Genomická a proteomická studie Richterova syndromu (CGPSR) (CGPSR)
23. března 2023 aktualizováno: Central Hospital, Nancy, France
Genomická a proteomická studie Richterova syndromu
Biologická studie Richterova syndromu (RS), agresivního lymfomu, který vzniká z chronické lymfocytární leukémie (CLL). RS se projevuje stejným histologickým aspektem jako primitivní difuzní velký B-buněčný lymfom (DLBCL), ale je spojen se špatnou prognózou kvůli chemorefrakternosti.
Tato studie se zaměřuje na pochopení biologických determinant rezistence na chemoterapii u Richterova syndromu.
Přehled studie
Postavení
Nábor
Podmínky
Detailní popis
S pomocí Francouzské národní výzkumné skupiny pro CLL (FILO / Francouzská organizace pro inovativní leukémii) v současné době vyšetřovatelé shromažďují čerstvé zmrazené buněčné pelety ve stadiu CLL a biopsie lymfatických uzlin v Richterově stadiu. Výzkumníci také shromáždili biopsie lymfatických uzlin z DLBCL jako referenční skupinu.
Výzkumníci provedou genomické a proteomické srovnávací studie mezi CLL a Richterem, stejně jako mezi Richterem a primitivním DLBCL, aby porozuměli biologickým determinantům klonální evoluce a chemorefrakternosti Richterova syndromu.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Očekávaný)
170
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: Julien Broseus, MD, PhD
- Telefonní číslo: + 33 (0)3 83 15 49 14
- E-mail: j.broseus@chru-nancy.fr
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Véronique Saunier
- Telefonní číslo: + 33 (0)3 83 15 54 58
- E-mail: v.saunier@chru-nancy.fr
Studijní místa
-
-
-
Nancy, Francie, 54035
- Nábor
- CHRU de Nancy
-
Kontakt:
- Véronique SAUNIER
- Telefonní číslo: +33 (0)3 83 15 54 58
- E-mail: v.saunier@chru-nancy.fr
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Julien Broséus, MD, PhD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Pierre Feugier, MD, PhD
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ano
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
- Diagnóza difuzního velkého B-lymfomu vznikajícího v souvislosti s chronickou lymfocytární leukémií (skupina 1).
- Diagnóza difuzního velkého B-lymfomu de novo (skupina 2).
- Diagnóza difuzního velkobuněčného B-lymfomu vznikajícího v souvislosti s malobuněčným lymfomem, s výjimkou CLL (skupina 3).
- Pacienti, kteří měli prospěch z diagnostické biopsie lymfatických uzlin, která neodhalila žádné nádorové postižení (primitivní nebo metastatické) (skupina 4).
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Diagnóza difuzního velkobuněčného B-lymfomu vzniklého v souvislosti s chronickou lymfocytární leukémií (skupina 1) nebo diagnóza primitivního difuzního velkobuněčného B-lymfomu (skupina 2) nebo diagnóza difuzního velkobuněčného B-lymfomu vzniklého v kontext malobuněčného lymfomu, s výjimkou CLL (skupina 3), nebo prospěch z diagnostické biopsie lymfatických uzlin, která neodhalila žádné postižení nádoru (primitivní nebo metastatické) (skupina 4).
- Pacienti musí mít prospěch z biopsie lymfatických uzlin při diagnóze.
- Pacienty musí sledovat člen FILO (Francouzská organizace pro inovativní leukemii).
- Histologie difuzního velkého B-lymfomu nebo Hodgkinova histologie.
- Dostupné vhodné klinické údaje.
- Vzorky musí splňovat následující požadavek: RIN (Číslo integrity RNA) > 5 a DIN (Číslo integrity DNA) > 6,5.
Kritéria vyloučení:
• Vzorky, které nesplňují kritéria pro zařazení (nedostatečná klinická data, analýza není možná z důvodu nedostatečné kvality vzorku).
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Retrospektivní
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Richterův syndrom při diagnóze
pacientů s diagnostikovaným Richterovým syndromem, pro které je k dispozici vhodná biopsie lymfatických uzlin při diagnóze.
|
Retrospektivní biologický průzkum vzorků, včetně průzkumu nádorové DNA.
Charakterizace transkriptomického profilu nádoru.
Charakterizace nádorových proteomických profilů.
|
|
Primitivní difúzní velký B-buněčný lymfom
pacientů s diagnostikovaným primitivním velkým B-lymfomem, pro které je při diagnóze k dispozici vhodná biopsie lymfatických uzlin.
|
Retrospektivní biologický průzkum vzorků, včetně průzkumu nádorové DNA.
Charakterizace transkriptomického profilu nádoru.
Charakterizace nádorových proteomických profilů.
|
|
Jiný sekundární difuzní velký B-buněčný lymfom
pacientů s diagnózou sekundárního velkého B-buněčného lymfomu (odlišného od Richterova syndromu), pro které je k dispozici vhodná biopsie lymfatických uzlin při diagnóze.
|
Retrospektivní biologický průzkum vzorků, včetně průzkumu nádorové DNA.
Charakterizace transkriptomického profilu nádoru.
Charakterizace nádorových proteomických profilů.
|
|
Kontrolní skupina bez nádorového postižení lymfatických uzlin
pacientů, u kterých byla provedena diagnostická biopsie lymfatických uzlin, která neprokázala žádné nádorové postižení lymfatických uzlin.
|
Retrospektivní biologický průzkum vzorků, včetně průzkumu nádorové DNA.
Charakterizace transkriptomického profilu nádoru.
Charakterizace nádorových proteomických profilů.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Celá exomová sekvenační data využívající metodu sekvenování nové generace
Časové okno: 3 roky
|
Porovnání sekvencí DNA ze vzorků Richterova syndromu a sekvencí DNA z primitivních vzorků DLBCL k identifikaci sady mutací, které jsou specifické pro Richterův syndrom. Pro každou pozici je výsledek "mutovaný" nebo "nemutovaný". |
3 roky
|
|
Data sekvenování RNA pomocí metody sekvenování nové generace
Časové okno: 3 roky
|
Měření genové exprese pro všechny geny. Porovnání těchto úrovní exprese mezi vzorky Richter, primitivními vzorky DLBCL a normálními lymfatickými uzlinami k identifikaci sady genů, jejichž úrovně exprese jsou ve vzorcích Richter odlišné, ve srovnání s primitivními DLBCL a normálními lymfatickými uzlinami. Genová exprese je kvantitativní hodnota. Tato sada genů tvoří specifický „transkriptomický podpis“ Richterova syndromu. |
3 roky
|
|
Proteomická analýza pomocí hmotnostní spektrometrie
Časové okno: 3 roky
|
Hmotnostní spektrometrie umožňuje identifikaci a měření úrovně exprese 5000 nejvíce exprimovaných proteinů ve vzorku. Výzkumníci chtějí porovnat hladiny proteinové exprese mezi Richterovými vzorky, primitivními DLBCL vzorky a normálními lymfatickými uzlinami, aby identifikovali sadu proteinů, které jsou vysoce exprimovány ve vzorcích Richter (ale ne v primitivních DLBCL nebo normálních lymfatických uzlinách). Tato sada proteinů tvoří specifický Richterův „proteomický podpis“. Proteinová exprese je kvantitativní hodnota vyjádřená jako absolutní počet kopií v buňce. |
3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Julien Broseus, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
- Ředitel studie: Pierre Feugier, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Rossi D, Spina V, Forconi F, Capello D, Fangazio M, Rasi S, Martini M, Gattei V, Ramponi A, Larocca LM, Bertoni F, Gaidano G. Molecular history of Richter syndrome: origin from a cell already present at the time of chronic lymphocytic leukemia diagnosis. Int J Cancer. 2012 Jun 15;130(12):3006-10. doi: 10.1002/ijc.26322. Epub 2011 Aug 25.
- Ferreira PG, Jares P, Rico D, Gomez-Lopez G, Martinez-Trillos A, Villamor N, Ecker S, Gonzalez-Perez A, Knowles DG, Monlong J, Johnson R, Quesada V, Djebali S, Papasaikas P, Lopez-Guerra M, Colomer D, Royo C, Cazorla M, Pinyol M, Clot G, Aymerich M, Rozman M, Kulis M, Tamborero D, Gouin A, Blanc J, Gut M, Gut I, Puente XS, Pisano DG, Martin-Subero JI, Lopez-Bigas N, Lopez-Guillermo A, Valencia A, Lopez-Otin C, Campo E, Guigo R. Transcriptome characterization by RNA sequencing identifies a major molecular and clinical subdivision in chronic lymphocytic leukemia. Genome Res. 2014 Feb;24(2):212-26. doi: 10.1101/gr.152132.112. Epub 2013 Nov 21.
- Rossi D, Cerri M, Capello D, Deambrogi C, Rossi FM, Zucchetto A, De Paoli L, Cresta S, Rasi S, Spina V, Franceschetti S, Lunghi M, Vendramin C, Bomben R, Ramponi A, Monga G, Conconi A, Magnani C, Gattei V, Gaidano G. Biological and clinical risk factors of chronic lymphocytic leukaemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2008 Jun;142(2):202-15. doi: 10.1111/j.1365-2141.2008.07166.x. Epub 2008 May 19.
- Parikh SA, Rabe KG, Call TG, Zent CS, Habermann TM, Ding W, Leis JF, Schwager SM, Hanson CA, Macon WR, Kay NE, Slager SL, Shanafelt TD. Diffuse large B-cell lymphoma (Richter syndrome) in patients with chronic lymphocytic leukaemia (CLL): a cohort study of newly diagnosed patients. Br J Haematol. 2013 Sep;162(6):774-82. doi: 10.1111/bjh.12458. Epub 2013 Jul 11.
- Rossi D, Spina V, Deambrogi C, Rasi S, Laurenti L, Stamatopoulos K, Arcaini L, Lucioni M, Rocque GB, Xu-Monette ZY, Visco C, Chang J, Chigrinova E, Forconi F, Marasca R, Besson C, Papadaki T, Paulli M, Larocca LM, Pileri SA, Gattei V, Bertoni F, Foa R, Young KH, Gaidano G. The genetics of Richter syndrome reveals disease heterogeneity and predicts survival after transformation. Blood. 2011 Mar 24;117(12):3391-401. doi: 10.1182/blood-2010-09-302174. Epub 2011 Jan 25.
- Fangazio M, De Paoli L, Rossi D, Gaidano G. Predictive markers and driving factors behind Richter syndrome development. Expert Rev Anticancer Ther. 2011 Mar;11(3):433-42. doi: 10.1586/era.10.237.
- Rossi D, Rasi S, Spina V, Fangazio M, Monti S, Greco M, Ciardullo C, Fama R, Cresta S, Bruscaggin A, Laurenti L, Martini M, Musto P, Forconi F, Marasca R, Larocca LM, Foa R, Gaidano G. Different impact of NOTCH1 and SF3B1 mutations on the risk of chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2012 Aug;158(3):426-9. doi: 10.1111/j.1365-2141.2012.09155.x. Epub 2012 May 10. No abstract available.
- Fabbri G, Rasi S, Rossi D, Trifonov V, Khiabanian H, Ma J, Grunn A, Fangazio M, Capello D, Monti S, Cresta S, Gargiulo E, Forconi F, Guarini A, Arcaini L, Paulli M, Laurenti L, Larocca LM, Marasca R, Gattei V, Oscier D, Bertoni F, Mullighan CG, Foa R, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R, Gaidano G. Analysis of the chronic lymphocytic leukemia coding genome: role of NOTCH1 mutational activation. J Exp Med. 2011 Jul 4;208(7):1389-401. doi: 10.1084/jem.20110921. Epub 2011 Jun 13.
- Chigrinova E, Rinaldi A, Kwee I, Rossi D, Rancoita PM, Strefford JC, Oscier D, Stamatopoulos K, Papadaki T, Berger F, Young KH, Murray F, Rosenquist R, Greiner TC, Chan WC, Orlandi EM, Lucioni M, Marasca R, Inghirami G, Ladetto M, Forconi F, Cogliatti S, Votavova H, Swerdlow SH, Stilgenbauer S, Piris MA, Matolcsy A, Spagnolo D, Nikitin E, Zamo A, Gattei V, Bhagat G, Ott G, Zucca E, Gaidano G, Bertoni F. Two main genetic pathways lead to the transformation of chronic lymphocytic leukemia to Richter syndrome. Blood. 2013 Oct 10;122(15):2673-82. doi: 10.1182/blood-2013-03-489518. Epub 2013 Sep 4.
- Scandurra M, Rossi D, Deambrogi C, Rancoita PM, Chigrinova E, Mian M, Cerri M, Rasi S, Sozzi E, Forconi F, Ponzoni M, Moreno SM, Piris MA, Inghirami G, Zucca E, Gattei V, Rinaldi A, Kwee I, Gaidano G, Bertoni F. Genomic profiling of Richter's syndrome: recurrent lesions and differences with de novo diffuse large B-cell lymphomas. Hematol Oncol. 2010 Jun;28(2):62-7. doi: 10.1002/hon.932.
- Fabbri G, Khiabanian H, Holmes AB, Wang J, Messina M, Mullighan CG, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R. Genetic lesions associated with chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. J Exp Med. 2013 Oct 21;210(11):2273-88. doi: 10.1084/jem.20131448. Epub 2013 Oct 14.
- Alizadeh AA, Eisen MB, Davis RE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI, Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J Jr, Lu L, Lewis DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner TC, Weisenburger DD, Armitage JO, Warnke R, Levy R, Wilson W, Grever MR, Byrd JC, Botstein D, Brown PO, Staudt LM. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling. Nature. 2000 Feb 3;403(6769):503-11. doi: 10.1038/35000501.
- Moulin C, Guillemin F, Remen T, Bouclet F, Hergalant S, Quinquenel A, Dartigeas C, Tausch E, Lazarian G, Blanchet O, Lomazzi S, Chapiro E, Schneider C, Nguyen-Khac F, Davi F, Hunault M, Tomowiak C, Roos-Weil D, Siebert R, Thieblemont C, Cymbalista F, Laribi K, Bene MC, Stilgenbauer S, Guieze R, Feugier P, Broseus J. Clinical, biological, and molecular genetic features of Richter syndrome and prognostic significance: A study of the French Innovative Leukemia Organization. Am J Hematol. 2021 Sep 1;96(9):E311-E314. doi: 10.1002/ajh.26239. Epub 2021 Jun 2. No abstract available.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
6. září 2017
Primární dokončení (Očekávaný)
31. prosince 2023
Dokončení studie (Očekávaný)
5. září 2024
Termíny zápisu do studia
První předloženo
19. července 2018
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
2. srpna 2018
První zveřejněno (Aktuální)
8. srpna 2018
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
24. března 2023
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
23. března 2023
Naposledy ověřeno
1. března 2023
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 2017-A01978-45
- PSS2017/CGPSR-BROSÉUS/VS (Jiný identifikátor: CHRU Nancy)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .