Komplexní analýza profilu genové mutace u čínských pacientů s NSCLC pomocí sekvenování nové generace
Tianjin Medical University Cancer Institute and Hospital
V posledních letech se vývoj rakoviny plic zlepšil z patologické úrovně na úroveň molekulární. Výzkum ukázal, že u nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC) existuje mnoho genových mutací a některé aktivační mutace se staly ohniskem v oblasti cílové terapie. S rozvojem cíleného výzkumu léčiv bude molekulární klasifikace NSCLC stále důležitější. Ale velké množství klinických dat ukázalo, že genová mutace u čínských pacientů s NSCLC se významně liší od kavkazské populace, což naznačuje, že je nutné identifikovat profil genových mutací u čínských pacientů s NSCLC.
Šest set vzorků parafínové tkáně NSCLC bylo odebráno během operace z nemocnice Tianjin Cancer v letech 2009-2012, které zahrnovaly spinocelulární karcinom plic a adenokarcinom. Cílová oblast 295 genů, včetně řídících genů rakoviny plic, důležitých genů signálních drah a genů lékové rezistence, bude detekována sekvenováním nové generace hluboko (průměrně 1000X). Identifikujeme profil genových mutací u pacientů s čínským spinocelulárním karcinomem a adenokarcinomem plic. Cílem je nalézt související predikční a prognostické faktory analýzou vztahu mezi těmito genovými mutacemi a klinickými charakteristikami a následnou léčbou.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Cílem této studie je vytvořit profil genových mutací NSCLC v Číně a najít související korelaci mezi panelem genových mutací a klinickým výsledkem.
Během operace v nemocnici Tianjin Cancer v letech 2009-2012 bude odebráno přibližně 600 chirurgických vzorků tkáně, včetně spinocelulárního karcinomu plic a adenokarcinomu. Cílová oblast 295 genů, včetně řídících genů rakoviny plic, důležitých genů signálních drah a genů lékové rezistence, bude detekována sekvenováním nové generace (NGS) hluboko (průměrně 1000X). Tyto geny byly vybrány z Mutace mohou řídit léčbu nebo jako prognostické faktory ve směrnici NCCN/FDA/CFDA, související mutace ve studiích fáze II/III a NCCN/FDA/CFDA schválené u nádorů jiného typu a související mutace ve fázi I nebo preklinické studií a nemohou vést léčbu ani jako prognostické faktory.
Všechny mutace detekované v 600 vzorcích jsou shrnuty pro statistiku, přičemž se vypočítá podíl mutací v celkové populaci. Shluková analýza se provádí podle biologických drah souvisejících s hlavními hnacími geny, korelace mezi daty genových mutací a kategorickými klinickými proměnnými se provádí pomocí Fisher's Exact Test. Log-rank test se použije k prozkoumání vztahu mezi klinickými výsledky (DFS a OS) a genovými mutacemi (přítomnými nebo nepřítomnými) nebo každým z klinických znaků (pohlaví, věk, kouření, staging TNM, histologie, lokalizace tumoru, recidiva, počet metastáz v lymfatických uzlinách, velikost tumoru, pooperační adjuvantní léčba, DFS a OS). Poté bude zkonstruován Coxův model proporcionálních rizik pro vyhodnocení účinku více proměnných (genomických a klinických znaků) na DFS, respektive OS. K úpravě p-hodnoty a výpočtu statistických rozdílů se používá metoda Benjamini-Hochberg false discovery rate (FDR). Všechny hodnoty p byly oboustranné a P<0,05 bylo považováno za významné.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- DOSPĚLÝ
- OLDER_ADULT
- DÍTĚ
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti zapsaní od roku 2009 do roku 2012. Histologicky potvrzený NSCLC.
Kritéria vyloučení:
- Před operací podstoupil jakoukoli systémovou nebo lokální léčbu. Spolu s dalšími zhoubnými nádory. Chybí neporušené následné informace.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Korelace mezi genovými mutacemi a přežitím
Časové okno: Prosince 2017
|
Log-rank test se použije k prozkoumání vztahu mezi klinickými výsledky (DFS a OS) a genovými mutacemi (přítomnými nebo nepřítomnými) nebo každým z klinických znaků (pohlaví, věk, kouření, staging TNM, histologie, lokalizace tumoru, recidiva, počet metastáz v lymfatických uzlinách, velikost tumoru, pooperační adjuvantní léčba, DFS a OS).
Poté bude zkonstruován Coxův model proporcionálních rizik pro vyhodnocení účinku více proměnných (genomických a klinických znaků) na DFS, respektive OS.
K úpravě p-hodnoty a výpočtu statistických rozdílů se používá metoda Benjamini-Hochberg false discovery rate (FDR).
Všechny hodnoty p byly oboustranné a P<0,05 bylo považováno za významné.
|
Prosince 2017
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Korelace mezi genovými mutacemi a klinickými parametry.
Časové okno: Prosince 2017
|
Korelace mezi daty genových mutací a kategorickými klinickými proměnnými se provádí Fisherovým exaktním testem.
|
Prosince 2017
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Changli Wang, Prof., Tianjin Medical University Cancer Institute & Hospital
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (AKTUÁLNÍ)
Primární dokončení (AKTUÁLNÍ)
Dokončení studie (AKTUÁLNÍ)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další identifikační čísla studie
- E2016060A
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .