Omfattande analys av genmutationsprofil hos kinesiska NSCLC-patienter genom nästa generations sekvensering

Syftet med denna studie är att bygga NSCLC-genmutationsprofil i Kina och hitta relaterad korrelation mellan genmutationspanel och kliniskt utfall.

Ungefär 600 kirurgiska vävnadsprover kommer att samlas in under operationen på Tianjins cancersjukhus 2009-2012, inklusive skivepitelcancer i lungor och adenokarcinom. Målområdet för 295 gener, inklusive gener för lungcancerdrivning, viktiga signalvägsgener, läkemedelsresistensgener kommer att upptäckas genom New generation Sequencing (NGS) djup (genomsnitt 1000X). Dessa gener valdes från Mutationer kan vägleda behandling eller som prognosfaktorer i NCCN/FDA/CFDA-riktlinje, relaterade mutationer i fas II/III-studier och NCCN/FDA/CFDA godkända i andra typer av tumörer och relaterade mutationer i fas I eller preklinisk studier och kan inte vägleda behandling eller som prognosfaktorer.

Alla mutationer som upptäckts i 600 prover sammanfattas för statistik, vilket beräknar mutationsandelen i den totala populationen. Klustringsanalys utförs enligt de huvudsakliga drivgenerna relaterade biologiska vägar, korrelation mellan genmutationsdata och kategoriska kliniska variabler utförs av Fishers Exact Test. Log-rank-testet kommer att användas för att utforska sambandet mellan de kliniska resultaten (DFS respektive OS) och genmutationer (närvarande eller frånvarande) eller var och en av de kliniska egenskaperna (kön, ålder, rökstatus, TNM-stadium, histologi, tumörlokalisering, recidiv, antal lymfkörtelmetastaser, tumörstorlek, postoperativ adjuvant behandling, DFS och OS). Sedan kommer en Cox Proportional Hazards-modell att konstrueras för att utvärdera effekten av flera variabler (genomiska och kliniska egenskaper) på DFS respektive OS. Benjamini-Hochbergs metod för falsk upptäcktshastighet (FDR) används för att justera p-värdet och beräkna de statistiska skillnaderna. Alla p-värden var tvåsidiga och P<0,05 antogs vara signifikant.