Omfattende analyse av genmutasjonsprofil hos kinesiske NSCLC-pasienter ved neste generasjons sekvensering

Målet med denne studien er å bygge NSCLC-genmutasjonsprofil i Kina og finne relatert korrelasjon mellom genmutasjonspanel og klinisk utfall.

Omtrent 600 kirurgiske vevsprøver vil bli samlet inn under operasjonen i Tianjin Cancer sykehus fra 2009-2012, inkludert plateepitelkarsinom og adenokarsinom. Målområdet til 295 gener, inkludert lungekreftdrivgener, viktige signalveigener, medikamentresistensgener vil bli oppdaget av New Generation Sequencing (NGS) dyp (gjennomsnitt 1000X). Disse genene ble valgt fra Mutasjoner kan veilede behandling eller som prognosefaktorer i NCCN/FDA/CFDA-retningslinjer, relaterte mutasjoner i fase II/III-studier og NCCN/FDA/CFDA godkjent i annen type svulster og relaterte mutasjoner i fase I eller pre-klinisk studier og kan ikke veilede behandling eller som prognosefaktorer.

Alle mutasjoner påvist i 600 prøver er oppsummert for statistikk, og beregner mutasjonsandelen i den totale populasjonen. Klyngeanalyse utføres i henhold til hoveddrivgener relaterte biologiske veier, korrelasjon mellom genmutasjonsdata og kategoriske kliniske variabler utføres av Fishers Exact Test. Log-rank-testen vil bli brukt til å utforske forholdet mellom de kliniske resultatene (henholdsvis DFS og OS) og genmutasjoner (tilstede eller fraværende) eller hvert av de kliniske trekkene (kjønn, alder, røykestatus, TNM-stadie, histologi, tumorlokalisering, residiv, antall lymfeknutemetastaser, tumorstørrelse, postoperativ adjuvant behandling, DFS og OS). Deretter vil en Cox Proportional Hazards-modell bli konstruert for å evaluere effekten av flere variabler (genomiske og kliniske egenskaper) på henholdsvis DFS og OS. Benjamini-Hochbergs metode for falsk oppdagelsesrate (FDR) brukes til å justere p-verdien og beregne de statistiske forskjellene. Alle p-verdier var tosidige, og P<0,05 ble antatt å være signifikant.