudtagning af hudceller (DermTech)

Dette er en multicenterundersøgelse, sponsoreret af Derm Tech (DTI) International.

Specifikke mål med undersøgelsen

Denne forskningsundersøgelse foreslår at bruge en ikke-invasiv metode til at fange overfladiske celler på pigmenterede hudlæsioner, der mistænkes for at være tidlige melanomer. Denne ikke-invasive "biopsi"-teknologi er udviklet og patenteret af DermTech International. RNA i hudceller fanget ved denne metode vil blive profileret for at diagnosticere arten af ​​læsionen (dvs. malignt melanom eller ej). Et vellykket resultat af dette forslag ville skabe en kandidat, ikke-invasiv diagnostisk analyse baseret på en genekspressionsprofil til identifikation af melanomer i tidligt stadium. Dette assay og mere specifikt den diagnostiske genekspressionsprofil betragtes som kandidat, fordi profilen skal valideres (dvs. bevist at være diagnostisk) i større kliniske forsøg. Sekundære resultater kunne omfatte test til diagnose og prognose af en række pigmenterede hudlæsioner.

Specifikt mål 1: At skabe et prøvesæt af pigmenterede hudlæsioner. Hver prøve består af:

1. RNA udvundet ved tape stripning af den overfladiske epidermis, der ligger over læsionen (tape stripping vil også blive brugt til at genvinde RNA fra normale hudområder og benigne nevi som kontroller).
2. En standardbiopsi af den samme læsion og ledsagende histologi og diagnose. Biopsier ville blive taget efter tape stripning og udsat for standard histopatologisk analyse, som ville give en "guld standard" diagnose. Disse diagnoser kan derefter korreleres med dataene genereret i Specific

Mål 2.

Dette specifikke mål er sammensat af tre individuelle mål:

1. Analyse af udvalgte læsions-RNA-prøver ved hjælp af DNA-mikroarray.
2. Korrelation af genekspressionsdata med histopatologi.
3. Oprettelse af en kandidatekspressionsklassifikator til diagnosticering af melanom.

Tape stripping (kommercialiseret som en metode til RNA-gendannelse som Epidermal Genetic Information Retrieval eller EGIR™) er en ikke-invasiv metode, der tillader genopretning af celler, der omfatter og er forbundet med den øvre epidermis [4]. Gennemførligheden af ​​ikke-invasiv prøvetagning af human epidermis ved sekventiel tapestripping blev vist af Morhenn et al [4]. Deres arbejde viste, at tape-stripning af huden gav tilstrækkeligt RNA til analyse ved ribonukleasebeskyttelsesassay til at påvise specifikke RNA-arter, inklusive dem, der vides at have lav forekomst.

4. Terapeutisk fjernet væv vil blive opsamlet

Tape-stripping procedure vil blive udført før alle biopsi procedurer. Tapen påføres stedet og gnides hurtigt med den stumpe afrundede ende af en markør eller plastikreagensglas i en cirkulær bevægelse. Der skal udføres minimum 15 cirkulære bevægelser, før tapen fjernes. For at imødekomme det faktum, at mange steder vil være mindre end diameteren af ​​tapen, vil man sørge for kun at påføre tapen på læsionen eller kontrolstedet og ikke på den omgivende normale epidermis. Grænsen af ​​læsionen vil blive afgrænset på tapen med en kirurgisk markør; når båndene behandles til RNA-ekstraktion, vil mærkningen tillade fjernelse af tape, der ikke kom i kontakt med læsionen (og som kan rumme normal epidermis). I alt 4 tapes vil blive brugt til at prøve et sted, der er større end eller lig med 6 mm i diameter. Foreløbige data opnået fra DTI viser, at læsioner med en diameter på mindre end 6 mm kan kræve op til 8 tapes for at genvinde RNA. Tape stripping vil også blive udført på et normalt udseende hudområde (helst; øvre ryg eller mastoid-proces) samt en godartet nævus (hvis tilgængelig) til brug som sammenligning. Efter prøveudtagning vil båndene blive opbevaret ved -20oC eller derunder. Båndene vil blive sendt til DTI på tøris, med eksprespost, til analyse.

Biopsi Efter tape-stripping proceduren er afsluttet, vil hele læsionen blive skåret kirurgisk ud i henhold til standard klinisk praksis. Biopsien er en standardbehandlingsprocedure, der vil blive udført uanset forskningen. Alt fjernet væv fikseres i formalin og sendes til et histopatologisk laboratorium, hvor det indlejres i paraffin og snittes til histopatologisk analyse. Patologiske resultater vil blive indsamlet for at skelne diagnose. Emnets patologirapporter vil blive identificeret med de tildelte unikke emneidentifikatorer før brug i undersøgelsen for at beskytte forsøgspersonens identitet.