Badanie genomiczne i proteomiczne zespołu Richtera (CGPSR) (CGPSR)
23 marca 2023 zaktualizowane przez: Central Hospital, Nancy, France
Badanie genomiczne i proteomiczne zespołu Richtera
Biologiczne badanie zespołu Richtera (RS), agresywnego chłoniaka wywodzącego się z przewlekłej białaczki limfocytowej (CLL). RS ma takie same cechy histologiczne jak prymitywny chłoniak rozlany z dużych komórek B (DLBCL), ale wiąże się ze złym rokowaniem ze względu na chemorefrakcyjność.
Niniejsze badanie ma na celu zrozumienie biologicznych uwarunkowań oporności na chemioterapię w zespole Richtera.
Przegląd badań
Status
Rekrutacyjny
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Z pomocą Francuskiej Narodowej Grupy Badawczej ds. CLL (FILO / French Innovative Leukemia Organization) badacze zbierają obecnie granulki świeżo mrożonych komórek na etapie CLL oraz biopsje węzłów chłonnych na etapie Richtera. Badacze zebrali również biopsje węzłów chłonnych z DLBCL, jako grupę odniesienia.
Badacze przeprowadzą genomiczne i proteomiczne badania porównawcze między CLL a Richterem, a także między Richterem a prymitywnym DLBCL, aby zrozumieć biologiczne uwarunkowania ewolucji klonalnej i chemorefrakcji zespołu Richtera.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Oczekiwany)
170
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Julien Broseus, MD, PhD
- Numer telefonu: + 33 (0)3 83 15 49 14
- E-mail: j.broseus@chru-nancy.fr
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Véronique Saunier
- Numer telefonu: + 33 (0)3 83 15 54 58
- E-mail: v.saunier@chru-nancy.fr
Lokalizacje studiów
-
-
-
Nancy, Francja, 54035
- Rekrutacyjny
- CHRU de Nancy
-
Kontakt:
- Véronique SAUNIER
- Numer telefonu: +33 (0)3 83 15 54 58
- E-mail: v.saunier@chru-nancy.fr
-
Główny śledczy:
- Julien Broséus, MD, PhD
-
Pod-śledczy:
- Pierre Feugier, MD, PhD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Płeć kwalifikująca się do nauki
Wszystko
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
- Rozpoznanie rozlanego chłoniaka z dużych komórek B powstającego w kontekście przewlekłej białaczki limfocytowej (grupa 1).
- Rozpoznanie de novo rozlanego chłoniaka z dużych komórek B (grupa 2).
- Rozpoznanie rozlanego chłoniaka z dużych komórek B na tle chłoniaka drobnokomórkowego z wyłączeniem PBL (grupa 3).
- Pacjenci, którzy odnieśli korzyść z diagnostycznej biopsji węzłów chłonnych, która nie wykazała zajęcia guza (prymitywnego lub przerzutowego) (grupa 4).
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Rozpoznanie rozlanego chłoniaka z dużych komórek B w przebiegu przewlekłej białaczki limfocytowej (grupa 1) lub rozpoznanie pierwotnego chłoniaka rozlanego z dużych komórek B (grupa 2) lub rozpoznanie rozlanego chłoniaka z dużych komórek B w przebiegu w kontekście chłoniaka drobnokomórkowego, z wyłączeniem PBL (grupa 3) lub skorzystać z diagnostycznej biopsji węzłów chłonnych, która nie wykazała zajęcia guza (prymitywnego lub przerzutowego) (grupa 4).
- Pacjenci muszą skorzystać z biopsji węzłów chłonnych w momencie rozpoznania.
- Pacjenci muszą być obserwowani przez członka FILO (Francuska Innowacyjna Organizacja ds. Białaczki).
- Histologia rozlanego chłoniaka z dużych komórek B lub histologia Hodgkina.
- Dostępne odpowiednie dane kliniczne.
- Próbki muszą spełniać następujące wymagania: RIN (liczba integralności RNA) > 5 i DIN (liczba integralności DNA) > 6,5.
Kryteria wyłączenia:
• Próbki, które nie spełniają kryteriów włączenia (niewystarczające dane kliniczne, analiza niemożliwa z powodu niewystarczającej jakości próbki).
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Z mocą wsteczną
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Zespół Richtera w chwili rozpoznania
pacjentów z rozpoznaniem zespołu Richtera, dla których dostępna jest odpowiednia biopsja węzłów chłonnych w chwili rozpoznania.
|
Retrospektywna biologiczna eksploracja próbek, w tym eksploracja DNA guza.
Charakterystyka profilu transkryptomicznego guza.
Charakterystyka profili proteomicznych nowotworów.
|
|
Pierwotny rozlany chłoniak z dużych komórek B
pacjentów z rozpoznaniem prymitywnego chłoniaka z dużych komórek B, dla których dostępna jest odpowiednia biopsja węzłów chłonnych w chwili rozpoznania.
|
Retrospektywna biologiczna eksploracja próbek, w tym eksploracja DNA guza.
Charakterystyka profilu transkryptomicznego guza.
Charakterystyka profili proteomicznych nowotworów.
|
|
Inny wtórny chłoniak rozlany z dużych komórek B
pacjentów, u których zdiagnozowano wtórnego chłoniaka z dużych komórek B (innego niż zespół Richtera), u których dostępna jest odpowiednia biopsja węzłów chłonnych w momencie rozpoznania.
|
Retrospektywna biologiczna eksploracja próbek, w tym eksploracja DNA guza.
Charakterystyka profilu transkryptomicznego guza.
Charakterystyka profili proteomicznych nowotworów.
|
|
Grupa kontrolna bez zajęcia węzłów chłonnych przez nowotwór
pacjentów, u których wykonano diagnostyczną biopsję węzłów chłonnych, która nie wykazała zajęcia węzłów chłonnych nowotworowych.
|
Retrospektywna biologiczna eksploracja próbek, w tym eksploracja DNA guza.
Charakterystyka profilu transkryptomicznego guza.
Charakterystyka profili proteomicznych nowotworów.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Dane sekwencjonowania całego egzomu przy użyciu metody sekwencjonowania nowej generacji
Ramy czasowe: 3 lata
|
Porównanie sekwencji DNA z próbek zespołu Richtera z sekwencjami DNA z prymitywnych próbek DLBCL w celu zidentyfikowania zestawu mutacji specyficznych dla zespołu Richtera. Dla każdej pozycji wynikiem jest „zmutowany” lub „niezmutowany”. |
3 lata
|
|
Dane sekwencjonowania RNA przy użyciu metody sekwencjonowania nowej generacji
Ramy czasowe: 3 lata
|
Pomiar ekspresji genów dla wszystkich genów. Porównanie tych poziomów ekspresji między próbkami Richtera, prymitywnymi próbkami DLBCL i normalnymi węzłami chłonnymi w celu zidentyfikowania zestawu genów, których poziomy ekspresji są różne w próbkach Richtera, porównało prymitywne DLBCL i normalne węzły chłonne. Ekspresja genów jest wartością ilościową. Ten zestaw genów tworzy specyficzną „sygnaturę transkrypcyjną” zespołu Richtera. |
3 lata
|
|
Analiza proteomiczna z wykorzystaniem spektrometrii mas
Ramy czasowe: 3 lata
|
Spektrometria mas umożliwia identyfikację i pomiar poziomu ekspresji 5000 białek o największej ekspresji w próbce. Badacze chcą porównać poziomy ekspresji białek między próbkami Richtera, prymitywnymi próbkami DLBCL i prawidłowymi węzłami chłonnymi, aby zidentyfikować zestaw białek, które są silnie eksprymowane w próbkach Richtera (ale nie w prymitywnych DLBCL lub prawidłowych węzłach chłonnych). Ten zestaw białek tworzy specyficzną „sygnaturę proteomiczną” Richtera. Ekspresja białka jest wartością ilościową wyrażoną jako bezwzględna liczba kopii w komórce. |
3 lata
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Julien Broseus, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
- Dyrektor Studium: Pierre Feugier, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Rossi D, Spina V, Forconi F, Capello D, Fangazio M, Rasi S, Martini M, Gattei V, Ramponi A, Larocca LM, Bertoni F, Gaidano G. Molecular history of Richter syndrome: origin from a cell already present at the time of chronic lymphocytic leukemia diagnosis. Int J Cancer. 2012 Jun 15;130(12):3006-10. doi: 10.1002/ijc.26322. Epub 2011 Aug 25.
- Ferreira PG, Jares P, Rico D, Gomez-Lopez G, Martinez-Trillos A, Villamor N, Ecker S, Gonzalez-Perez A, Knowles DG, Monlong J, Johnson R, Quesada V, Djebali S, Papasaikas P, Lopez-Guerra M, Colomer D, Royo C, Cazorla M, Pinyol M, Clot G, Aymerich M, Rozman M, Kulis M, Tamborero D, Gouin A, Blanc J, Gut M, Gut I, Puente XS, Pisano DG, Martin-Subero JI, Lopez-Bigas N, Lopez-Guillermo A, Valencia A, Lopez-Otin C, Campo E, Guigo R. Transcriptome characterization by RNA sequencing identifies a major molecular and clinical subdivision in chronic lymphocytic leukemia. Genome Res. 2014 Feb;24(2):212-26. doi: 10.1101/gr.152132.112. Epub 2013 Nov 21.
- Rossi D, Cerri M, Capello D, Deambrogi C, Rossi FM, Zucchetto A, De Paoli L, Cresta S, Rasi S, Spina V, Franceschetti S, Lunghi M, Vendramin C, Bomben R, Ramponi A, Monga G, Conconi A, Magnani C, Gattei V, Gaidano G. Biological and clinical risk factors of chronic lymphocytic leukaemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2008 Jun;142(2):202-15. doi: 10.1111/j.1365-2141.2008.07166.x. Epub 2008 May 19.
- Parikh SA, Rabe KG, Call TG, Zent CS, Habermann TM, Ding W, Leis JF, Schwager SM, Hanson CA, Macon WR, Kay NE, Slager SL, Shanafelt TD. Diffuse large B-cell lymphoma (Richter syndrome) in patients with chronic lymphocytic leukaemia (CLL): a cohort study of newly diagnosed patients. Br J Haematol. 2013 Sep;162(6):774-82. doi: 10.1111/bjh.12458. Epub 2013 Jul 11.
- Rossi D, Spina V, Deambrogi C, Rasi S, Laurenti L, Stamatopoulos K, Arcaini L, Lucioni M, Rocque GB, Xu-Monette ZY, Visco C, Chang J, Chigrinova E, Forconi F, Marasca R, Besson C, Papadaki T, Paulli M, Larocca LM, Pileri SA, Gattei V, Bertoni F, Foa R, Young KH, Gaidano G. The genetics of Richter syndrome reveals disease heterogeneity and predicts survival after transformation. Blood. 2011 Mar 24;117(12):3391-401. doi: 10.1182/blood-2010-09-302174. Epub 2011 Jan 25.
- Fangazio M, De Paoli L, Rossi D, Gaidano G. Predictive markers and driving factors behind Richter syndrome development. Expert Rev Anticancer Ther. 2011 Mar;11(3):433-42. doi: 10.1586/era.10.237.
- Rossi D, Rasi S, Spina V, Fangazio M, Monti S, Greco M, Ciardullo C, Fama R, Cresta S, Bruscaggin A, Laurenti L, Martini M, Musto P, Forconi F, Marasca R, Larocca LM, Foa R, Gaidano G. Different impact of NOTCH1 and SF3B1 mutations on the risk of chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2012 Aug;158(3):426-9. doi: 10.1111/j.1365-2141.2012.09155.x. Epub 2012 May 10. No abstract available.
- Fabbri G, Rasi S, Rossi D, Trifonov V, Khiabanian H, Ma J, Grunn A, Fangazio M, Capello D, Monti S, Cresta S, Gargiulo E, Forconi F, Guarini A, Arcaini L, Paulli M, Laurenti L, Larocca LM, Marasca R, Gattei V, Oscier D, Bertoni F, Mullighan CG, Foa R, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R, Gaidano G. Analysis of the chronic lymphocytic leukemia coding genome: role of NOTCH1 mutational activation. J Exp Med. 2011 Jul 4;208(7):1389-401. doi: 10.1084/jem.20110921. Epub 2011 Jun 13.
- Chigrinova E, Rinaldi A, Kwee I, Rossi D, Rancoita PM, Strefford JC, Oscier D, Stamatopoulos K, Papadaki T, Berger F, Young KH, Murray F, Rosenquist R, Greiner TC, Chan WC, Orlandi EM, Lucioni M, Marasca R, Inghirami G, Ladetto M, Forconi F, Cogliatti S, Votavova H, Swerdlow SH, Stilgenbauer S, Piris MA, Matolcsy A, Spagnolo D, Nikitin E, Zamo A, Gattei V, Bhagat G, Ott G, Zucca E, Gaidano G, Bertoni F. Two main genetic pathways lead to the transformation of chronic lymphocytic leukemia to Richter syndrome. Blood. 2013 Oct 10;122(15):2673-82. doi: 10.1182/blood-2013-03-489518. Epub 2013 Sep 4.
- Scandurra M, Rossi D, Deambrogi C, Rancoita PM, Chigrinova E, Mian M, Cerri M, Rasi S, Sozzi E, Forconi F, Ponzoni M, Moreno SM, Piris MA, Inghirami G, Zucca E, Gattei V, Rinaldi A, Kwee I, Gaidano G, Bertoni F. Genomic profiling of Richter's syndrome: recurrent lesions and differences with de novo diffuse large B-cell lymphomas. Hematol Oncol. 2010 Jun;28(2):62-7. doi: 10.1002/hon.932.
- Fabbri G, Khiabanian H, Holmes AB, Wang J, Messina M, Mullighan CG, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R. Genetic lesions associated with chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. J Exp Med. 2013 Oct 21;210(11):2273-88. doi: 10.1084/jem.20131448. Epub 2013 Oct 14.
- Alizadeh AA, Eisen MB, Davis RE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI, Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J Jr, Lu L, Lewis DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner TC, Weisenburger DD, Armitage JO, Warnke R, Levy R, Wilson W, Grever MR, Byrd JC, Botstein D, Brown PO, Staudt LM. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling. Nature. 2000 Feb 3;403(6769):503-11. doi: 10.1038/35000501.
- Moulin C, Guillemin F, Remen T, Bouclet F, Hergalant S, Quinquenel A, Dartigeas C, Tausch E, Lazarian G, Blanchet O, Lomazzi S, Chapiro E, Schneider C, Nguyen-Khac F, Davi F, Hunault M, Tomowiak C, Roos-Weil D, Siebert R, Thieblemont C, Cymbalista F, Laribi K, Bene MC, Stilgenbauer S, Guieze R, Feugier P, Broseus J. Clinical, biological, and molecular genetic features of Richter syndrome and prognostic significance: A study of the French Innovative Leukemia Organization. Am J Hematol. 2021 Sep 1;96(9):E311-E314. doi: 10.1002/ajh.26239. Epub 2021 Jun 2. No abstract available.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
6 września 2017
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
31 grudnia 2023
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
5 września 2024
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
19 lipca 2018
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
2 sierpnia 2018
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
8 sierpnia 2018
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
24 marca 2023
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
23 marca 2023
Ostatnia weryfikacja
1 marca 2023
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2017-A01978-45
- PSS2017/CGPSR-BROSÉUS/VS (Inny identyfikator: CHRU Nancy)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .